粗毛羊和細(xì)毛羊初級毛囊基板發(fā)育期皮膚的轉(zhuǎn)錄組分析
發(fā)布時間:2020-06-25 01:57
【摘要】:羊毛是綿羊皮膚內(nèi)毛囊產(chǎn)生的附屬結(jié)構(gòu),是毛用綿羊的主要經(jīng)濟(jì)產(chǎn)物,羊毛細(xì)度在生產(chǎn)上是衡量毛用綿羊品質(zhì)的主要特征之一。粗毛羊和細(xì)毛羊的毛纖維細(xì)度和長度差異顯著。最明顯的差異表現(xiàn)在由初級毛囊發(fā)育形成的外層羊毛,相關(guān)的比較研究目前鮮有報道。因此研究調(diào)控粗毛羊和細(xì)毛羊初級毛囊發(fā)育的分子網(wǎng)絡(luò),比較并探索皮膚和毛囊早期發(fā)育差異的分子調(diào)控機(jī)制,對于闡述羊毛粗細(xì)差異,改良羊毛品質(zhì),提高羊毛產(chǎn)量和質(zhì)量具有重大的意義,并為毛用綿羊的分子育種提供一定的理論依據(jù)。本研究選取綿羊胚胎特定發(fā)育時期—初級毛囊形態(tài)發(fā)生早期(胚胎期約65天,也稱為初級毛囊基板期),運(yùn)用RNA-seq技術(shù)對粗毛羊和細(xì)毛羊胚胎背部皮膚樣品進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析比較,具體結(jié)果如下:1.在初級毛囊早期發(fā)育時期,粗毛羊和細(xì)毛羊在形態(tài)學(xué)上存在顯著差異比較研究初級毛囊形態(tài)發(fā)生特定時期(初級毛囊基板期)的皮膚形態(tài)學(xué)差異,發(fā)現(xiàn)粗毛羊的皮膚真皮層厚度和毛囊基板橫截面積均大于細(xì)毛羊,且差異顯著。2.粗毛羊和細(xì)毛羊在初級毛囊基板期皮膚形態(tài)學(xué)差異的分子機(jī)制比較研究(1)通過RNA-seq測序,比較分析初級毛囊基板期粗毛羊和細(xì)毛羊背部皮膚樣品的轉(zhuǎn)錄組水平差異,檢測到726個差異表達(dá)的基因。其中在粗毛羊樣品中共計上調(diào)表達(dá)435個基因,下調(diào)表達(dá)291個基因。(2)對差異基因進(jìn)行GO分析,共有498個基因被富集到GO的生物過程、細(xì)胞組分和分子功能三大類,主要與形態(tài)發(fā)生、器官組織發(fā)育及細(xì)胞分化相關(guān)。KEGG pathway分析結(jié)果表明,差異基因主要位于與細(xì)胞形態(tài)、細(xì)胞的發(fā)育和增殖相關(guān)的通路,如“PI3K-Akt信號通路”、“MAPK信號通路”、“Focal adhesion”、“ECM-receptor interaction”、“Wnt信號通路”等。(3)進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),在皮膚內(nèi)表皮、真皮和毛囊真皮凝集體中分別篩選到4個、31個和12個和發(fā)育相關(guān)的差異表達(dá)基因,這些差異表達(dá)的基因主要富集在Wnt、IGF以及FGF信號通路,表明這些基因是參與調(diào)控粗毛羊和細(xì)毛羊早期皮膚形態(tài)學(xué)差異的主要候選基因。(4)選取9個差異表達(dá)的基因做qPCR驗(yàn)證分析,經(jīng)檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)FZD4,FZD9,DKK1,BAMBI基因具有顯著的差異,并且與qPCR驗(yàn)證結(jié)果一致。結(jié)論本研究發(fā)現(xiàn)在胚胎發(fā)育早期,同等時期的粗毛羊與細(xì)毛羊在皮膚厚度和毛囊基板表面積存在顯著差異,轉(zhuǎn)錄組比較分析發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的基因與皮膚真皮層以及毛囊真皮凝集體的發(fā)育高度相關(guān),篩選出相關(guān)候選基因,推測其直接或間接調(diào)控粗、細(xì)毛羊早期發(fā)育的皮膚形態(tài)學(xué)差異。本研究是綿羊初級毛囊發(fā)育相關(guān)分子網(wǎng)絡(luò)的初步探討,希望在運(yùn)用分子育種技術(shù)改良綿羊毛纖維品質(zhì)中提供一定的理論基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S826
【圖文】:
小鼠毛囊發(fā)育和周期生長的模式圖
圖 1-2 綿羊皮膚和毛囊早期發(fā)育模式結(jié)構(gòu)圖。Fig. 1-2 Diagram of early development of wool follicle in embryonic sheep sk基板是初級毛囊早期形成的標(biāo)志性結(jié)構(gòu);逍纬珊螅嫫つw
本文編號:2728691
【學(xué)位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:S826
【圖文】:
小鼠毛囊發(fā)育和周期生長的模式圖
圖 1-2 綿羊皮膚和毛囊早期發(fā)育模式結(jié)構(gòu)圖。Fig. 1-2 Diagram of early development of wool follicle in embryonic sheep sk基板是初級毛囊早期形成的標(biāo)志性結(jié)構(gòu);逍纬珊螅嫫つw
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:2728691
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