【摘要】：為了解廣東地區(qū)豬戊型肝炎的感染情況,本試驗于2015年在廣東不同豬場收集了2月齡內(nèi)豬膽汁73份,RTnPCR檢測、全基因組測序、同源性及進化分析結(jié)果顯示:豬感染戊型肝炎的陽性率為6.8%(5/73),5個ORF2部分核苷酸序列同源性為87.2%~99.4%,屬于基因4型,4b、4h亞型。對4b亞型中的1個陽性樣品(GZHD)株進行全基因測序,其核苷酸序列與swGX40(EU676172)同源性最高為96.5%,與廣東株SS19(JX855794)同源性為93.9%,與人源戊型肝炎病毒(HEV)株CVS-Sie10(LC042232)同源性為94.8%。結(jié)果表明:廣東地區(qū)豬群間HEV流行毒株仍以基因4型為主,且為揭示戊型肝炎的跨種傳播提供了新的分子生物學依據(jù)。
[Abstract]:In order to understand the infection of swine hepatitis E in Guangdong, 73 samples of pig bile were collected in different pig farms in Guangdong province in 2015. The samples were detected by RTnPCR, and the whole genome was sequenced. The results of homology and evolution analysis showed that the positive rate of hepatitis E infection in pigs was 6.8% (5 / 73), and the homology of 5 ORF2 partial nucleotide sequences was 87.2%. The nucleotide sequence of one positive (GZHD) strain of 4b subtype was 96.5 with swGX40 (EU676172) and 93.9 with Guangdong SS19 (JX855794). The homology with human hepatitis E virus (HEV) strain CVS-Sie10 (LC042232) was 94. 8%. The results showed that gene 4 was the dominant HEV strain among swine populations in Guangdong, which provided a new molecular biological basis for revealing the interspecies transmission of hepatitis E.
【作者單位】： 華南農(nóng)業(yè)大學獸醫(yī)學院;
【基金】：現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系資助項目(CARS-36)
【分類號】：S858.28

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【共引文獻】

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本文編號：2350127