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普通牛和瘤牛肝臟和脾臟組織的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究

發(fā)布時間:2020-12-11 14:35
  家牛分為普通牛(Bostaurus)和瘤牛(Bos indicus),二者除了在外形上存在差異外,對于環(huán)境適應(yīng)、生活習(xí)性、抗病力等方面都存在明顯的差異,己有研究證明瘤牛與普通牛相比,對泰勒蟲病和蜱蟲感染有更強(qiáng)的抵抗力,而對錐蟲病的抵抗力方面則較低。而目前關(guān)于普通牛與瘤牛之間抗病力差異的遺傳基礎(chǔ)的相關(guān)研究很少。本文利用蛋白質(zhì)組學(xué)方法來研究普通牛和瘤牛肝臟和脾臟組織的差異蛋白質(zhì)表達(dá)情況,從蛋白質(zhì)組學(xué)水平解析二者間在抗病力方面差異的遺傳基礎(chǔ)。對普通牛和瘤牛肝臟和脾臟組織進(jìn)行了 iTRAQ質(zhì)譜檢測,分別獲得了肝臟、脾臟的蛋白質(zhì)差異表達(dá)譜,以普通牛為參照樣本,肝臟顯著差異蛋白總數(shù)為197個,其中上調(diào)蛋白127個,下調(diào)蛋白70個,脾臟顯著差異蛋白總數(shù)142個,其中上調(diào)蛋白77個,下調(diào)蛋白65個。對顯著差異表達(dá)的蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)肝臟中差異表達(dá)蛋白質(zhì)主要富集的GO條目是羧酸分解過程、有機(jī)酸分解過程、小分子分解過程;脾臟是組蛋白H3-K27三甲基化、核小體選位、受傷反應(yīng),免疫有關(guān)涉及的GO富集條目是免疫響應(yīng)、免疫球蛋白復(fù)合物、免疫球蛋白受體結(jié)合等。肝臟中主要富集的KEGG代謝通路全為代謝類... 

【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

普通牛和瘤牛肝臟和脾臟組織的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究


圖1本研宄目的圖解??

蛋白質(zhì)組學(xué),實(shí)驗(yàn)流程,瘤牛


時將普通牛、瘤牛脾臟和肝臟分別混合為一組進(jìn)行iTRAQ試劑盒標(biāo)記并進(jìn)行試驗(yàn)。??2.2實(shí)驗(yàn)方法??2.2.1?iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)流程(圖2)?? ̄?乂>?^?」??一? ̄??一:?’??圖2.?iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)流程??11??

序列,蛋白質(zhì)鑒定,覆蓋率,序列


kD?(1380),?41-60?KD?(1125),61-80?KD?(543))(圖?3a)。此外,所鑒定的蛋白??質(zhì)具有高的肽覆蓋率,其中21-40的23%顯示出超過6-10的15%的序列覆蓋率??(圖3C)。脾臟中大多數(shù)蛋白質(zhì)的鑒定(74.7%)的分子量范圍在(1-20kD?(660),??21-40kD?(1522),41-60KD?(1259),61-80KD?(683))(圖?3b)。此外,所鑒定的??蛋白質(zhì)具有高的肽覆蓋率,其中21-40的24%顯示出超過6-10的16%的序列覆蓋??率(圖3d)。??18??

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號:2910708

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