發(fā)布時(shí)間：2018-11-15 19:32

【摘要】：目前,奶牛選育種工作成為制約南方奶牛業(yè)發(fā)展的主要因素之一,其中DHI測(cè)定體系是世界上最為科學(xué)、有效的奶牛生產(chǎn)管理工具,成為奶牛選育種工作的重要參考依據(jù)。近年來(lái),在我國(guó)南方地區(qū),規(guī)模較大的奶牛公司已經(jīng)開(kāi)始實(shí)施DHI測(cè)定,積累了一定量的生產(chǎn)性能測(cè)定數(shù)據(jù)。本研究主要通過(guò)對(duì)DHI數(shù)據(jù)分析,了解和評(píng)估DHI體系在我國(guó)南方的運(yùn)用效果,為南方地區(qū)DHI體系的應(yīng)用和推廣提供科學(xué)的參考依據(jù)。同時(shí)為了加快南方奶牛遺傳育種進(jìn)展,縮短育種周期,分子育種成為最有效的方法之一,而與奶牛產(chǎn)奶性狀相關(guān)功能基因的挖掘和驗(yàn)證是奶牛分子育種的重要前提和基礎(chǔ)。本研究利用質(zhì)譜SNP分型技術(shù)對(duì)奶牛重要產(chǎn)奶性狀的候選變異位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè),并與之進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,同時(shí),對(duì)其進(jìn)行功能驗(yàn)證,以期挖掘到真正影響我國(guó)南方荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀的候選基因及其功能變異位點(diǎn),為奶牛分子標(biāo)記輔助選擇提供依據(jù)。本研究以廣東地區(qū)某大型奶牛公司2008年以來(lái)的DHI數(shù)據(jù)為研究對(duì)象,采用SAS9.2的GLM過(guò)程進(jìn)行單因素方差分析,用嚴(yán)格的Bonferroni多重比較方法進(jìn)行顯著性檢驗(yàn),同時(shí)利用最小二乘模型對(duì)影響牛群生產(chǎn)性能的固定效應(yīng)進(jìn)行分析;采用單標(biāo)記回歸分析方法對(duì)質(zhì)譜分析的奶牛群體進(jìn)行標(biāo)記-性狀關(guān)聯(lián)分析,利用R語(yǔ)言分析軟件進(jìn)行關(guān)聯(lián)研究。主要結(jié)果如下:1、產(chǎn)犢年份對(duì)產(chǎn)奶性能的影響達(dá)到極顯著水平(P0.01)。2009年至今,奶牛的產(chǎn)奶量呈穩(wěn)步上升趨勢(shì),體細(xì)胞評(píng)分SCS呈逐年下降趨勢(shì)。平均產(chǎn)奶量由2009年的6936.57Kg(22.59kg/頭·日)增加到2014年的8356.50Kg(30.51kg/頭·日),增幅高達(dá)35%,差異極顯著(P0.01);乳脂率由3.3%上升到3.9%,脂蛋比由原來(lái)的1.00提高到1.25(正常水平范圍內(nèi)),乳蛋白率無(wú)顯著提升。自參加DHI以來(lái),奶牛生產(chǎn)性能有了顯著提升。2、不同泌乳階段對(duì)奶牛產(chǎn)奶量、乳成分都具有顯著影響。第一泌乳期產(chǎn)奶量最高達(dá)30.17 kg/頭·日;第三泌乳期乳品質(zhì)最高,分別為乳脂率(4.009%)、乳蛋白率(3.475%)和SCS(4.283)。3、產(chǎn)犢季節(jié)和胎次對(duì)產(chǎn)奶性能的影響均達(dá)到極顯著水平(P0.01)。一年當(dāng)中冬季產(chǎn)犢對(duì)生產(chǎn)對(duì)為有利,夏季最為不利。夏季產(chǎn)奶量、乳脂率和乳蛋白率均低于其他季節(jié),其中乳脂率為3.597%,乳蛋白率為3.190%;在體細(xì)胞評(píng)分方面,南方地區(qū)奶牛受熱應(yīng)激的影響產(chǎn)奶量較低而體細(xì)胞評(píng)分相應(yīng)較高,春、夏兩季最高,且和其它兩季節(jié)間差異極顯著(P0.01)。在胎次方面,奶牛產(chǎn)奶量在第三胎達(dá)到最高,為8581.33Kg;乳脂率第一胎最高(3.916%),乳蛋白率第二胎最高(3.257%);體細(xì)胞評(píng)分隨胎次增加有升高的趨勢(shì)。4、對(duì)295頭荷斯坦奶牛樣本的90個(gè)與荷斯坦奶牛產(chǎn)奶性狀顯著相關(guān)的SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,結(jié)果表明:分型的平均Call rate為98.39%,且分型成功的SNP中多態(tài)性比例98.82%,平均MAF為0.27。利用單標(biāo)記回歸分析方法對(duì)五個(gè)產(chǎn)奶性狀進(jìn)行標(biāo)記-性狀關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果有45個(gè)SNP顯著影響奶牛產(chǎn)奶性狀,其中17個(gè)SNP位于14號(hào)染色體上。深入分析表明,45個(gè)SNP位點(diǎn)中影響多種產(chǎn)奶性狀的有23個(gè),影響單一產(chǎn)奶性狀的SNP有22個(gè)。其中已報(bào)道的影響產(chǎn)奶量的主效基因DGAT,GHR,PPP1R16A,TRAPPC9等也被定位到。5、通過(guò)對(duì)DGAT1,GHR,TRAPPC9和ATP1A1基因多態(tài)性進(jìn)行群體驗(yàn)證,結(jié)果表明,DGAT1基因rs109421300位點(diǎn)、TRAPPC9基因rs110017379位點(diǎn)、ATP1A1基因rs110256520位點(diǎn)和GHR基因rs61639260位點(diǎn)可以用于我國(guó)南方荷斯坦奶牛的分子標(biāo)記輔助選擇工作中。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：華南農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S823

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2334237