【摘要】：驢(Equus asinus)屬奇蹄目(Perissodactyla)、馬科、馬屬。我國(guó)養(yǎng)驢歷史悠久,是世界上主要的產(chǎn)驢國(guó)家之一。驢作為役用家畜,有著耐粗飼、耐力足、抗病性強(qiáng)的特點(diǎn)。其肉、奶、皮都具備較高的營(yíng)養(yǎng)價(jià)值。隨著我國(guó)經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展進(jìn)入新階段,驢產(chǎn)業(yè)已展露出滿足產(chǎn)品消費(fèi)、承載農(nóng)牧循環(huán)、推動(dòng)結(jié)構(gòu)調(diào)整、實(shí)現(xiàn)扶貧脫貧等多種重要功能。夜眼(chestnut)為馬屬動(dòng)物前肢上的角質(zhì)化的真皮組織,可作為驢身份識(shí)別的標(biāo)志物,民間傳說(shuō)其可作為馬屬動(dòng)物夜間行走的“眼睛”;國(guó)外有學(xué)者認(rèn)為它是驢進(jìn)化過(guò)程中保留的一種退化皮組織。驢皮作為阿膠的唯一原材料,目前仍未見(jiàn)驢皮及夜眼組織的轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)水平的研究報(bào)道。本研究以4頭德州驢為研究對(duì)象,分別采集每頭驢前腿的夜眼及周邊的皮膚,分別進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和蛋白組學(xué)測(cè)序,擬從RNA和蛋白質(zhì)水平研究驢皮和夜眼特征表達(dá)基因及蛋白質(zhì)種類,一是為夜眼的功能分析提供數(shù)據(jù)支持;另外也希望鑒定出驢皮基因表達(dá)譜和蛋白表達(dá)譜,通過(guò)和其他家畜皮的基因表達(dá)譜和蛋白表達(dá)譜比較,初步闡述驢皮功效的可能分子基礎(chǔ)。初步研究成果如下:1驢夜眼轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究利用高通量測(cè)序獲得驢夜眼和周邊皮膚的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)并進(jìn)行生物信息學(xué)分析,與參考基因組比對(duì)鑒定出差異表達(dá)基因。結(jié)果如下:共有54158個(gè)基因表達(dá),其中夜眼和皮膚共有的表達(dá)基因?yàn)?5600個(gè);與皮膚比較,在夜眼中顯著性差異表達(dá)基因總數(shù)為10925個(gè),其中下調(diào)表達(dá)基因?yàn)?949個(gè),上調(diào)表達(dá)基因?yàn)?976個(gè)。驢皮特有的表達(dá)基因1267個(gè),夜眼特有的表達(dá)基因1105個(gè)。對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行GO及KEGG pathway富集分析,結(jié)果顯示差異表達(dá)基因主要顯著富集在維生素B6和酪氨酸的分解代謝通路中;夜眼中基因DDC,BCL2的高表達(dá)可能與夜眼表面皮膚顏色較深相關(guān)。2驢夜眼蛋白質(zhì)組學(xué)研究進(jìn)一步通過(guò)i TRAQ技術(shù)對(duì)驢夜眼和周邊皮膚進(jìn)行蛋白組學(xué)的分析,結(jié)果如下:從驢皮和夜眼的肽段圖譜中,一共鑒定到17734條肽段和3851個(gè)蛋白,肽段長(zhǎng)度多數(shù)分布在5-23個(gè)氨基酸(AA)之間。與驢皮相比,夜眼中上調(diào)蛋白為1592個(gè),下調(diào)蛋白為954個(gè)。對(duì)差異蛋白進(jìn)行GO注釋和KEGG pathway功能富集分析,結(jié)果顯示差異蛋白主要富集于77條GO條目和24條代謝通路中,其中夜眼中出現(xiàn)的視黃醇代謝通路可能與視覺(jué)相關(guān)。3驢夜眼轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析為進(jìn)一步研究夜眼及周邊皮膚的差異,更好地闡述驢皮及夜眼差異的分子基礎(chǔ)。我們將驢皮膚、夜眼的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)聯(lián)合進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):兩者差異表達(dá)基因總計(jì)6601個(gè),共有742個(gè)蛋白與轉(zhuǎn)錄組相關(guān)聯(lián),表明夜眼可能是特殊的驢皮組織。進(jìn)一步通過(guò)BLAST比對(duì),確定了驢皮中12個(gè)特征性肽段,其中膠原蛋白GATGPAGVR序列可作為未來(lái)鑒別驢皮阿膠的特征性成分。
【圖文】：

iTRAQ技術(shù)原理圖

圖 1-2 iTRAQ 技術(shù)操作流程Figure 1-2 iTRAQ technical operation process4.3.3 iTRAQ 技術(shù)操作流程
【學(xué)位授予單位】：山東師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號(hào)】：S822

【參考文獻(xiàn)】

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1 相光明;王勇;王春曉;蔣慧;李恒;王蕾;;阿膠糕類食品生產(chǎn)企業(yè)質(zhì)量安全管理探究[J];食品與藥品;2017年01期

2 徐興利;;阿膠產(chǎn)業(yè)欲發(fā)展 掃亂象、重監(jiān)管[J];中國(guó)食品;2016年06期

3 郭中坤;王可洲;籍國(guó)霞;嵇傳良;;阿膠的成分、鑒別方法及藥理作用研究進(jìn)展[J];遼寧中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào);2015年04期

4 胡晶紅;張永清;丁代兄;;我國(guó)阿膠原料動(dòng)物驢的種質(zhì)資源概況[J];中國(guó)現(xiàn)代中藥;2013年05期

5 蔣晶;劉克勇;;阿膠食品行業(yè)的發(fā)展現(xiàn)狀分析及建議[J];黑龍江科技信息;2013年03期

6 陸鑫;;東阿阿膠:引領(lǐng)養(yǎng)驢產(chǎn)業(yè)大革新[J];中國(guó)食品藥品監(jiān)管;2012年11期

7 許兆君;廖想想;托乎提·阿及德;毛永江;楊章平;;我國(guó)家驢遺傳資源現(xiàn)狀分析[J];中國(guó)草食動(dòng)物科學(xué);2012年04期

8 賽力克·庫(kù)魯西;努爾別克·哈木巴太;努爾蘭·木合買提;趙有存;;肉驢生產(chǎn)價(jià)值與肉驢養(yǎng)殖技術(shù)[J];新疆畜牧業(yè);2011年11期

9 吳文盛;王琳;;東阿阿膠產(chǎn)業(yè)集群發(fā)展的優(yōu)劣勢(shì)分析與對(duì)策[J];中外企業(yè)家;2011年07期

10 孫玉江;徐紀(jì)尊;蔣濤;王洪水;;中國(guó)驢種遺傳資源保護(hù)利用研究[J];中國(guó)草食動(dòng)物;2006年06期

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