【摘要】：蒙古馬是世界上最古老的馬品種之一,也是我國著名的地方品種,具有抗病、抗寒、耐粗飼等優(yōu)良特性。對我國優(yōu)秀地方品種蒙古馬進行免疫相關(guān)基因的研究,不僅可以進一步了解蒙古馬抗病能力,為揭示蒙占馬抗病力遺傳特性提供理論依據(jù),而且對我國蒙古馬種質(zhì)資源的保護工作起到積極作用。因此,本研究采用RNA-Seq技術(shù)對蒙古馬與純血馬血液進行mRNA和lncRNA測序分析,根據(jù)測序數(shù)據(jù)結(jié)果,篩選出免疫相關(guān)差異表達基因。其次,將篩選出的免疫相關(guān)差異基因在在RNA水平和蛋白水平上進行了表達量分析,得到的結(jié)果如下:1.本研究構(gòu)建了 6個RNA測序文庫共獲得約996 M(million)讀長為150 nt雙末端原始讀段(raw reads),經(jīng)過過濾最終得到882 M高質(zhì)量讀段(Clean Reads),且平均98%的Clean Reads均可以比對到馬參考基因組上。2.6個文庫共鑒定出18783個mRNA,其中1199個mRNA在兩個品種間顯著差異表達(上調(diào)mRNA為460個,下調(diào)mRNA為739個)。兩組文庫顯著富集的GO通路主要參與免疫反應(yīng),包括炎癥反應(yīng)、免疫系統(tǒng)過程、防御反應(yīng)、對刺激的反應(yīng)等。KEGG顯著富集在NF-κB信號通路、TNF信號通路等免疫相關(guān)重要通路。3.6個文庫共鑒定出3473個novel lncRNA,這些novel lncRNA具有外顯子數(shù)少、轉(zhuǎn)錄本長度短和表達豐度低等特性。通過差異表達分析,鑒定出790個lncRNA在兩個品種間存在顯著差異(563個lncRNA上調(diào),227個lncRNA下調(diào))。顯著差異表達lncRNA的靶基因有1062個,其中203個靶基因基因與免疫相關(guān)。KEGG富集分析發(fā)現(xiàn),6條通路達到顯著水平(P0.05),其中富集最多靶基因的通路為病毒感染通路。4.采用qRT-PCR技術(shù)NF-κB通路上的相關(guān)基因在血液、脾臟、肝臟和肺臟組織中的表達進行了分析,結(jié)果表明,選取的8個基因在血液、脾臟和肝臟中的表達量均為蒙古馬低于純血馬;而在肺臟組織上的表達量為蒙古馬高于純血馬。同時,采用Western blot技術(shù)對NF-κB蛋白和IL-1β蛋白在肺臟組織的表達進行了分析,結(jié)果表明,NF-κB蛋白和IL-1β蛋白在肺臟組織上的表達量均為蒙古馬高于純血馬。
【圖文】：

圖１邋ＩｎｃＲＮＡ的分類逡逑Ｆｉｇ．邋１邋Ｔｈｅ邋ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ邋ｏｆ邋ＩｎｃＲＮＡ逡逑

圖２邋ＩｎｃＲＮＡ的作用機制逡逑Ｆｉｇ．２邋Ｔｈｅ邋ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ邋ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ邋ｏｆ邋ＩｎｃＲＮＡ逡逑
【學(xué)位授予單位】：內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2019
【分類號】：S821.2

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前6條

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本文編號：2663985