【摘要】：禽類顏色性狀是指皮膚及其衍生物呈現(xiàn)的各種顏色,主要包括羽色、膚色、喙色及脛色等,是不同品種的重要表型標(biāo)記,也可作為產(chǎn)品的重要包裝性狀在育種和產(chǎn)品銷售中使用。對禽類顏色性狀控制基因的研究不僅有利于理解皮膚及其衍生物顏色形成的機(jī)理,也能在育種中通過標(biāo)記輔助選擇提高育種效率。鴨顏色性狀研究中對羽色遺傳與控制基因有部分研究,但未見對喙色和蹼色的研究。本研究的目的是尋找控制鴨喙色和蹼色的基因,為此以本課題組構(gòu)建的F2代群體(群體A)為研究材料,通過SNP篩選及關(guān)聯(lián)分析等方法對鴨MITF、FOXP1等5個基因與喙色及蹼色的關(guān)系進(jìn)行研究,并利用不同群體(群體B)對研究結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,主要的研究結(jié)果如下:不同顏色羽毛的HE染色切片顯示在黑羽、麻羽以及白羽毛桿中的確存在黑色素的差異分布。群體A中的家系信息統(tǒng)計(jì)顯示,喙色分離情況與羽色分離情況一致,且相關(guān)性分析顯示羽色和喙色間強(qiáng)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.902,喙色與蹼色強(qiáng)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.803,羽色與蹼色強(qiáng)相關(guān),相關(guān)系數(shù)為0.779。在群體A中,通過PCR-RFLP和卡方列聯(lián)表檢驗(yàn)方法分析并驗(yàn)證了以前課題組研究的4個位于MITF上的SNPs(g.808002CT、g.808890CT、g.820188CT和g.846879GA位點(diǎn))與鴨喙色、蹼色以及羽色的相關(guān)性,結(jié)果顯示,當(dāng)將喙色和蹼色表型分別記錄為非黃色和黃色時,所有突變位點(diǎn)的基因型均和表型呈顯著相關(guān)(P0.001),而羽色也與這四個位點(diǎn)呈顯著相關(guān)(P0.001)。在群體B中,這四個位點(diǎn)的分型及卡方結(jié)果也顯示其與鴨喙色(P0.001)、蹼色(P0.001)及羽色(P0.001)顯著相關(guān),MITF在不同羽毛球中的表達(dá)量檢測結(jié)果顯示其在黑羽毛球中的表達(dá)量顯著高于白羽毛球中的表達(dá)量,但麻鴨毛球中的表達(dá)水平與其他兩種鴨毛球中的表達(dá)量沒有顯著差異。另外,最近有研究表明MITF一個內(nèi)含子上的6.6KB插入片段導(dǎo)致了北京鴨羽毛的白化,但在我們的群體A中,存在部分白羽個體檢測不到該片段的插入,這表明除該插入序列外,可能還有其他位點(diǎn)的變異導(dǎo)致鴨羽毛白化。我們的研究還顯示該片段也與鴨喙色表型(黃色與非黃色)和蹼色表型(黃色與非黃色)存在關(guān)聯(lián)。在FOXP1基因中存在多個與黑色素沉積相關(guān)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(SNPs),我們在群體A中驗(yàn)證了該基因上的12個SNPs,其中有6個突變位點(diǎn)不僅與鴨喙色(P0.001)和蹼色(P0.001)顯著相關(guān),也與鴨羽色(P0.001)顯著相關(guān)(g.350510TC、g.350550AG、g.350677AG、g.351116AG、g.351629CT和g.351769CT),另外初步檢測g.350209TC位點(diǎn)的結(jié)果也顯示其不僅與鴨喙色(P0.05)和蹼色(P0.05)相關(guān),也與羽色(P0.05)相關(guān)。雖然RT-PCR結(jié)果顯示FOXP1在白羽毛球和黑羽毛球中的表達(dá)量無顯著差異,但SNPs關(guān)聯(lián)結(jié)果顯示FOXP1基因可作為鴨喙色、蹼色及羽色的標(biāo)記基因。在FMNL2基因中找到3個與色素沉積相關(guān)的SNPs,其中g(shù).771957GA位點(diǎn)僅與鴨羽色(P0.05)相關(guān),g.767494GA位點(diǎn)僅與鴨蹼色(P0.05)相關(guān),而g.764720AT位點(diǎn)與鴨羽色(P0.05)、喙色(P0.05)和蹼色(P0.05)都無顯著相關(guān),這表明該基因可能與家鴨中黑色素的沉積相關(guān)。對候選基因Nocth2上g.506985TC位點(diǎn)的初步驗(yàn)證顯示其與鴨喙色(P0.05)和蹼色(P0.05)無顯著相關(guān),也與羽色(P0.05)不相關(guān)。在與蹼色色素沉積相關(guān)的AARS基因上發(fā)現(xiàn)了SNPs,初步驗(yàn)證結(jié)果顯示該些位點(diǎn)均與色素沉積無關(guān)。另外,在基因間區(qū)上找到的兩個SNP,僅有g(shù).755429CG(KB742527.1)與鴨喙色(P0.001)、蹼色(P0.001)和羽色(P0.001)均存在顯著相關(guān)。
【學(xué)位授予單位】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：S834
【圖文】：

鴨 MITF 及 Foxp1 等五個基因與喙色、蹼色及羽色的關(guān)聯(lián)研究2 實(shí)驗(yàn)材料與方法.1 實(shí)驗(yàn)材料.1.1 實(shí)驗(yàn)群體在我們以前的研究中，已經(jīng)構(gòu)建了由黑系（黑羽黑喙黑蹼，n = 55）、白系（黑喙黑蹼，n = 55）和櫻桃谷鴨（白羽黃喙黃蹼，n = 110）之間雜交形成的雜交（圖 1）。 F1 代（n = 969）由黑系和櫻桃谷鴨，白系和櫻桃谷鴨雜交產(chǎn)生。（n = 1534）由來自于 F1 代的黑羽、灰羽和白羽個體兩兩雜交產(chǎn)生，該 F2 代是本實(shí)驗(yàn)的主要群體，將其定義為“群體 A”。另外還有由湖北省武漢市農(nóng)業(yè)科提供 44 只黑鴨（黑羽黑喙黑蹼）、52 只白鴨（白羽黑喙黃蹼）和 57 只麻鴨（黃喙黃蹼），這些鴨均為兩年以上的成年鴨，被定義為“群體 B”。

華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019 屆碩士研究生學(xué)位（畢業(yè)）論文3 結(jié)果與分析3.1 不同顏色羽毛切片 HE 染色在光學(xué)顯微鏡下，可以看到在黑羽鴨、麻羽鴨和白羽鴨羽毛毛桿的 HE 染色切片（圖 2）中存在黑色素的差異分布。在白羽鴨羽毛的倒鉤脊結(jié)構(gòu)中幾乎沒有明顯的黑色素分布，而在黑羽鴨和麻羽鴨羽毛中可明顯看到有大量成簇或斑塊的黑色素分布。這些結(jié)果表明不同顏色羽毛中的確存在黑色素的差異分布。A1A2 A3

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3 于美琴;龐有志;趙淑娟;吳勝軍;王占彬;

本文編號：2713950