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我國(guó)西北地區(qū)羊布魯氏菌分子流行病學(xué)及抗原表位多肽的篩選

發(fā)布時(shí)間:2020-08-11 08:03
【摘要】:布魯氏菌病(Brucellosis)是由兼性細(xì)胞內(nèi)寄生的布魯氏菌(Brucella)引起的人獸共患烈性傳染病,近年來(lái)在我國(guó)大部分地區(qū)再次流行,引起了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失和公共衛(wèi)生問(wèn)題。本論文旨在分析我國(guó)西北地區(qū)羊布魯氏菌分子流行病學(xué),了解布魯氏菌優(yōu)勢(shì)菌株及其菌株基因特征,追溯流行菌株的來(lái)源和變異情況;根據(jù)流行菌株基因組特征,選擇保守的免疫抗原蛋白,篩選有針對(duì)性的抗原表位多肽。從我國(guó)西北新疆、青海、甘肅和內(nèi)蒙古四省區(qū)一些地區(qū)采集羊和牦牛疑似感染布魯氏菌病流產(chǎn)胎兒的脾臟樣本480份,共分離鑒定布魯氏菌菌株66株,其中馬耳他布魯氏菌3型58株,馬耳他布魯氏菌1型1株,流產(chǎn)布魯氏菌1型2株,流產(chǎn)布魯氏菌3型3株和豬布魯氏菌3型2株;用MLVA和MLST基因分析技術(shù),對(duì)66株布魯氏菌菌株進(jìn)行分子流行病學(xué)研究發(fā)現(xiàn),66株布魯氏菌分離株中包含46個(gè)MLVA16基因型,37株菌株擁有獨(dú)立特有的基因型,有一株為新的基因型(基因型369),其中基因型116(n=49)和ST8(n=53)為優(yōu)勢(shì)的基因型。MLVA16分析66株分離株的亨特-加斯頓多樣化指數(shù)(HGDI)表明,菌株間多樣化水平為0.979;以MLVA11進(jìn)行分子流行病學(xué)分析表明,我國(guó)馬耳他布魯氏菌流行菌株的主要基因型為116,分離株MLVA16的鑒定分析有助于深入了解西北地區(qū)動(dòng)物布魯氏菌病流行情況。首次對(duì)甘肅馬耳他布魯氏菌流行株分析發(fā)現(xiàn),其流行菌株的種類、基因型無(wú)規(guī)律性。分子流行病學(xué)比較表明,人感染布魯氏菌病主要來(lái)源于羊。甘肅慶陽(yáng)地區(qū)2011-2015年間布魯氏菌血清流行情況分析表明,布魯氏菌年流行率在0.04%-4.75%之間,8個(gè)縣區(qū)年均流行率在0%-9.96%之間,布魯氏菌發(fā)病呈現(xiàn)上升趨勢(shì),差異明顯;分離菌株分子流行病學(xué)結(jié)果表明,甘肅慶陽(yáng)地區(qū)羊布魯氏菌不僅有本地區(qū)周圍的優(yōu)勢(shì)流行菌株,而且也存在外來(lái)菌株的混合感染。對(duì)分離于甘肅和青海的2株(羊源和牦牛源各1株)馬耳他布魯氏菌代表株全基因組測(cè)序分析,結(jié)果顯示全基因組相對(duì)保守,長(zhǎng)度為3.3Mb,有兩個(gè)環(huán)狀染色體,但基因組上也存在數(shù)量不等的特異基因。應(yīng)用樹突狀細(xì)胞篩選布魯氏菌種間保守的Omp16和L7/L12免疫蛋白潛在的抗原表位多肽,小鼠免疫評(píng)價(jià)結(jié)果表明omp16-1和L7/L12-4為T細(xì)胞抗原表位多肽,能刺激細(xì)胞和免疫動(dòng)物發(fā)揮細(xì)胞免疫功能;omp16-5能夠與布魯氏菌陽(yáng)性血清發(fā)生強(qiáng)烈反應(yīng),也能發(fā)揮體液免疫功能。總之,我國(guó)西北地區(qū)羊主要流行馬耳他布魯氏菌3型菌株,優(yōu)勢(shì)基因型為116(MLVA11)和ST8(MLST),布魯氏菌菌株主要來(lái)自于東地中海布魯氏菌群,基因組保守度高;應(yīng)用DC能有效的篩選表位多肽抗原,并從Omp16和L7/L12蛋白上獲得了理想的表位多肽。
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S855.12
【圖文】:

傳播路線,布魯氏菌,菌株,省份


圖 1-1 不同省份 600 株布魯氏菌菌株傳播路線圖Fig1-1 The sketch map of the 600 Brucella strains from different provinces in this studye 1 (yellow line): Inner Mongolia, Heilongjiang, Liaoning- Shandong- Hebei- Beijing-Guangdong provincee 2 (green line): Xinjiang, Ningxia, Qinghai-Shanxi-Henan-Zhejiang-Guangxi-Fujian-Hainan provinces. Lick line) Shanxi-Henan-Jiangxi-Guangxi-Yunnan provinces. The size of the blue circle represented the totalber of the isolated strains (in a circle). The sketch map does not represent an administrative map in the legase..2 MLST多位點(diǎn)測(cè)序分型(Multilocus sequencing typing,MLST)最早設(shè)計(jì)用于研究腦膜炎奈瑟Neisseria meningitides)的自然變異,后來(lái)被廣泛的用于多種病原微生物和真核生物的研eng et al., 2011; Momeni et al., 2015),該方法通過(guò)分析同一基因的等位基因核酸序列突到不同種型菌株之間的差異,其選擇分析的序列往往是看家基因?醇一蛟诰曛械拇嬖,但不同菌株間又有極小的差異,通過(guò)測(cè)定看家基因的核苷酸序列,找到變分散于基因組內(nèi)多個(gè)位點(diǎn)的變異情況,形成一種菌株共有的特征,從而將這些基因特組合與菌株進(jìn)化建立起密切關(guān)系。MLST 設(shè)計(jì)往往是通過(guò)比較 GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)菌株看

布魯氏菌,布魯氏菌病,抗原,分子流行病學(xué)研究


通過(guò)抗原刺激活化后,再次移入患者體內(nèi),激活產(chǎn)生特異的殺傷性 C胞(Saito et al., 2017);新型的方法是通過(guò)抗原與 DC 表面受體融合方法原,體內(nèi)免疫后通過(guò) DC 抗原交互提呈能力,活化特異性殺傷 CD8+細(xì)一方面,DC 疫苗的作用往往需要配伍佐劑以增強(qiáng)其功能(Chen et al., 20e, 2014)。研究的目的和意義來(lái),我國(guó)大部分地區(qū)出現(xiàn)布魯氏菌病的再次流行,特別是在西北地區(qū)流采集我國(guó)西北地區(qū)疑似感染布魯氏菌引起流產(chǎn)動(dòng)物樣本,進(jìn)行細(xì)菌分離,全面了解我國(guó)西北地區(qū)布魯氏菌流行的優(yōu)勢(shì)菌株及其菌株特征,追溯異情況,以及分析流行菌株的全基因組特征;根據(jù)我國(guó)布魯氏菌流行選擇廣譜的免疫抗原蛋白為靶標(biāo),進(jìn)行表位多肽抗原的篩選,為布魯氏提供候選高效抗原。此外,通過(guò)我國(guó)動(dòng)物布魯氏菌分子流行病學(xué)研究和的分析,能為布魯氏菌病防控中疫苗的選用提供有效的數(shù)據(jù)支撐。論文見(jiàn)圖 1-2。

樣本采集,布魯氏菌


圖 2-1 樣本采集分別圖Figure2-1. Distribution of samples.2 主要試劑及溶液布魯氏菌血清葡萄糖瓊脂(Brucella serum dextrose agar)和布魯氏(Brucella Medium Base and Brucella Selective Supplement);購(gòu)自LTM布魯氏菌培養(yǎng)基購(gòu)自于每個(gè) BD 公司;布魯氏菌馬血清;無(wú)菌的1 mol/L, pH 7.2);硫化氫(H2S)檢測(cè)試紙(醋酸鉛)、硫堇(thionin, TH))檢測(cè)試紙;生化檢測(cè)用噬菌體(Tbilisi, Tb; Berkeley, Bk2; 和 Weybr異性抗血清由中國(guó)疫病預(yù)防與控制中心提供。DL2000TMDNAMarker、DNA 基因組提取試劑盒試劑盒和 EXTaq 擴(kuò)增酶購(gòu)自寶生物工試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。布魯氏菌血清葡萄糖瓊脂(Brucella serum dextrose agar)成分(1 L胨(Peptone) 10 gb-Lemco’powder 5

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