馬立克病病毒miR-M4-5p宿主靶基因cDNA文庫的構建及鑒定
【圖文】:
LLARII,,輕柔混合均勻后用Ω酶標儀(OMGLabtech)測定螢火蟲熒光素酶數(shù)值。最后向每孔加入100μLStopandGloReagent,輕柔混合均勻后,同上測定海腎熒光素酶數(shù)值。最后統(tǒng)計分析海腎熒光素酶/螢火蟲熒光素酶活性比值。2結果2.1miR-M4-5p宿主候選靶基因cDNA文庫的構建將hybrid-PCR產物電泳分析后割膠回收(圖1),連接pMD19-T載體,轉化E.coliJM109后鋪板培M.DNAmarker圖1Hybrid-PCR特異性引物示意圖(A)和hybrid-PCR產物電泳分析(B)Fig.1SchematicofmiR-M4-5phybridprimer(A)andagar-osegelelectrophoresisofPCRproducts(B)352
2)。其中,結合位點在3′-UTR的基因有63個,結合位點在CDS的基因有20個,結合位點在5′-UTR的基因有5個。結合位點在3′-UTR的63個基因中有29個基因的結合位點與miR-M4-5p的種子區(qū)完全互補(包括G:U)。我們優(yōu)先選擇這29個基因進行下一步的DLRA試驗分析。M.DNA相對分子質量標準;1~12.菌液克隆號M.DNAmarker;1-12.Clonenumberofbacterialfluid圖2Hybrid-PCR產物的部分菌液PCR產物電泳分析Fig.2Identificationofparthybrid-PCRproductsbyagarosegelelectrophoresis表2miR-M4-5p靶標文庫候選基因列表Table2PutativetargetmRNAsofmiR-M4-5p編號No.基因Gene結合位置Bindingsite編號No.基因Gene結合位置Bindingsite編號No.基因Gene結合位置Bindingsite1CSNK2A23′-UTR31RAC13′-UTR61PPM1E3′-UTR2PDK33′-UTR32RBM243′-UTR62PCYT1A3′-UTR3PRICKLE13′-UTR33FKBP73′-UTR63SLC12A43′-UTR4SEPT23′-UTR34MARCKS3′-UTR64RPL27CDS5PPFIBP13′-UTR35NDFIP13′-UTR65RPL12CDS6COLA3′-UTR36ST53′-UTR66CCT2C
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