羊口瘡病毒環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增高效檢測(cè)方法的建立
【圖文】:
LAMP條件優(yōu)化的內(nèi)容包括:Mg2+用量、甜菜堿的用量、BstDNA聚合酶的用量、dNTPs的用量、內(nèi)外引物的濃度、LAMP方法檢測(cè)陽(yáng)性模板反應(yīng)的最佳時(shí)間和最佳溫度這7個(gè)方面。其中,Mg2+(100mmol/L)的用量分別為1.5,2,2.5,3,3.5,4μL;甜菜堿(1mol/L)的用量分別為0,2,3,5,6,7μL;BstDNA聚合酶(8000U/mL)的用量分別為0.5,1,1.5,2,3μL;dNTPs(2.5mmol/L)的用量分別為1,2,3,,4,5,6μL;內(nèi)引物的濃度分別為10,20,40,80μmol/L,外引物的濃度為5μmol/L。通過(guò)上述各自試驗(yàn)的結(jié)果進(jìn)行選擇并組合,選擇最佳LAMP反應(yīng)體系。反應(yīng)時(shí)間分別為30,45,60,90,120min;反應(yīng)溫度分別為59.4,60.6,62.0,63.0,64.0,65.1℃。對(duì)LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析。1.4LAMP顯色法檢測(cè)ORFV將上述優(yōu)化的條件結(jié)果進(jìn)行整合,進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,用500×SYBRGreenⅠ對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行不開(kāi)蓋顯色反應(yīng)。1.5LAMP檢測(cè)ORFV的特異性利用條件優(yōu)化的LAMP,通過(guò)與GPV、SPV、IBRV和BPIV3的DNA檢測(cè)作對(duì)比,對(duì)ORFV檢測(cè)的特異性進(jìn)行試驗(yàn)。1.6LAMP檢測(cè)ORFV的靈敏性梯度稀釋OR-FV陽(yáng)性質(zhì)粒用于LAMP靈敏性檢測(cè),并與傳統(tǒng)的PCR靈敏性
LAMP條件優(yōu)化的內(nèi)容包括:Mg2+用量、甜菜堿的用量、BstDNA聚合酶的用量、dNTPs的用量、內(nèi)外引物的濃度、LAMP方法檢測(cè)陽(yáng)性模板反應(yīng)的最佳時(shí)間和最佳溫度這7個(gè)方面。其中,Mg2+(100mmol/L)的用量分別為1.5,2,2.5,3,3.5,4μL;甜菜堿(1mol/L)的用量分別為0,2,3,5,6,7μL;BstDNA聚合酶(8000U/mL)的用量分別為0.5,1,1.5,2,3μL;dNTPs(2.5mmol/L)的用量分別為1,2,3,4,5,6μL;內(nèi)引物的濃度分別為10,20,40,80μmol/L,外引物的濃度為5μmol/L。通過(guò)上述各自試驗(yàn)的結(jié)果進(jìn)行選擇并組合,選擇最佳LAMP反應(yīng)體系。反應(yīng)時(shí)間分別為30,45,60,90,120min;反應(yīng)溫度分別為59.4,60.6,62.0,63.0,64.0,65.1℃。對(duì)LAMP擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析。1.4LAMP顯色法檢測(cè)ORFV將上述優(yōu)化的條件結(jié)果進(jìn)行整合,進(jìn)行LAMP擴(kuò)增,用500×SYBRGreenⅠ對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行不開(kāi)蓋顯色反應(yīng)。1.5LAMP檢測(cè)ORFV的特異性利用條件優(yōu)化的LAMP,通過(guò)與GPV、SPV、IBRV和BPIV3的DNA檢測(cè)作對(duì)比,對(duì)ORFV檢測(cè)的特異性進(jìn)行試驗(yàn)。1.6LAMP檢測(cè)ORFV的靈敏性梯度稀釋OR-FV陽(yáng)性質(zhì)粒用于LAMP靈敏性檢測(cè),并與傳統(tǒng)的PCR靈敏性
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