血液作為實(shí)現(xiàn)各器官相互交流的結(jié)締組織,聚集了整個(gè)系統(tǒng)的代謝和轉(zhuǎn)錄變異,是確保系統(tǒng)功能之間靈活性聯(lián)絡(luò)的關(guān)鍵,因此血液具備系統(tǒng)地分析奶牛生物學(xué)機(jī)制的潛力。等位基因特異性表達(dá)(ASE)是一種新發(fā)現(xiàn)的遺傳現(xiàn)象,是指在相同位點(diǎn)上兩個(gè)等位基因的表達(dá)水平是有顯著差異。ASE與生物的生產(chǎn)、免疫等多方面密切相關(guān)。對(duì)奶牛全血轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行ASE研究,有助于理解等位基因的特異表達(dá)對(duì)奶牛生產(chǎn)性狀潛在的影響,以期為提高奶牛的生產(chǎn)性能提供理論依據(jù)。本研究旨在利用奶牛血液轉(zhuǎn)錄組RNA-Seq數(shù)據(jù)為研究對(duì)象,揭示奶牛不同組間的ASE,包括高產(chǎn)和低產(chǎn)奶牛、T乳期和泌乳期奶牛、逐漸斷奶前和斷奶后的犢牛三個(gè)方面,主要結(jié)果如下:通過(guò)對(duì)高產(chǎn)奶牛和低產(chǎn)奶牛全血中等位基因特異性表達(dá)的比較得出,高產(chǎn)組特有ASE基因有698個(gè),低產(chǎn)組有377個(gè)。富集分析發(fā)現(xiàn)高產(chǎn)組顯著富集到了STAT蛋白酪氨酸磷酸化正調(diào)控、催產(chǎn)素等通路上,而低產(chǎn)組多數(shù)顯著富集到免疫和疾病相關(guān)的通路。通過(guò)對(duì)干乳期奶牛和泌乳期奶牛全血等位基因特異性表達(dá)的比較得出,干乳組特有ASE基因442個(gè),泌乳組564個(gè)。泌乳組中的PIM1與蛋白修飾有關(guān);COQ2與三酰甘油(TAG)的合成有關(guān);IL1B、BOLA-DQA1與免疫反應(yīng)有關(guān),并且富集分析發(fā)現(xiàn)這些基因主要參與能量代謝通路。而干奶組富集到細(xì)胞老化、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞分裂等通路。通過(guò)對(duì)逐漸斷奶前和斷奶后犢牛全血等位基因特異性表達(dá)的比較發(fā)現(xiàn),斷奶前犢牛組特有ASE基因690個(gè),斷奶后犢牛組784個(gè)。斷奶后犢牛血液特有的ASE基因并未發(fā)現(xiàn)富集到斷奶應(yīng)激引起的免疫和炎癥反應(yīng)等相關(guān)的通路上。而在斷奶前與斷奶后組特有的ASE基因共同富集到了與細(xì)胞加工、細(xì)胞粘附、細(xì)胞分裂增殖、肝組織發(fā)育等與生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)的通路。綜上,ASE在奶牛血液中廣泛存在,反映了等位基因在奶牛不同生理狀態(tài)下,同源染色體表達(dá)量發(fā)生的相應(yīng)改變,為奶牛生產(chǎn)過(guò)程中基因的選擇鑒定提供了一些借鑒。
【學(xué)位單位】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2019
【中圖分類(lèi)】：S823
【部分圖文】：

圖４高產(chǎn)與低產(chǎn)奶牛ＡＳＥ基因所占比例??Ｆｉｇ．４?Ｔｈｅ?ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎ?ｏｆ?ＡＳＥ?ａｌｌｅｌｅｓ?ｉｎ?ｈｉｇｈ?ａｎｄ?ｌｏｗ?ｙｉｅｌｄ?ｃｏｗｓ??

圖５高產(chǎn)與低產(chǎn)奶牛組間ＡＳＥ基因交集??Ｆｉ．５?Ｉｎｔｅｒ－ｒｏｕＡＳＥ?ａｌｌｅｌｅｓ?ｉｎ?ｈｉｈ?ａｎｄ?ｌｏｗｉｅｌｄ?ｃｏｗｓ??

圖１０泌乳期與干乳期奶牛雜合表達(dá)ＳＮＰ的位置分類(lèi)??．ａｎｅｅｒｏｚｏｕａｎｘｒｅＮＰｎａｃａｏｎｎｒｅｒｏｃｗ
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前2條

1 王海偉;鄧蓉;;中國(guó)奶類(lèi)消費(fèi)現(xiàn)狀分析[J];北京農(nóng)學(xué)院學(xué)報(bào);2012年04期

2 吳建勇;楊光圣;;等位基因結(jié)構(gòu)變異及差異表達(dá)研究進(jìn)展[J];華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2006年04期

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1 韓光春;阿爾茲海默病外周血轉(zhuǎn)錄組擾動(dòng)分析和基因組罕見(jiàn)變異關(guān)聯(lián)分析[D];中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所;2014年

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本文編號(hào)：2848755