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豬細(xì)小病毒病原流行病學(xué)調(diào)查及其分離株NS1、VP2序列分析

發(fā)布時(shí)間:2020-08-24 08:41
【摘要】:豬細(xì)小病毒(porcine parvovirus,PPV)被認(rèn)為是導(dǎo)致豬繁殖障礙的主要病原之一,其感染的臨床癥狀表現(xiàn)為SMEDI(stillbirth,mummification,embryonic death and infertility,SMEDI),即死胎,木乃伊,胚胎死亡和不育,為全球養(yǎng)豬業(yè)帶來了較為嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。近年來,陸續(xù)在豬身上鑒定了幾種新型細(xì)小病毒,即PPV2至PPV7。到目前為止,所有的豬細(xì)小病毒,除PPV外,均無其他豬細(xì)小病毒成功分離的報(bào)道。國內(nèi)外對新型PPV主要是對其分子流行病學(xué)、基因序列等方面進(jìn)行研究,對于新型PPV的致病性等方面的研究知之甚少。本研究對上述七種豬細(xì)小病毒在我省的流行情況進(jìn)行了調(diào)研,并對豬細(xì)小病毒陽性樣品進(jìn)行病毒分離,以便進(jìn)一步了解PPV在我省的流行情況及致病性。具體研究內(nèi)容如下:1.PPV病原流行病學(xué)調(diào)查及病毒分離本研究運(yùn)用PCR方法對來自五個(gè)豬場的197份肛門拭子、五個(gè)豬場的197份鼻腔拭子、九個(gè)豬場的389份血清以及2014年-2017年采集的屠宰場育肥豬310份肺臟進(jìn)行PPV的病原流行病學(xué)調(diào)查。結(jié)果發(fā)現(xiàn),肛門拭子中PPV檢出率為2.5%(5/197),鼻腔拭子中PPV檢出率為2.0%(4/197),血清中PPV檢出率為1.0%(4/389),屠宰場育肥豬肺臟中PPV檢出率為22.9%(71/310),說明PPV在糞便、鼻腔分泌物、血清及肺臟組織中均能檢測到,且肺臟中的檢出率極高。對PPV陽性樣品進(jìn)行病毒分離,僅在肺臟中分離到5株P(guān)PV。2.PPV分離株NS1、VP2序列分析從肺臟中分離到的5株P(guān)PV分離株序列大小均為4435bp,分離株之間的核苷酸同源性為99.8%~100%,氨基酸核苷酸同源性在99.8%~100%。PPV NS1基因全長為1989bp,編碼662個(gè)氨基酸,PPV VP2基因全長為1740bp,編碼579個(gè)氨基酸。5株分離株NS1、VP2之間的核苷酸同源性、氨基酸同源性均在為97%以上,證明肺臟中分離得到的分離株非常保守。對比NS1、VP2基因進(jìn)化樹發(fā)現(xiàn),5株分離株與德國分離株親緣性最近。3.新型PPV病原流行病學(xué)調(diào)查及病毒分離本研究運(yùn)用PCR方法對兩個(gè)豬場共154份血清進(jìn)行新型PPV的病原流行病學(xué)調(diào)查。結(jié)果發(fā)現(xiàn),PPV2的檢出率為29.9%(46/154),PPV3的檢出率為14.3%(22/154),PPV4的檢出率為1.9%(3/154),PPV5的檢出率為8.4%(13/154),PPV6的檢出率為44.2%(68/154),PPV7的檢出率為9.1%(14/154)。在血清樣品中,PPV6的檢出率最高,其次為PPV2。大部分新型PPV最早可以在4周齡中檢測到,且新型PPV在育肥豬階段檢出率最高。對新型PPV陽性樣品進(jìn)行病毒分離,未分離到新型PPV。
【學(xué)位授予單位】:湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S858.28
【圖文】:

PCR擴(kuò)增


PPV的PCR擴(kuò)增結(jié)果

特異性檢測,細(xì)胞


00;1:HuN1;2:HuN2;3:HuN3;4:HuN4;5:HuN細(xì)胞陰性對照組;7:陰性對照圖 2-3 PPV 分離株特異性檢測結(jié)果Fig.2-3 The specificity test result of PPV isolation

毒液,細(xì)胞病變,細(xì)胞


A:出現(xiàn)病變 ST 細(xì)胞;B:正常 ST 細(xì)胞圖 2-2 細(xì)小病毒病毒液接種 ST 細(xì)胞產(chǎn)生的細(xì)胞病變-2 Cytopathic effect of ST cell infected with supernatant of a suspected porcine parvovstrain.2 PPV 培養(yǎng)產(chǎn)物的 PCR 檢測

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2802240

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