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大白豬候選基因的多態(tài)性及其與生長性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2020-04-18 14:39
【摘要】:本研究利用高分辨率熔解曲線(high-resolution melting,HRM)分型法檢測了大白豬黑素皮質(zhì)素受體(MC4R)、細胞分裂周期蛋白16(CDC16)、瘦素(LP)、豬生長激素(pGH)、芳香烴受體(AHR)、催乳素受體(PRLR)和3-磷酸肌醇依賴性蛋白激酶-1(PDK1)等七個候選基因的多態(tài)性,并將檢測出的多態(tài)性與大白豬的生長性狀進行了關(guān)聯(lián)性分析。實驗以246頭大白豬為研究對象,利用DNA提取試劑盒提取耳組織DNA,首先對20頭大白豬小群體樣本進行PCR擴增后,通過直接測序法篩選候選基因的多態(tài)性位點,針對發(fā)現(xiàn)的多態(tài)性位點設(shè)計HRM專用引物,利用HRM法對226頭大白豬大群體樣本進行多態(tài)性檢測,將所得結(jié)果與生產(chǎn)數(shù)據(jù)進行關(guān)聯(lián)性分析。結(jié)果表明:在MC4R基因第1外顯子出現(xiàn)2207AG突變位點、CDC16基因第18外顯子出現(xiàn)837TC突變位點、LP基因第2外顯子出現(xiàn)3469TC突變位點、pGH基因第5外顯子出現(xiàn)1856CT和1917CT兩個突變位點、AHR基因第10外顯子出現(xiàn)38332CT突變位點、PRLR基因第8外顯子出現(xiàn)825AG突變位點、PDK1基因第6外顯子出現(xiàn)8881CT突變位點,以上發(fā)現(xiàn)的多態(tài)性位點均存在兩個等位基因,除CDC16基因第18外顯子為2種基因型外,其他位點均可分為3種基因型。χ2適合性檢驗顯示,MC4R基因、CDC16基因和PRLR基因的基因型頻率和等位基因頻率在兩個種群中的分布無顯著性差異,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05);LP基因、pGH基因、AHR基因和PDK1基因的基因型頻率和等位基因頻率在小種群中的分布差異不顯著,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05),但在大種群中,這些基因的基因型頻率和等位基因頻率的分布出現(xiàn)顯著性差異,不符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。根據(jù)多態(tài)信息含量(P/C)分析顯示,MC4R基因、LP基因、pGH基因(1917)、AHR基因和PRLR基因的等位基因在這兩個群體中的分布均處于中度多態(tài)(0.25PIC0.5),而CDC16基因和PDK1基因的等位基因在這兩個群體中的分布屬于低度多態(tài)(PIC0.25),pGH基因(1856)的兩個等位基因在小群體中的分布處于低度多態(tài)(PIC0.25),但在大種群中的分布屬于中度多態(tài)(0.25P/C0.5)。多態(tài)性與生長性狀的關(guān)聯(lián)性分析的結(jié)果表明,MC4R基因?qū)τ隗w重以及日增重具有較為顯著的影響(P0.05),CDC16基因?qū)τ隗w高、體長、出生重、斷奶重、日增重等具有較為顯著的影響(P0.05),LP基因?qū)τ?月齡體長具有較為顯著的影響(P0.05),pGH(1856)基因?qū)τ?0天重以及2月齡重具有較為顯著的影響(P0.05),pGH(1917)基因?qū)τ谒兴鶞y的生長性狀無顯著性影響,AHR基因?qū)τ?月齡體高、6月齡體重和日增重具有較為顯著的影響(P0.05),PRLR基因?qū)τ诔錾亍?0天重、斷奶重、6月齡體重和日增重具有較為顯著的影響(P0.05),PDK1基因?qū)τ?月齡體高具有較為顯著的影響(P0.05)。綜上所述,這7個基因?qū)Υ蟀棕i的生長發(fā)育均具有一定的影響,為后續(xù)大白豬肉質(zhì)性狀與生長性狀的現(xiàn)代分子選育提供一定的參考。
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:S828

【參考文獻】

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本文編號:2632198

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