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一株新亞群禽白血病病毒全基因組序列分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-15 06:37
【摘要】:為了解外源性禽白血病病毒(ALV)在山東省部分地區(qū)肉雞中的流行狀況,采集無(wú)菌抗凝血分離血漿接種DF-1細(xì)胞、ELISA p27抗原檢測(cè)以及DNA提取進(jìn)行PCR擴(kuò)增等方法,從山東省某地區(qū)大型養(yǎng)殖場(chǎng)不同個(gè)體養(yǎng)殖場(chǎng)出欄肉雞群中分離鑒定出1株ALV,命名為FC1505。分析其囊膜糖蛋白gp85氨基酸序列與近年來(lái)從地方品種雞中疑似新亞群ALV-K分離株的相似性最高,相似性均在95%以上,而與其他已知亞群ALV的相似性均低于90%。為了進(jìn)一步分析該分離株分子特性,對(duì)其進(jìn)行全基因組測(cè)序,并與已知亞群ALV分離株序列進(jìn)行比較。結(jié)果表明,FC1505分離株整個(gè)基因組中g(shù)ag、pol和gp37基因相對(duì)保守,與ALV參考毒株序列相似性都在90%以上,但均與疑似K亞群的ALV分離株相似性最高;全基因組序列分析進(jìn)一步說(shuō)明FC1505屬于ALV-K。本研究繼我國(guó)江蘇省和華南地區(qū)K亞群ALV報(bào)道后,首次從山東地區(qū)肉雞中鑒定到一株ALV-K并完成其全基因組序列分析。
[Abstract]:In order to understand the prevalence of exogenous avian leukemia virus (ALV) in broiler chickens in some areas of Shandong Province, we collected sterile anticoagulant blood samples and inoculated DF-1 cells, detected ELISA p27 antigen, and extracted DNA for PCR amplification. A strain of ALV, named FC1505. was isolated and identified from the flocks of chickens from different individual farms in a large farm in Shandong Province. The amino acid sequence of envelope glycoprotein (gp85) was similar to that of ALV-K isolates of suspected new subgroup from local chickens in recent years, and the similarity was more than 95%, but the similarity with other known subgroups ALV was lower than 90%. In order to further analyze the molecular characteristics of the isolate, the whole genome was sequenced and compared with the known subgroup ALV isolate. The results showed that gag,pol and gp37 genes in the whole genome of FC1505 isolates were relatively conserved, and the sequence similarity between gag,pol and ALV reference strains was more than 90%, but the similarity was the highest with ALV isolates with suspected K subgroup. The whole genome sequence analysis further indicates that FC1505 belongs to ALV-K. After ALV of K subgroup in Jiangsu and South China was reported, a strain of ALV-K was first identified from chicken in Shandong province and its whole genome sequence was analyzed.
【作者單位】: 滕州市畜牧局;山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;山東農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:滕州市應(yīng)用技術(shù)研究與開(kāi)發(fā)計(jì)劃(滕科201505007-02)
【分類號(hào)】:S858.31

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本文編號(hào):2332411

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