【摘要】：沙子嶺豬是湖南省優(yōu)良地方品種,其突出特點(diǎn)是肌肉大理石紋明顯,肌內(nèi)脂肪含量可達(dá)3.5-4.5%,且氨基酸含量高且種類豐富,無(wú)DFD肉和PSE肉。本研究以沙子嶺豬和大白豬為研究對(duì)象,利用轉(zhuǎn)錄組及蛋白組的方法探索不同品種間背最長(zhǎng)肌發(fā)育的差異表達(dá)基因,并分析可能影響肉質(zhì)形成的分子機(jī)制,主要研究工作如下：(1)利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)25日齡沙子嶺豬和大白豬的背最長(zhǎng)肌進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,獲得沙子嶺豬Clean reads 29,522,984條,大白豬Clean reads 34,937,710條,將這止匕Clean reads進(jìn)行de nonve拼接后獲得79,320條unigenes,其中可以比對(duì)到NR數(shù)據(jù)庫(kù)的有23,055條,占29.07%；根據(jù)基因表達(dá)量發(fā)現(xiàn)489個(gè)顯著差異表達(dá)基因(Fold Change=2),其中有297個(gè)基因在沙子嶺豬背最長(zhǎng)肌表達(dá)顯著上調(diào),有192個(gè)基因表達(dá)顯著下調(diào)。(2)利用2-DE電泳技術(shù)對(duì)沙子嶺豬與大白豬背最長(zhǎng)肌組織中差異蛋白進(jìn)行分析,共發(fā)現(xiàn)38個(gè)顯著差異蛋白點(diǎn),其中在沙子嶺豬表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn)有27個(gè),大白豬表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn)有11個(gè)；將這些差異蛋白點(diǎn)利用質(zhì)譜技術(shù)MALDI-TOF-TOF/MS進(jìn)行鑒定,共得到23種蛋白對(duì)應(yīng)36個(gè)差異蛋白點(diǎn),GO分析顯示這些差異蛋白參與豬的生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控、能量代謝、細(xì)胞骨架組成等重要過(guò)程。(3) qRT-PCR驗(yàn)證了8個(gè)差異表達(dá)基因在背最長(zhǎng)肌的表達(dá)情況,實(shí)驗(yàn)結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組及2-DE結(jié)果基本一致,說(shuō)明研究結(jié)果可以反映沙子嶺豬與大白豬背最長(zhǎng)肌組織基因的表達(dá)情況。(4)根據(jù)測(cè)序獲得的序列,實(shí)驗(yàn)利用RACE技術(shù)分別克隆了與代謝相關(guān)的基因NR1H4及JAZF1的cDNA全長(zhǎng),并作了生物信息學(xué)分析,利用qRT-PCR技術(shù)比較了這2個(gè)基因在沙子嶺豬及大白豬的背最長(zhǎng)肌、心臟、肝臟、肺臟、脾臟、小腸、盲腸、腿肌、腎臟及胰臟共10種組織的表達(dá)譜；同時(shí)檢測(cè)了沙子嶺豬NR1H4基因及JAZF1基因是否存在SNP位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)在NR1H4基因的3'-UTR區(qū)存在一個(gè)G/A突變位點(diǎn)。
【學(xué)位授予單位】：湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S828
【圖文】：

ａｌ．邋２００２）。逡逑１N２骨骼肌發(fā)育的調(diào)節(jié)逡逑骨骼肌發(fā)育是一個(gè)高度復(fù)雜的調(diào)節(jié)過(guò)程（圖１－１），從化胎期發(fā)育開(kāi)始到成年個(gè)體逡逑骨骼肌的修復(fù)，一些調(diào)節(jié)骨骼肌發(fā)育的基因或基因家族也逐漸被人們所認(rèn)識(shí)。逡逑１N２．１邋Ｐａｘ巧口Ｐａｘ７基因調(diào)節(jié)逡逑Ｐａｘ３和Ｐａｘ７基因是肌祖細(xì)胞重要的兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，Ｐａｘ３基因除了在胚胎期發(fā)育階逡逑段的肌細(xì)胞表達(dá)外也在背神經(jīng)管、神經(jīng)細(xì)胞等組織表達(dá)，如果在胚胎期由于損傷或感逡逑１逡逑

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本文編號(hào)：2781920