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基于高通量測(cè)序的丁酸梭菌對(duì)肉雞盲腸菌群結(jié)構(gòu)的影響

發(fā)布時(shí)間:2019-10-16 19:26
【摘要】:采用高通量測(cè)序技術(shù)分析飼料中添加丁酸梭菌對(duì)肉雞盲腸菌群結(jié)構(gòu)的影響。選用300羽1日齡肉雞隨機(jī)分成2組,每組6個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)25羽雞,分別飼喂基礎(chǔ)日糧和基礎(chǔ)日糧+丁酸梭菌3×10~7cfu·kg~(-1)的試驗(yàn)日糧。在42日齡階段稱(chēng)量體質(zhì)量后每個(gè)重復(fù)取3羽公雞用于采集盲腸內(nèi)容物,提取其基因組DNA,用特異性引物擴(kuò)增細(xì)菌16S rRNA基因V3-V4區(qū),采用基于Illumina Miseq測(cè)序平臺(tái)對(duì)細(xì)菌16S rRNA基因進(jìn)行測(cè)序分析。結(jié)果表明,添加丁酸梭菌可以顯著地降低肉雞的料肉比(P0.05)。肉雞盲腸中細(xì)菌主要是硬壁菌門(mén)、擬桿菌門(mén)、變形菌門(mén)和軟壁菌門(mén);在門(mén)的水平上,丁酸梭菌處理具有降低硬壁菌門(mén)豐度、增加擬桿菌門(mén)豐度的趨勢(shì)。在屬的水平上,瘤胃菌屬(Ruminococcaceae_uncultured)、糞棲桿菌屬(Faecalibacterium)、別樣桿菌屬(Alistipes)、毛螺菌屬(Lachnospiraceae_incertae_sedis)是肉雞盲腸中的主要優(yōu)勢(shì)菌屬;丁酸梭菌處理使肉雞盲腸中糞棲桿菌(Faecalibacterium)、別樣桿菌(Alistipes)、類(lèi)桿菌屬(Bacteroides)、Phascolarctobacterium和丁酸梭菌(Butyricicoccus)相對(duì)豐度顯著升高(P0.05),毛螺菌屬(包括Lachnospiraceae_incertae_sedis和Lachnospiraceae_unclassified)、理研菌屬(Rikenella)、鏈球菌(Streptococcus)和Blautia屬相對(duì)豐度顯著降低(P0.05),其中豐度顯著升高菌群為主要的短鏈脂肪酸生成菌。由此表明,日糧中添加丁酸梭菌可降低肉雞的料肉比,增加盲腸中產(chǎn)短鏈脂肪酸菌群的豐度。
【作者單位】: 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究所;浙江農(nóng)林大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31402083) 浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院國(guó)際合作項(xiàng)目
【分類(lèi)號(hào)】:S831.5

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本文編號(hào):2550129

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