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2014~2016年華東地區(qū)H9N2亞型禽流感病毒遺傳進(jìn)化分析及氣溶膠傳播特性研究

發(fā)布時(shí)間:2018-12-15 15:43
【摘要】:自20世紀(jì)90年代中期以來H9N2亞型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)在中國呈地方流行性,單純H9N2病毒感染只會(huì)引起輕微臨床癥狀,如果繼發(fā)其他病原則死亡率大大提高。禽流感病毒在陸生禽類中流行并演化成為不同的基因型,目前H9N2病毒在我國家禽中優(yōu)勢流行株是S(G57)基因型,該基因型最早出現(xiàn)在2007年,2010年以后成為優(yōu)勢基因型。H9N2病毒主要自然感染家禽,自1998年以來,其宿主譜不斷擴(kuò)大,中國香港和大陸其他省份陸續(xù)的從豬和人的體內(nèi)分離到Y(jié)280譜系的病毒。H9N2 AIV特別是S基因型病毒可以作為包括H5N1,H7N9和H10N8在內(nèi)的新型人類禽流感病毒的基因供體,通過基因組重配產(chǎn)生能夠引起人類嚴(yán)重感染的病毒,嚴(yán)重威脅著公共衛(wèi)生安全。H9N2病毒在感染不同宿主后在環(huán)境和抗體選擇壓下生物學(xué)特性也發(fā)生了改變,前期研究表明F98-like H9N2病毒部分毒株具有氣溶膠傳播特性,但是S基因型病毒的氣溶膠傳播特性并無相關(guān)報(bào)道。流行病學(xué)調(diào)查表明活禽交易市場在多種亞型病毒的轉(zhuǎn)播中起到了非常重要的作用,市場的工作人員和交易人員暴露于感染了禽流感病毒的禽群是人感染禽流感病毒的一個(gè)主要途徑,其中交易的家禽也是流感病毒的天然病毒庫。盡管不同時(shí)期H9N2亞型AIV分離株的譜系和基因型已有報(bào)道,但H9N2優(yōu)勢流行株的致病性特別是氣溶膠傳播特性的研究相對(duì)較少。對(duì)H9N2病毒致病性進(jìn)化的充分掌握,將有助于我們更好地預(yù)防和控制H9N2,防止其他具有潛在威脅的流感病毒在中國各地爆發(fā)。本研究的目的是對(duì)活禽交易市場禽流感病毒進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查,并對(duì)華東地區(qū)流行的H9N2病毒進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析和致病性分析。1.2014-2016年中國部分地區(qū)禽流感病毒流行病學(xué)監(jiān)測2014年12月-2015年11月,我們對(duì)江蘇地區(qū)部分活禽交易市場進(jìn)行了禽流感的流行病學(xué)監(jiān)測,從76個(gè)禽群共900份棉拭子樣品中分離到了 42株禽流感病毒,包括H1、H3、H4、H5、H6、H7、H9和H11共8個(gè)HA亞型。流感病毒的總分離率為4.67%,群陽性率為23.7%;其中高致病性H5亞型病毒的分離率最高,為1.1%,占陽性樣品總數(shù)的23.8%;其次為低致病性H9亞型病毒,分離率為0.67%。H1、H3、H4、H6、H11等低致病性流感病毒的分離率相對(duì)較低,且均從水禽中分離到。調(diào)查的不同宿主中,禽流感病毒在鴨群的分離率最高,達(dá)10.6%;其次是雞群,為3.25%。結(jié)果表明,活禽交易市場中禽流感病毒的分布呈多樣性:雞是H5、H7和H9亞型病毒感染的主要宿主;鴨攜帶除H7亞型之外的所有亞型禽流感病毒,特別是H3、H4、H6、H11亞型禽流感病毒;H5、H7和H9亞型禽流感病毒主要出現(xiàn)在秋冬季節(jié)。因此,活禽交易市場是各種亞型禽流感病毒存在的重要場所,且鴨是禽流感病毒重要的儲(chǔ)存宿主;加強(qiáng)對(duì)活禽交易市場的監(jiān)測和管理對(duì)于控制禽流感至關(guān)重要。2015-2016年臨床樣品中共分離H9亞型禽流感病毒64株,當(dāng)前H9亞型在華東地區(qū)仍然流行。2.華東地區(qū)H9N2亞型禽流感病毒分離株遺傳變異分析2014年至2016年期間,從華東地區(qū)活禽市場的健康家禽或組織樣本的中分離出71株H9N2病毒,所有病毒均具有低致病性禽流感(LPAI)病毒的特征。對(duì)部分毒株的HA和NA進(jìn)行序列測定,遺傳進(jìn)化分析表明,這些病毒HA和NA基因與2007-2009年分離的H9N2病毒相比,核苷酸序列同源性分別為86.7%-94.3%,與2010-2014年病毒相比分別為94.6%-97.8%,2015-2016年毒株之間HA和NA序列核苷酸同源性為95.1%-99.1%;蚪M分析顯示,這些病毒都屬于S基因型。與2013年之前的H9N2病毒相比較,這些病毒在各個(gè)基因片段都已經(jīng)發(fā)生了多個(gè)氨基酸位點(diǎn)的變異,包括HA基因Q226L的突變,PB2基因I293V、T598V和L648V的突變,PA基因K356R的突變等。這些適應(yīng)性的突變可能有助于增強(qiáng)病毒聚合酶活性,使病毒在新宿主中能夠有效的復(fù)制。另外,PB2基因E627K被認(rèn)為是禽流感病毒哺乳動(dòng)物適應(yīng)性的分子標(biāo)記,本研究中我們發(fā)現(xiàn)了 2個(gè)分離株發(fā)生該位點(diǎn)的突變。H9N2病毒與2010年之前的病毒相比遺傳多樣性減少(目前華東地區(qū)家禽流行的幾乎只有S基因型一種),但是8個(gè)基因隨著時(shí)間的推進(jìn)表現(xiàn)出了遺傳多樣性的演化。病毒一些適應(yīng)性突變使得病毒的致病性增強(qiáng),為了避免新的大流行病爆發(fā),采取更為有效的方法研究調(diào)查這些分子標(biāo)記物是十分必要的。3.華東地區(qū)不同年代H9N2亞型禽流感病毒致病性及傳播特性研究為了探索當(dāng)前流行的S基因型H9N2病毒在雞群中致病性和有效傳播的能力的變化,我們選擇 6 株 AH320/2016、SDKD1/2015、TM118/2014、WJ57/2012、HeN86/2008、SH7/2001感染SPF雞進(jìn)行病毒致命性和傳播實(shí)驗(yàn)。本研究中,SH7是已被證實(shí)的具有氣溶膠傳播性的病毒,作為本研究氣溶膠傳播的陽性對(duì)照。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,近幾年的毒株SDKD1、AH320、TM118與早期毒株WJ57和HeN86相比,可以從多個(gè)組織器官中檢測出,而且它們?cè)诮M織中復(fù)制時(shí)間較長,病毒載量更高。氣溶膠傳播試驗(yàn)表明,與早期的毒株HeN86相比,WJ57的氣溶膠傳播組3只雞中,有1只檢測到了排毒,但是晚期毒株SDKD1、AH320的氣溶膠傳播組從感染后第5天至第9天均能檢測出排毒,而且具有很高的病毒滴度以及血清轉(zhuǎn)化水平。結(jié)果表明最近的病毒都具有了氣溶膠傳播性,這有助于病毒與哺乳動(dòng)物受體相結(jié)合,使得病毒具有跨物種傳播的潛力。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:S852.65

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2380900

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