【摘要】：為了調(diào)查近幾年廣西豬圓環(huán)病毒2型(PCV2)流行毒株的遺傳變異趨勢,為豬圓環(huán)病毒病(PCVD)的有效控制提供理論指導(dǎo),對廣西不同地區(qū)送檢的病死保育豬肺及淋巴結(jié)樣品進(jìn)行PCV2檢測和全基因擴(kuò)增。應(yīng)用Laser Gene 7.1和M EGA 4.1軟件對PCV2全基因序列進(jìn)行核苷酸同源性和遺傳進(jìn)化分析,并對開放閱讀框(ORF2)氨基酸位點變異進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,從陽性病料中成功擴(kuò)增出12條PCV2全基因序列,其中6條PCV2序列屬于PCV2d基因型,另外6條屬于PCV2b基因型。不同基因型ORF2氨基酸序列分析顯示,PCV2a、PCV2b、PCV2c和PCV2d各個基因型的ORF2氨基酸序列上的位點具有其獨特性。本研究發(fā)現(xiàn),近年來廣西地區(qū)豬群PCV2d基因型的感染病例增多,有可能會替代PCV2b或者與PCV2b共同成為廣西地區(qū)的主導(dǎo)基因型。
【圖文】：

、GXNN1/2016和GXNN2/2016與9株P(guān)CV2d基因型參考毒株的核苷酸同源性為98.1％～99.8％，而與10株P(guān)CV2b基因型參考毒株的核苷酸同源性為95.7％～96.8％。將本研究中的PCV2全基因序列與28株參考毒株（其中10株P(guān)CV2為國內(nèi)外代表毒株，14株為2002—2007年廣西流行毒株，其余4株為2011—2012年廣西PCV2流行毒株）進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析，結(jié)果（見圖3和表1）顯示，PCV2可分為4個基因型，分別是PCV2a、PCV2b、PCV2c和PCV2d，本研究中2014—2016年的12株廣表1PCV2全基因序列信息Table1TheinformationaboutthecompletegenomeofPCV2圖2PCV2全基因的擴(kuò)增Fig.2TheamplificationofthecompletegenomeofPCV2M：DNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；1～6：PCV2全基因的擴(kuò)增產(chǎn)物M：DL2000DNAMarker；1—6：ThePCRproductsofthecompletegenomeofPCV2483

全長/bpFull-length登錄號GenBankaccessionnumber基因型GenotypesGXNN2/2014廣西南寧Nanning，Guangxi1767KJ956692PCV2bGXQZ1/2015廣西欽州Qinzhou，Guangxi1767KY305199PCV2dGXQZ2/2015廣西欽州Qinzhou，Guangxi1767KY305200PCV2dGXNN3/2015廣西南寧Nanning，Guangxi1767KY305201PCV2bGXNN5/2015廣西南寧Nanning，Guangxi1767KY305202PCV2bGXNN1/2016廣西南寧Nanning，Guangxi1767KY305203PCV2dGXNN2/2016廣西南寧Nanning，Guangxi1767KY305204PCV2d500bp400bp300bp250bp150bp100bp50bpM1234圖1PCV2的PCR檢測結(jié)果Fig.1ThedetectionofPCV2byPCRM：DNA分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)；1、2：PCV2的擴(kuò)增產(chǎn)物；3：陽性對照；4：陰性對照M：50bpladderMarker；1,2：ThePCRproductsofPCV2；3：Theposi-tivecontr；o4l：Thenegativecontrol病料21份，其中16份病料為PCV2陽性，，部分檢測結(jié)果見圖1。2.2PCV2全基因擴(kuò)增和序列測定從16份陽性病料中隨機(jī)選取12份，應(yīng)用PCV2全基因擴(kuò)增引物對12份陽性PCV2的全基因進(jìn)行擴(kuò)增，擴(kuò)增產(chǎn)物大小約為1767bp（見圖2）。全基因序列經(jīng)過基因測序鑒定，12條PCV2全基因序列大小均為1767bp，并將所有毒株的全基因序列上傳至Gen-Bank基因庫，序列信息詳見表1。2.3廣西PCV2全基因序列同源性分析及遺傳進(jìn)化分析本研究中12株P(guān)CV2全基因核苷酸序列之間的同源性為95.8％～100％，與28株參考毒株的核苷酸同源性為93.0％～99.8％；其中與PCV2c基因型的參考序列核苷酸同源性較低，為93.0％～95.1％；GXNN5/2015、GXNN3/2015、GXBH6/2014、GXNN2/2014、GXHX1/2014和GXHX2/2014與10株P(guān)CV2b基因型參考毒株的核苷酸同源性較高，為98.0％～99.5％，與9株P(guān)CV2d基因型參考毒株的核苷酸同源性為95.6％～96.4?
【作者單位】： 廣西壯族自治區(qū)獸醫(yī)研究所廣西獸醫(yī)生物技術(shù)重點實驗室;
【基金】：廣西科技攻關(guān)重大專項(1222003-2-4) 國家“萬人計劃”領(lǐng)軍人才專項(2016-37-88) 廣西特聘專家專項(2011B020)
【分類號】：S852.651

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本文編號：2541712