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大白豬候選基因的多態(tài)性及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-04-18 14:39
【摘要】:本研究利用高分辨率熔解曲線(high-resolution melting,HRM)分型法檢測(cè)了大白豬黑素皮質(zhì)素受體(MC4R)、細(xì)胞分裂周期蛋白16(CDC16)、瘦素(LP)、豬生長(zhǎng)激素(pGH)、芳香烴受體(AHR)、催乳素受體(PRLR)和3-磷酸肌醇依賴性蛋白激酶-1(PDK1)等七個(gè)候選基因的多態(tài)性,并將檢測(cè)出的多態(tài)性與大白豬的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行了關(guān)聯(lián)性分析。實(shí)驗(yàn)以246頭大白豬為研究對(duì)象,利用DNA提取試劑盒提取耳組織DNA,首先對(duì)20頭大白豬小群體樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增后,通過(guò)直接測(cè)序法篩選候選基因的多態(tài)性位點(diǎn),針對(duì)發(fā)現(xiàn)的多態(tài)性位點(diǎn)設(shè)計(jì)HRM專用引物,利用HRM法對(duì)226頭大白豬大群體樣本進(jìn)行多態(tài)性檢測(cè),將所得結(jié)果與生產(chǎn)數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析。結(jié)果表明:在MC4R基因第1外顯子出現(xiàn)2207AG突變位點(diǎn)、CDC16基因第18外顯子出現(xiàn)837TC突變位點(diǎn)、LP基因第2外顯子出現(xiàn)3469TC突變位點(diǎn)、pGH基因第5外顯子出現(xiàn)1856CT和1917CT兩個(gè)突變位點(diǎn)、AHR基因第10外顯子出現(xiàn)38332CT突變位點(diǎn)、PRLR基因第8外顯子出現(xiàn)825AG突變位點(diǎn)、PDK1基因第6外顯子出現(xiàn)8881CT突變位點(diǎn),以上發(fā)現(xiàn)的多態(tài)性位點(diǎn)均存在兩個(gè)等位基因,除CDC16基因第18外顯子為2種基因型外,其他位點(diǎn)均可分為3種基因型。χ2適合性檢驗(yàn)顯示,MC4R基因、CDC16基因和PRLR基因的基因型頻率和等位基因頻率在兩個(gè)種群中的分布無(wú)顯著性差異,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05);LP基因、pGH基因、AHR基因和PDK1基因的基因型頻率和等位基因頻率在小種群中的分布差異不顯著,符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05),但在大種群中,這些基因的基因型頻率和等位基因頻率的分布出現(xiàn)顯著性差異,不符合Hardy-Weinberg平衡定律(P0.05)。根據(jù)多態(tài)信息含量(P/C)分析顯示,MC4R基因、LP基因、pGH基因(1917)、AHR基因和PRLR基因的等位基因在這兩個(gè)群體中的分布均處于中度多態(tài)(0.25PIC0.5),而CDC16基因和PDK1基因的等位基因在這兩個(gè)群體中的分布屬于低度多態(tài)(PIC0.25),pGH基因(1856)的兩個(gè)等位基因在小群體中的分布處于低度多態(tài)(PIC0.25),但在大種群中的分布屬于中度多態(tài)(0.25P/C0.5)。多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀的關(guān)聯(lián)性分析的結(jié)果表明,MC4R基因?qū)τ隗w重以及日增重具有較為顯著的影響(P0.05),CDC16基因?qū)τ隗w高、體長(zhǎng)、出生重、斷奶重、日增重等具有較為顯著的影響(P0.05),LP基因?qū)τ?月齡體長(zhǎng)具有較為顯著的影響(P0.05),pGH(1856)基因?qū)τ?0天重以及2月齡重具有較為顯著的影響(P0.05),pGH(1917)基因?qū)τ谒兴鶞y(cè)的生長(zhǎng)性狀無(wú)顯著性影響,AHR基因?qū)τ?月齡體高、6月齡體重和日增重具有較為顯著的影響(P0.05),PRLR基因?qū)τ诔錾亍?0天重、斷奶重、6月齡體重和日增重具有較為顯著的影響(P0.05),PDK1基因?qū)τ?月齡體高具有較為顯著的影響(P0.05)。綜上所述,這7個(gè)基因?qū)Υ蟀棕i的生長(zhǎng)發(fā)育均具有一定的影響,為后續(xù)大白豬肉質(zhì)性狀與生長(zhǎng)性狀的現(xiàn)代分子選育提供一定的參考。
【學(xué)位授予單位】:延邊大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S828

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2632198

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