【摘要】：小反芻獸疫病毒(Peste des Petits Ruminants Virus,PPRV)屬于副黏病毒科(Paramyxoviridae)麻疹病毒屬(Morbillivirus),病毒粒子包含有6種結構蛋白,分別是核衣殼蛋白N、基質蛋白M、融合蛋白F、血凝素蛋白H、磷酸蛋白P和大蛋白L。表位抗原生物信息含量豐富,對疫病的診斷及新型疫苗的研制均具有重要價值,目前PPRV的表位研究多集中在N蛋白及H蛋白。本試驗利用多肽芯片技術,以PPRV Nigeria 75/1毒株為參考序列,選擇PPRV N、M、H、F四種結構蛋白全基因序列,合成多肽片段,利用PPRV陰陽性血清進行抗原表位篩選,并對獲得數(shù)據(jù)進行響應率相關性、穩(wěn)定性、三模式等分析。本研究通過建立的多肽芯片技術,篩選得到39條候選表位多肽,分別為N1、N38、N39、N40、N41、N42、N45、N46、N47、N48、N49、N50、F9~F19、F40、F41、F42、F45、F46、F52、F53、F54、M1、M22、M23、M26、M27、M32、H1、H36、H37。使用R語言軟件,對候選多肽進行排列組合優(yōu)化,得到2組最優(yōu)組合,與金標準(中和試驗)比對,N1,N47,N48,N49,N50,F18,H36組合靈敏度、特異性、準確性均達到92%;N1,N41,F41,H37組合靈敏度、特異性、準確性分別達到80%、91%、86%,該組合為建立PPR多肽芯片抗體檢測技術提供理論支撐。用VNT試驗、c-ELISA試驗及PPRV多肽芯片,對PPR血清抗體消長規(guī)律進行研究,得出N46、N47、N48、N49、F9、F10可為PPR疫苗免疫效果評價方法的建立提供技術支撐。
【學位授予單位】：甘肅農業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：S852.65
【圖文】：

圖 2-1 PPRV 全基因組核苷酸同源性分析，圖中順序與表 2-1 一致Figure 2-1.Analysis of PPRV whole genome nucleotide homology ,the sequence in the figure isthe same as the number in Table 2-12.2 PPRV 全基因組核苷酸系統(tǒng)發(fā)生樹

圖 2-2 小反芻獸疫病毒全基因組系統(tǒng)發(fā)生樹Figure 2-2.The whole genome phylogenetic tree of PPRV由圖 2-2 看見，PPRV Nigeria 75/1 毒株屬于基因Ⅱ型，中國各毒株、印ri 1996 MSD 株、印度 Izatnagar/94 株、印度 India/TN/Gingee/2014 株、印/Delhi/2016/05 株、埃塞俄比亞 Ethiopia 2010 株、摩洛哥 Morocco 2008 株

圖 2-3 PPRV N 蛋白保守性分析Figure 2-3.Conservative Analysis of PPRV Protein N可見，N蛋白變異程度較小。N蛋白在52aa~421aa間保aa~421aa）變異幅度較小，Ⅳ區(qū)（421aa~525aa）變異，該分析結果與文獻報道一致。氨基酸位

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本文編號：2790585