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Luminex液相芯片同時(shí)檢測(cè)小鼠3種病毒方法的建立

發(fā)布時(shí)間:2020-10-22 20:08
   仙臺(tái)病毒(Sendai virus, SeV)屬副黏病毒科,副黏病毒屬,為單股負(fù)鏈RNA病毒。SeV唯一的自然宿主是嚙齒類(lèi)動(dòng)物,SeV為清潔級(jí)和SPF(Specific pathogen free, SPF)級(jí)實(shí)驗(yàn)小鼠的必須檢測(cè)項(xiàng)目。小鼠肝炎病毒(Mouse hepatitis virus, MHV)是冠狀病毒科,冠狀病毒屬的正鏈RNA病毒,基因組不分節(jié)段。MHV是清潔級(jí)小鼠必檢項(xiàng)目。呼腸孤病毒3型(Reovirus type 3, Reo-3)屬于呼腸孤病毒科,正呼腸孤病毒屬,是雙股RNA病毒。Reo-3為SPF級(jí)實(shí)驗(yàn)小鼠、大鼠、地鼠、豚鼠的必檢項(xiàng)目。實(shí)驗(yàn)動(dòng)物一旦上述感染病毒,將干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果,影響科學(xué)研究的準(zhǔn)確性。目前,實(shí)驗(yàn)室診斷主要運(yùn)用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(ELISA)等血清學(xué)方法,也可通過(guò)病毒分離方法檢測(cè)。ELISA測(cè)抗體是檢測(cè)病毒最常用的方法,但抗體在感染1-2周后才能出現(xiàn),因此ELISA不適合感染早期的診斷。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction, PCR)和RT-PCR是重要的分子生物學(xué)檢測(cè)方法,具有簡(jiǎn)便快速的特點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于病毒學(xué)、細(xì)菌學(xué)、寄生蟲(chóng)學(xué)檢測(cè)中。Luminex液相芯片技術(shù)是20世紀(jì)90年代興起的新型檢測(cè)技術(shù),它集合了激光技術(shù)、流式細(xì)胞技術(shù)以及微球數(shù)字信號(hào)處理技術(shù)。與傳統(tǒng)的臨床檢測(cè)方法相比,其主要優(yōu)點(diǎn)在于高通量、高敏感、重復(fù)性高、檢測(cè)范圍廣、反應(yīng)速度快,僅需微量樣品即可進(jìn)行檢測(cè)等。Luminex具有兩大核心技術(shù):xMAP(?)技術(shù)和xTAG(?)技術(shù)。xMAP(?)技術(shù)檢測(cè)原理為抗原-抗體反應(yīng),可用于蛋白質(zhì)和核酸的檢測(cè);xTAG(?)技術(shù)能夠測(cè)定若干基因組形式,如基因表達(dá)分析,微RNA分析,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)分析,特定序列的檢測(cè)等。目的:為建立一種能快速檢測(cè)小鼠SeV、MHV、Reo-3等3種病毒的方法。方法:聯(lián)合使用RT-PCR技術(shù)和Luminex液相基因芯片技術(shù),針對(duì)SeV、MHV、Reo-3的保守區(qū)域分別設(shè)計(jì)引物,通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴(kuò)增獲得大小為263bp、152bp和180bp的目的片段;對(duì)引物進(jìn)行修飾,上游引物分別連接一段特定的TAG序列(與微球上的anti-TAG反向互補(bǔ)),下游引物用生物素標(biāo)記。利用修飾過(guò)的引物重新進(jìn)行RT-PCR反應(yīng),產(chǎn)物與微球進(jìn)行雜交,建立小鼠3種病毒的液相基因芯片方法;并評(píng)價(jià)該方法的特異性、靈敏度。分別利用Luminex液相基因芯片和ELISA對(duì)送檢小鼠進(jìn)行檢測(cè),對(duì)比兩種方法的檢出率。結(jié)果:建立的液相基因芯片檢測(cè)方法能快速檢測(cè)小鼠SeV、MHV、Reo-3等3種病毒,且該方法方便快速、特異性好、靈敏度高,病毒檢出率優(yōu)于ELISA。結(jié)論:成功建立了小鼠3種病毒的液相芯片檢測(cè)方法。
【學(xué)位單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2015
【中圖分類(lèi)】:S852.65
【部分圖文】:

序列,技術(shù),微球,液相


得出如下結(jié)論;在敏感性方面,通過(guò)10倍連續(xù)稀釋?zhuān)龋澹值哪0澹遥畏N方法的檢測(cè)敏感性相當(dāng);在準(zhǔn)確性方面,Luminex液相忘片更占優(yōu)勢(shì),液相的區(qū)分陰性結(jié)果和陽(yáng)性結(jié)果的標(biāo)準(zhǔn),誤判率低,如3號(hào)馬在感染后2、4和5d液相芯片的方法檢測(cè)出HeV陽(yáng)性,而巧光定量PCR的判定結(jié)果為陰性或不確定nex液相芯片技術(shù)的應(yīng)用??inex具有兩大核屯、技術(shù);xMAP?技術(shù)和xTAG?技術(shù)。xMAP?技術(shù)利用特定的染些微球上偶聯(lián)有針對(duì)不同待測(cè)物的抗體或者探針,xMAP?技術(shù)可用于蛋白質(zhì)和。xTAG?技術(shù)則使用Luminex專(zhuān)有的TAG標(biāo)簽序列,通過(guò)TAG序列與微球上序列的互補(bǔ)配對(duì)雜交,從而實(shí)現(xiàn)樣本序列同微球的雜交而不需要單獨(dú)設(shè)計(jì)探針。??術(shù)能保證相同的復(fù)性溫度和雜交效率,且有效避免不同檢測(cè)物標(biāo)記的微球之間因此,xTAG?技術(shù)具有xMAP?技術(shù)的優(yōu)勢(shì),但應(yīng)用相對(duì)局限,主要應(yīng)用在多重檢測(cè)方面。??巧?核酸鑒定?

原理圖,原理,液相


Fig3?principle?of?xTAG??4.小結(jié)與展望??在實(shí)驗(yàn)動(dòng)物血清學(xué)檢測(cè)方面,尤其是小鼠、地鼠等體型較小的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物,可采集分離??出的血清數(shù)量少,不能滿足常規(guī)檢測(cè)方法對(duì)多種病原微生物的檢測(cè)所需血清的量。而??Luminex液相芯片僅需要少量的樣本即可同時(shí)對(duì)多種病原微生物進(jìn)行快速、準(zhǔn)確的檢測(cè)。??Luminex液相芯片技術(shù)具有高通量、高精確性的特點(diǎn),可應(yīng)用于多個(gè)指標(biāo)聯(lián)合檢測(cè),在臨??床上已廣泛應(yīng)用于腫瘤標(biāo)志物的檢測(cè)、自身免疫性疾病早期診斷及遺傳性疾病的基因診斷??等方面。當(dāng)然其技術(shù)尚有一些問(wèn)題需要進(jìn)一步解決,比如:Luminex液相芯片不能連續(xù)對(duì)??待測(cè)樣品的濃度進(jìn)行監(jiān)測(cè);不能監(jiān)測(cè)樣品祀序列與微球上探針的結(jié)合情況;此外Luminex??系統(tǒng)是一個(gè)開(kāi)放平臺(tái),PCR產(chǎn)物和所用化學(xué)試劑存在污染實(shí)驗(yàn)室的可能W7^。??Luminex液相芯片在蛋白質(zhì)檢測(cè)方面,CRL進(jìn)行了深入研究,研制出多通路免疫巧光??檢測(cè)方法MFIA的相關(guān)產(chǎn)品,用于大小鼠、豚鼠、兔等實(shí)驗(yàn)動(dòng)物質(zhì)量控制,對(duì)感染早期敏??

引物


對(duì)引物進(jìn)行在線Blast,查看特異性(引物的Standard?Nucleotide?BLAST詳見(jiàn)附錄1)??通過(guò)使用單一病毒cDNA與SeV、MHV、Reo-3等H種病毒的引物分別進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒??應(yīng)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在PC民檢測(cè)中,未檢測(cè)出非特異性產(chǎn)物。結(jié)果如圖5顯示;1-3孔是W?SeV??為模板的RT-PC民結(jié)果;4-6孔是W?MHV為模板的RT-PC艮結(jié)果;7-9孔為W?Reo-3為模??板的民T-PC民結(jié)果。??400?郵—WtefgBBin—盈裝化??300bp?..i:由!.?Ii葡:專(zhuān);甫避離;繼-電??圖5:引物特異化結(jié)果??Fig5?specificity?of?Primer??3.4測(cè)序結(jié)果??取H種病毒的PC民產(chǎn)物非L,用濃度為3%的瓊脂糖凝膠電泳,選擇有條帶的、片段??
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9 ;[J];;年期


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本文編號(hào):2852042

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