塞內(nèi)加谷病毒VP1蛋白的表達純化及鑒定
【圖文】:
甌ǖ賴?0株毒株、巴西2株、加拿大CAN-11-55910-3(KC667560)株基因序列的相似性較高,,為94.9%~97.0%,其中與美國US-15-40381IA(KU051393)株的相似性最高,與美國1989年報道的2株、1997年USA-1278(EU271763)株基因序列的相似性也高,為90.4%~92.0%(見表1)。通過對VP1氨基酸序列比對分析發(fā)現(xiàn),從加拿大CAN-11-55910-3(KC667560)株開始,VP1蛋白有11處多肽位點相對穩(wěn)定遺傳(10、57、62、63、93、97、161、172、221、233、239),且地區(qū)差異不大(見表2)。用Gamier-Robson方法、Chou-Fasman方法預(yù)圖1SVA-CH-01-2015VP1基因的PCR擴增Fig.1PCRamplificationofVP1geneofSVA-CH-01-2015M:DNA分子質(zhì)量標準;1~3:SVA-VP1基因的PCR產(chǎn)物;4:陰性對照M:DL2000DNAMarker;1—3:PCRamplificationproductofSVA-VP1gene;4:NegativecontrolM12342000bp1000bp750bp500bp250bp100bp792bp502
63107);3:BRA-MG2-2015(KR063108);4:CAN-11-55910-3(KC667560);5:US-15-398121A(KU051391);6:US-15-40380IA(KU051392);7:US-15-403811A(KU051393);8:US-15-41901SD(KU051394);9:USA-89-47752(EU271757);10:USA-90-10324(EU271761);11:USA-1278(EU271763);12:USA-131395(EU271758);13:USA-GBI30-2015(KT827252);14:USA-IA46008-2015(KT757282);15:USA-KS15-01(KX019804);16:USA-MN15-84-22(KU359213);17:USA-SD41901-2015(KT757281);18:USA-SVA-OH2(KU05-8183)圖2SVAVP1基因的遺傳進化樹Fig.2PhylogenetictreeoftheVP1geneofSVA表1SVAVP1核苷酸序列的相似性Table1GenomesequencealignmentofSVAVP1%503
【參考文獻】
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【二級參考文獻】
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本文編號:2582377
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