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略陽(yáng)烏雞不同生長(zhǎng)時(shí)期脾臟轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及免疫相關(guān)基因篩選

發(fā)布時(shí)間:2020-04-07 18:51
【摘要】:本研究在測(cè)定略陽(yáng)烏雞體重、脾臟重量等生長(zhǎng)性狀及雞脾臟發(fā)育狀況的基礎(chǔ)上,運(yùn)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和生物信息學(xué)分析技術(shù)鑒定差異表達(dá)基因和影響脾臟發(fā)育的關(guān)鍵基因,旨在進(jìn)一步發(fā)掘略陽(yáng)烏雞生長(zhǎng)脾臟發(fā)育與免疫相關(guān)基因及相關(guān)通路,探索其內(nèi)在分子機(jī)制。選取7日齡、30日齡和120日齡且飼養(yǎng)條件相同的略陽(yáng)烏雞各3只。測(cè)量體重和脾臟重量,收集脾臟組織,利用石蠟切片對(duì)脾臟發(fā)育進(jìn)行組織學(xué)分析,利用RNA-seq技術(shù)對(duì)略陽(yáng)烏雞脾臟組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,分析基因表達(dá)模式。主要結(jié)果如下:1.脾臟組織學(xué)觀察:7日齡略陽(yáng)烏雞脾臟T、B淋巴細(xì)胞和淋巴鞘開(kāi)始產(chǎn)生,30日齡略陽(yáng)烏雞脾臟T、B淋巴細(xì)胞數(shù)量和淋巴鞘數(shù)量更多,形態(tài)趨于穩(wěn)定,120日齡略陽(yáng)烏雞脾臟與30日齡相比無(wú)顯著差異。2.轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選差異表達(dá)基因:通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn)7日齡與30日齡相比差異表達(dá)基因340個(gè);30日齡與120日齡相比差異表達(dá)基因174個(gè);7日齡與120日齡相比差異表達(dá)基因1100個(gè)。三組對(duì)比共同差異表達(dá)基因17個(gè)。3.差異表達(dá)基因GO、KEGG分析:7日齡與30日齡差異表達(dá)基因主要富集在外部刺激反應(yīng)、白細(xì)胞遷移、細(xì)胞趨化性、粒細(xì)胞遷移和防御反應(yīng)等與免疫相關(guān)的條目。30日齡與120日齡差異表達(dá)基因主要富集在細(xì)胞趨化作用、白介素-1的調(diào)節(jié)、外部刺激反應(yīng)、細(xì)菌防御反應(yīng)和趨化因子受體結(jié)合等與免疫相關(guān)的條目。7日齡與120日齡差異表達(dá)基因主要富集在細(xì)胞周期、有絲分裂核分裂、染色體的濃縮、著絲粒和紡錘體微管等與細(xì)胞分裂相關(guān)的條目。此外,三組間對(duì)比的差異基因均富集到了造血細(xì)胞譜系信號(hào)通路、神經(jīng)活性配體受體相互作用信號(hào)通路和細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用信號(hào)通路。4.權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析:構(gòu)建了與性狀相關(guān)聯(lián)的權(quán)重基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),篩選出與雞生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)的關(guān)鍵基因有:EVL、FGD3、TNIK、QRICH1、ZYX、TBL1X、IFT80、SF3B1、CEPT1、MYH9、POLH和MICAL1;影響略陽(yáng)烏雞免疫功能的關(guān)鍵基因有:EVL、VAV3、TNIK、NLRC3、IL2RB、RPS25、WBP1L、DDX17、ABHD10、PON2、FANCD2和CD3E。
【圖文】:

烏雞,略陽(yáng),日齡,脾臟


-10-圖 2-2 不同日齡略陽(yáng)烏雞脾臟重量變化規(guī)律ig. 2-2 Changes in spleen weight of Lueyang black-bone chicken at different day-不同日齡略陽(yáng)烏雞脾臟組織學(xué)分析同發(fā)育階段的雞脾臟組織結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,可以將脾臟免疫細(xì)胞的發(fā)育聯(lián)系起來(lái),從而揭示其所蘊(yùn)含的生物學(xué)意義。略陽(yáng)烏雞脾臟石蠟切片圖可知,7 d 雞脾臟有零星淋巴細(xì)胞(藍(lán)色部位),中央動(dòng)脈周圍包裹織。30 d 雞脾臟生發(fā)中心變多變大,,白髓和紅髓的界線更加明顯,橢著大量淋巴細(xì)胞。120 d 雞脾臟動(dòng)脈明顯且數(shù)量變多,生發(fā)中心顯著量也顯著增多。

烏雞,略陽(yáng),石蠟切片,雞脾


從而揭示其所蘊(yùn)含的生物學(xué)意義。略陽(yáng)烏雞脾臟石蠟切片結(jié)果見(jiàn)圖2-3,由圖可知,7 d 雞脾臟有零星淋巴細(xì)胞(藍(lán)色部位),中央動(dòng)脈周圍包裹著一些彌散淋巴組織。30 d 雞脾臟生發(fā)中心變多變大,白髓和紅髓的界線更加明顯,橢球淋巴鞘周圍充斥著大量淋巴細(xì)胞。120 d 雞脾臟動(dòng)脈明顯且數(shù)量變多,生發(fā)中心顯著增大,淋巴細(xì)胞數(shù)量也顯著增多。
【學(xué)位授予單位】:陜西理工大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:S831

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本文編號(hào):2618263

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