近年來,家畜相關(guān)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(livestock-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus,LA-MRSA)在世界各地豬群中廣泛流行,并出現(xiàn)向社區(qū)人群傳播并造成感染的現(xiàn)象,嚴(yán)重威脅公共衛(wèi)生安全。我國養(yǎng)豬存欄量超過世界總量一半,可能代表著世界上最大的LA-MRSA儲庫。然而,相對于歐洲等國家,國內(nèi)豬群LA-MRSA相關(guān)研究比較缺乏,LA-MRSA沿豬肉生產(chǎn)鏈條的流行特征和傳播情況未知,更無法評估養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)對周邊環(huán)境和社區(qū)居民的潛在影響。為明確我國豬肉生產(chǎn)鏈條及其周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)和甲氧西林敏感金黃色葡萄球菌(methicillin-susceptible Stphylococcus aureus,MSSA)流行特征及傳播方式,從山東省某豬肉生產(chǎn)鏈條中養(yǎng)豬場、屠宰場、豬肉銷售市場以及周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)共采集豬及相關(guān)拭子樣品899份、人鼻腔拭子845份、養(yǎng)殖場及屠宰場環(huán)境樣品239份。選擇性培養(yǎng)基結(jié)合飛行時間質(zhì)譜等方法從1983份樣品中共分離鑒定出MRSA223株、MSSA199株。沿豬肉生產(chǎn)鏈條,MRSA可從養(yǎng)殖場中豬群(49.0%,146/298)、養(yǎng)殖工作人員(64.3%,9/14)及環(huán)境樣本(15.5%,33/213),屠宰場中肥豬(8.2%,7/85)、環(huán)境樣本(3.8%,1/26)、豬胴體(1.0%,1/98)以及豬肉銷售市場中豬肉樣品(14.3%,2/14)中檢出,屠宰加工人員及豬肉銷售人員未檢出攜帶有MRSA。周邊城鎮(zhèn)社區(qū)居民(6.8%,4/59)、農(nóng)村社區(qū)人群(1.7%,13/753)以及豬群(1.7%,7/404)也檢出攜帶有MRSA。spa分型結(jié)果顯示不同環(huán)節(jié)MRSA分離株主要流行克隆為t899(92.8%,207/223),而MSSA分離株主要由t034(35.2%,70/199)、t899(12.6%,25/199)等構(gòu)成。所有MRSA分離株對頭孢西丁、紅霉素、克林霉素、慶大霉素表現(xiàn)出較高的耐藥率(50%),此外,豬相關(guān)MRSA分離株還表現(xiàn)出對氟苯尼考、泰妙菌素、四環(huán)素等抗菌藥物較高的耐藥率。農(nóng)村社區(qū)人群及豬群MRSA分離株除對替加環(huán)素表現(xiàn)出較高的耐藥率(人,46.2%,6/13;豬,85.7%,6/7)之外,對利奈唑胺的最低抑菌濃度值多數(shù)(人,84.6%,11/13;豬,85.7%,6/7)處于臨界敏感狀態(tài)。進(jìn)一步針對農(nóng)村地區(qū)豬群以及雞、狗、貓等其他動物耐惡唑烷酮類葡萄球菌流行情況的調(diào)查顯示,optrA、cfr陽性葡萄球菌存在于絕大多數(shù)所檢測村莊(11/12),在農(nóng)村地區(qū)動物源葡萄球菌中的檢出率較高(cfr,8.7%;optrA,9.7%),對optrA、cfr陽性葡萄球菌耐藥表型、耐藥基因型及optrA、cfr基因環(huán)境的分析顯示,酰胺醇類以及大環(huán)內(nèi)酯類藥物的使用對optrA、cfr基因的共同篩選可能是造成農(nóng)村社區(qū)動物源耐惡唑烷酮類葡萄球菌流行的原因。為進(jìn)一步明確我國豬肉生產(chǎn)鏈條及其周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)MRSA、MSSA流行特征、傳播方式及基因組遺傳特征,對92株MRSA、36株MSSA代表株進(jìn)行了全基因組測序及生物信息學(xué)分析。結(jié)果顯示豬肉生產(chǎn)鏈各環(huán)節(jié)及其周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)MRSA主要流行克隆各異,養(yǎng)殖場為ST3597-t899、屠宰場為ST9-t899、周邊城鎮(zhèn)居民為ST59-t437、農(nóng)村社區(qū)人群為ST9-t899/ST59-t437、農(nóng)村社區(qū)豬群為ST9-t899。其中MRSA ST3597為新型MRSA ST9變體。此外,所調(diào)查屠宰場中還檢測出LA-MRSA ST398。核心基因組SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)進(jìn)化樹分析顯示,LA-MRSA CC9不僅可以沿產(chǎn)業(yè)鏈傳播并污染最終肉產(chǎn)品,還可污染養(yǎng)殖工作人員及養(yǎng)殖場環(huán)境,但對屠宰加工人員及屠宰場環(huán)境污染較輕,豬肉生產(chǎn)鏈條中LA-MRSA CC9未檢測出向周邊城鎮(zhèn)社區(qū)傳播的現(xiàn)象。
【學(xué)位單位】：中國農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類】：S852.611
【部分圖文】：

豬肉生產(chǎn)鏈及其周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)所有ＭＲＳＡ、ＭＳＳＡ分離株ｓｐａ分型結(jié)果見表２－７。結(jié)合分??離株來源信息建立的基于分型的最小生成樹分別展示了所有分離株、人源、豬源分離株的種群??結(jié)構(gòu)和菌株間親緣關(guān)系，見圖２－３。??豬肉生產(chǎn)鏈及其周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)各環(huán)節(jié)中２２３株ＭＲＳＡ分離株、丨９９株ＭＳＳＡ分離株一共??由５１個５／＾型別構(gòu)成，其中［＾１５８八菌株（４７１＾（３型）相對１＾１尺５八菌株（４￥〇｜型）更為多樣，見圖??３－ｌａ。所有不同來源ＭＲＳＡ分離株主要流行克隆為ｔ８９９（９２．８％，２０７／２２３），另有少部分菌株屬于ｔ４３７、??ｔ０３４?以及?ｔ３５２７，見圖?３－ｌａ。人源?ＭＲＳＡ?菌株流行克隆為?ｔ８９９?（５３．８％，?１４／２６）、ｔ４３７?（３８．５％，１０／２６）??以及各１株ｔ３５２７和ｔ０３４，見圖３－ｌｂ。然而，豬源ＭＲＳＡ菌株主要流行克隆為ｔ８９９（９８．１％，１５９／１６２），??此外，還有３株ｔ４３７，見圖３－ｌｃ。所有不同源ＭＳＳＡ分離株？ｓｐａ型別主要由ｔ０３４?（３５．２％，?７０／１９９）、??ｔ８９９?（１２．６％，?２５／１９９）、ｔ４５８?（６．０％，?１２／１９９）以及?ｔ００２?（５．０％，?１０／１９９）構(gòu)成，前?４?個逆〇（型別菌株共??占所有ＭＳＳＡ菌株的５８．８％?（１丨７／１９９）。８７株人源ＭＳＳＡ分離株被劃分為４丨個不同ｓｐａ型別（圖３－丨ｂ），??相比之下豬源菌株共有９９株

豬肉生產(chǎn)鏈及周邊城鎮(zhèn)、農(nóng)村社區(qū)各環(huán)節(jié)ＭＲＳＡ、ＭＳＳＡ代表菌株核心基因組進(jìn)化樹可將９２株??ＭＲＳＡ和３６株ＭＳＳＡ菌株劃分為４個分支，與此前鑒定的ＣＣ９?（ＳＴ３５９７和ＳＴ９）、ＳＴ１８８、ＳＴ５９??以及ＳＴ３９８相對應(yīng)，見圖３－ｌａ。豬肉生產(chǎn)鏈條周邊社區(qū)居民所有ＭＲＳＡ和ＭＳＳＡ分離株與豬肉生??產(chǎn)鏈條中各環(huán)節(jié)ＭＲＳＡ、ＭＳＳＡ屬于不同分支，親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，見圖３－２。沿豬肉生產(chǎn)鏈條各環(huán)節(jié)，??存在某些ＭＲＳＡ菌株彼此間具有較近的親緣性。例如，養(yǎng)殖場Ａ豬群ＭＲＳＡ分離株２ＡＹ２７??（ＳＴ３５９７－ｔ８９９）與屠宰場豬群ＭＲＳＡ分離株ＤＹ６７－１?（ＳＴ３５９７－ｔ８９９）親緣關(guān)系高度相近，見圖３－２。??此外，分離自養(yǎng)殖場周邊環(huán)境、養(yǎng)殖工作人員的一些ＭＲＳＡ代表株與豬群ＬＡ－ＭＲＳＡ代表株表現(xiàn)出??較近的親緣關(guān)系。例如，養(yǎng)殖場Ａ工作人員ＭＲＳＡ分離株ＡＢ４?（ＳＴ３５９７－ｔ８９９）與同養(yǎng)殖場中豬源??ＭＲＳＡ分離株ＢＹ２（?ＳＴ３５９７－ｔ８９９）親緣關(guān)系高度相近。在養(yǎng)殖場Ｂ中，工作人員ＭＲＳＡ分離株２ＡＢ６－１??（ＳＴ３５９７－ｔ８９９）同樣與豬源ＭＲＳＡ分離株ＢＹ７８?（ＳＴ３５９７－ｔ８９９）親緣關(guān)系高度相近，見圖３１此??夕卜

株和豬源ＳＴ３９８菌株。??與人相關(guān)菌株相比，豬相關(guān)菌株通常表現(xiàn)出對更多種藥物的耐藥表型（平均值：ＭＲＳＡ，?７．６比??４．４；ＭＳＳＡ，?４．９比３），見圖３－３ｃ。但此兩組菌株間具體耐藥譜略有寒異。豬源ＭＲＳＡ菌株分別表現(xiàn)??出顯著的氟苯尼考、慶大霉素、四環(huán)素、泰妙菌素和環(huán)丙沙星耐藥（／＞＜〇．〇丨，Ｈｓｈｅｒ’ｓｅｘａｃｔｔｅｓｔ），??見圖３－４ｃ。然而，針對紅霉素和克林霉素，人、豬相關(guān)ＭＲＳＡ菌株均夼較島耐藥率，見閣３－４＾??ＭＳＳＡ菌株中，除泰妙菌素耐藥之外，未檢測到其他任何耐藥表型１ｊ人源蘭株和玷源闡株ＺＭ的關(guān)??聯(lián)性
【參考文獻(xiàn)】

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1 WANG Wei;LIU Feng;ZULQARNAIN Baloch;ZHANG Cun Shan;MA Ke;PENG Zi Xin;YAN Shao Fei;HU Yu Jie;GAN Xin;DONG Yin Ping;BAI Yao;LI Feng Qin;YAN Xiao Mei;MA Ai Guo;XU Jin;;Genotypic Characterization of Methicillin-resistant Staphylococcus aureus Isolated from Pigs and Retail Foods in China[J];Biomedical and Environmental Sciences;2017年08期

2 Volker Micheel;Benedikt Hogan;Thomas K?ller;Philipp Warnke;Sabine Crusius;Rebecca Hinz;Ralf Matthias Hagen;Norbert Georg Schwarz;Hagen Frickmann;;Screening agars for MRSA: evaluation of a stepwise diagnostic approach with two different selective agars for the screening for methicillin-resistant Staphylococcus aureus(MRSA)[J];Military Medical Research;2015年04期

本文編號：2862394