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白羽番鴨卵巢組織轉(zhuǎn)錄組及產(chǎn)蛋性狀相關(guān)基因關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-04-23 22:35
【摘要】:番鴨原產(chǎn)于中南美洲熱帶地區(qū),引進(jìn)中國(guó)后,主要在我國(guó)南方飼養(yǎng)較多。番鴨是優(yōu)良的肉鴨品種,不僅具有肉質(zhì)好、營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高、肉味鮮美等特點(diǎn),還具有體重大、耐粗飼、飼料轉(zhuǎn)化率高等優(yōu)點(diǎn)。近年來(lái),番鴨養(yǎng)殖逐漸受到重視,其飼養(yǎng)規(guī)模逐年增加,在養(yǎng)禽業(yè)中具有很高經(jīng)濟(jì)價(jià)值。由于番鴨產(chǎn)蛋率低、冬季休產(chǎn)時(shí)間長(zhǎng),并且未經(jīng)過(guò)系統(tǒng)選育,群體產(chǎn)蛋性能差異較大,嚴(yán)重影響了番鴨產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。因此,研究白羽番鴨的產(chǎn)蛋性狀規(guī)律,以及與產(chǎn)蛋性能密切相關(guān)基因的遺傳變異,為白羽番鴨早期科學(xué)選種選育奠定基礎(chǔ)。本研究對(duì)28~51周齡白羽番鴨的產(chǎn)蛋率及累計(jì)產(chǎn)蛋量曲線進(jìn)行擬合分析,揭示白羽番鴨的產(chǎn)蛋規(guī)律,根據(jù)產(chǎn)蛋規(guī)律可調(diào)整飼養(yǎng)方案,充分挖掘其產(chǎn)蛋潛力;對(duì)產(chǎn)蛋高峰期高產(chǎn)和低產(chǎn)白羽番鴨卵巢組織轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,篩選出差異表達(dá)基因(DEGs),并探究DEGs的功能,為白羽番鴨分子育種提供理論依據(jù);對(duì)白羽番鴨產(chǎn)蛋性狀相關(guān)的基因GDF9、TGFB3和MTNR1A的SNP研究,篩選與白羽番鴨產(chǎn)蛋性狀相關(guān)的有效分子標(biāo)記位點(diǎn),為優(yōu)良高產(chǎn)白羽番鴨選種提供理論依據(jù)。研究結(jié)果如下:1.經(jīng)過(guò)擬合白羽番鴨的周產(chǎn)蛋率及累計(jì)產(chǎn)蛋量曲線得出:本育種群白羽番鴨周產(chǎn)蛋率的最佳擬合模型是楊寧模型(y_t=0.913*exp(-0.037*t)/[1+exp(-0.856*(t-3.591))]);本育種群白羽番鴨累積產(chǎn)蛋量的最好擬合模型是Von Bertalanffy模型(y_t=103.384*[1-0.851*exp(-0.099*t)]~3),預(yù)測(cè)的拐點(diǎn)周齡為36.467周。2.通過(guò)對(duì)高產(chǎn)和低產(chǎn)白羽番鴨卵巢組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,篩選出296個(gè)DEGs,與低產(chǎn)白羽番鴨相比,高產(chǎn)白羽番鴨卵巢中有160個(gè)基因上調(diào),136個(gè)基因下調(diào)。133個(gè)DEGs獲得GO功能注釋,富集到492個(gè)GO Term中。DEGs的KEGG顯著富集主要涉及的六個(gè)信號(hào)通路,其中的PI3K-Akt信號(hào)通路與動(dòng)物繁殖有很大關(guān)系。實(shí)時(shí)熒光定量qPCR檢測(cè)DEGs,高產(chǎn)白羽番鴨卵巢中POSTN、COL4A1、SMOC1、CPEB2和C1QTNF3的表達(dá)量相對(duì)于低產(chǎn)白羽番鴨顯著上調(diào)(P0.05),CEBPD表達(dá)量相對(duì)于低產(chǎn)白羽番鴨極顯著上調(diào)(P0.01),MC2R的表達(dá)量相對(duì)于低產(chǎn)白羽番鴨極顯著下調(diào)(P0.01),這與轉(zhuǎn)錄組結(jié)果一致。預(yù)測(cè)篩選出的差異表達(dá)基因POSTN、COL4A1、SMOC1和SDC4在PI3K-Akt信號(hào)通路中調(diào)控卵巢生理功能,預(yù)測(cè)CPEB2、C1QTNF3、CEBPD和MC2R基因的差異表達(dá)影響白羽番鴨卵巢生理功能。3.GDF9基因g.3340814 C/T與白羽番鴨280日齡產(chǎn)蛋數(shù)和300日齡產(chǎn)蛋數(shù)顯著相關(guān)(P0.05),與280日齡體重不相關(guān)(P0.05);GDF9基因g.3341687 G/A與白羽番鴨的280日齡產(chǎn)蛋數(shù)、300日齡產(chǎn)蛋數(shù)和280日齡體重不相關(guān)(P0.05)。TGFB3基因的4個(gè)SNP位點(diǎn)(g.27959496 G/A,g.27965097 G/A,g.27965604 C/T,g.27970706C/T)和MTNR1A基因的2個(gè)SNP位點(diǎn)(g.19463377 G/A,g.19463425 C/T)與白羽番鴨280日齡產(chǎn)蛋數(shù)、300日齡產(chǎn)蛋數(shù)和280日齡體重均不相關(guān)(P0.05)。GDF9基因的多態(tài)位點(diǎn)可以作為白羽番鴨產(chǎn)蛋性狀的有效分子標(biāo)記。
【圖文】:

番鴨,出欄量,水禽,文獻(xiàn)綜述


第一章 文獻(xiàn)綜述第一章 文獻(xiàn)綜述1.1 番鴨概況我國(guó)是世界水禽第一生產(chǎn)和消費(fèi)大國(guó),水禽產(chǎn)業(yè)提供的產(chǎn)品產(chǎn)值達(dá) 1600 億元以上,并且近年來(lái)產(chǎn)值以 10 % 的速度增長(zhǎng),水禽產(chǎn)業(yè)市場(chǎng)前景廣闊(鄭春田等 2018)。蛋鴨養(yǎng)殖作為我國(guó)傳統(tǒng)的家禽產(chǎn)業(yè)發(fā)展很快,年飼養(yǎng)量約 4 億只,鴨蛋年產(chǎn)量約 550萬(wàn)噸,占禽蛋總產(chǎn)量的 15 % ~ 20 %(王曉峰 2017)。鴨肉在世界肉禽業(yè)中的位置僅次于雞肉,據(jù)聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)數(shù)據(jù)表明,2016 年中國(guó)鴨存欄量為 8.25 億只,全年鴨出欄量 22.35 億只,年出欄量占世界總出欄量的 76.03 %。綜上所述,鴨的養(yǎng)殖量及產(chǎn)品需求量都不斷上升,所以針對(duì)于優(yōu)質(zhì)鴨品種的選育尤為重要。

白羽番鴨,產(chǎn)蛋率,曲線擬合


eeksObserved valuesWood ModelMcMillan ModelYang-Ning Mode6 43.15 45.08 45.22 45.207 39.42 42.27 42.83 43.568 37.04 39.50 40.49 41.989 45.47 36.82 38.22 40.450 40.46 34.23 36.04 38.981 29.56 31.74 33.95 37.57由圖 2-1 可知,楊寧模型最能體現(xiàn)白羽番鴨產(chǎn)蛋率曲線,實(shí)際觀測(cè)值在其曲線動(dòng)。白羽番鴨從 28 ~ 33 周齡的產(chǎn)蛋率快速上升,,達(dá)高峰前楊寧模型曲線與實(shí)際曲線最為吻合,伍德模型有一定滯后性。33 周齡產(chǎn)蛋率達(dá)到最高后,由于天氣周產(chǎn)蛋率稍微有所降低,但基本保持在 59 % 以上,持續(xù) 8 周,之后逐漸下降出現(xiàn)兩次產(chǎn)蛋率回升現(xiàn)象,但是整體趨勢(shì)是逐漸下降的,而實(shí)際觀測(cè)值曲線在合曲線上下波動(dòng)范圍較小。綜上所述,楊寧模型對(duì)白羽番鴨的擬合效果最好。
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類(lèi)號(hào)】:S834

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