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略陽烏雞育種群生長規(guī)律及體重與候選基因間SNP的關聯(lián)分析

發(fā)布時間:2020-05-16 13:07
【摘要】:略陽烏雞又被稱為略陽烏骨雞,是我國特有的一種大型烏雞品種,原產(chǎn)地為陜西省與四川省交界處的漢中市略陽縣秦嶺山脈黑河流域,故又稱“黑河烏雞”,與泰和烏雞、鄖陽烏雞、江山烏雞并稱為中國四大烏雞,同時也是國內(nèi)四大烏雞品種中體型最大的品種雞。對環(huán)境的抗逆性較強,肉質好、藥用價值高,營養(yǎng)豐富,深得當?shù)厝罕娤矏。但?略陽烏雞作為一個地方雞種,由于多年的封閉養(yǎng)殖,未經(jīng)過系統(tǒng)選育,依然處于半馴化狀態(tài),群體平均生長速度和產(chǎn)蛋性能十分低下,群體內(nèi)個體間差異較大,繁殖率和成活率低下,導致養(yǎng)殖成本過高,使得目前的略陽烏雞種群質量不足以滿足產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的需求。中國世界上家雞養(yǎng)殖量最大、消費水平最高的國家之一。幾十年來我國種雞主要依賴于國外進口,導致國產(chǎn)家雞的品種和數(shù)量不斷減少。國際上較發(fā)達的蛋雞和肉雞育種公司經(jīng)長期地兼并和整合,已經(jīng)形成了相對穩(wěn)定的技術壟斷集團。近年來,國內(nèi)外頻頻爆發(fā)致病性禽流感,各國開始實施禽流感封關政策限制進出口,因此,國內(nèi)自主選育本土雞品種工作勢在必行。本研究旨在通過采用Logistic、Gompertz、Bertalanffy三種非線性模型對略陽烏雞P1代和P2代1~10周齡體重數(shù)據(jù)進行生長曲線擬合和分析,擬合略陽烏雞生長曲線,探明其生長發(fā)育規(guī)律以及確切的生長拐點;采用PCR-SSCP標記輔助選擇方法,對5個與生長性能密切相關的候選基因的遺傳多態(tài)進行檢測,對P1代肉用性能與候選位點各基因型進行關聯(lián)分析,篩選與肉用性狀相關的有效選擇位點,并且對所篩選的有效選擇位點在P2代中進行驗證。結果表明:(1)經(jīng)過擬合P1代、P2代、P3代的略陽烏雞生長曲線擬合確定Gompertz模型是本育種群最優(yōu)模型。其拐點周齡在7~8周齡。(2)經(jīng)過比對P1代和P2代的公雞和母雞的生長曲線,P1、P2與P3的周體重觀測值與周增重觀測值曲線,公雞與母雞在5~6周齡生長速度開始發(fā)生分化。(3)通過比較P1、P2與P3的周體重觀測值與周增重觀測值曲線,表明經(jīng)過每一個世代的選育,略陽烏雞的體重的大小和周增重均顯著的提高,育種效果非常顯著。(4)MSTN基因的AA型個體8周齡體重極顯著高于GG型個體(P0.01),GA型個體顯著高于GG型個體(P0.05),GA型個體與AA型個體差異不顯著。(5)KLF7基因的TA型個體8周齡重極顯著高于AA型個體(P0.01),其他基因型個體之間差異不顯著。(6)Smad3基因、FOXO1基因和KPNA3基因擴增片段上各基因型個體之間體重差異均不顯著。綜上所述,Gompertz模型在擬合略陽烏雞生長曲線方面效果最好,略陽烏雞的體重拐點周齡介于7~8周齡之間;略陽烏雞P2代群體生長速度和整齊度均顯著高于P1代,P3代極顯著高于P2代,人工選育效果極顯著。MSTN基因和KLF7基因的突變位點可作為略陽烏雞肉用性狀的有效選擇位點。所有結果為略陽烏雞的高效養(yǎng)殖標準的制定和早期準確選種提供了科學的理論依據(jù)。
【圖文】:

烏雞,略陽


圖 1-1 成年雌(左)雄(右)略陽烏雞Figure 1-1 Adult female (L) male (R) slightly Lueyang black chicken拍攝于略陽縣龍佳烏雞保種場Photo taken at Longjia chicken breeding farm2 略陽烏雞目前的研究現(xiàn)狀陽烏雞作為一個地方雞種,同樣存在許多制約其發(fā)展的問題。在品種選育強度不夠,選育工作系統(tǒng)化和規(guī)范化程度較低,略陽烏雞的生長發(fā)育速度和偏低,群內(nèi)個體間生產(chǎn)潛力差異大,種群疾病凈化不徹底,成活率不高,導本提升,使得目前的略陽烏雞種群質量不足以滿足產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的需求(石富)。亞軍等(2017)通過對略陽烏雞的線粒體 DNA 控制區(qū)測序,構建群體系統(tǒng)現(xiàn),,略陽烏雞在系統(tǒng)進化樹上聚為 4 大分支,故可能具有 4 個母系來源。劉1990)研究發(fā)現(xiàn),略陽烏雞肉中蛋白質含量和總氨基酸含量顯著高于愛拔益陽烏雞雜種雞,而腹脂率極顯著低于后者。并且高水平日糧營養(yǎng)對于生長速略陽烏雞影響較小,因此,可以推測略陽烏雞的肉用性狀主要受基因調(diào)控。

電泳,原理圖,單鏈,多堿


西北農(nóng)林科技大學碩士學位論文較小的試驗中使用。RFLP 方法對 SNP 位點的要求比較嚴格,需要變異制性酶切識別序列,成本較低,適用于大批量地檢驗已知的 SNP 變異。用于檢測單堿基置換、多堿基插入或缺失等變異,檢測結果準確,但是試驗條件的摸索存在一定的要求。1 檢測單鏈構象多態(tài)性(SSCP)分析單核苷酸多態(tài)性(SNP)SCP 檢測是根據(jù)單鏈 DNA 片段內(nèi)堿基發(fā)生改變而使其空間構象相應的發(fā)空間構象的改變,會導致相應的單鏈 DNA 在進行非變性聚丙烯酰ive-PAGE)時受到的阻力發(fā)生改變(Inazuka et al.1997)。因此,可以通過酰胺電泳、變性高效液相色譜法(DHPLC)、毛細管電泳法等方式,將構單鏈 DNA 分離開,進而通過此方法判斷 SNP 類型(Sasaki et al.2001)。
【學位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2019
【分類號】:S831

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10 孫彤彤;維生素C和維生素E對氧化應激種公雞繁殖性能的調(diào)控[D];西北農(nóng)林科技大學;2015年



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