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奶牛亞臨床低血鈣癥的蛋白質(zhì)組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-12 17:13
【摘要】:根據(jù)奶牛血漿鈣濃度將奶牛分為試驗(yàn)組和對(duì)照組,并設(shè)置2個(gè)平行試驗(yàn)組。應(yīng)用iTRAQ/LC-MS/MS技術(shù)對(duì)2組奶牛樣品進(jìn)行差異表達(dá)蛋白的篩選和鑒定,并結(jié)合生物信息學(xué)軟件對(duì)試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。試驗(yàn)共得到398個(gè)差異表達(dá)蛋白,其中2個(gè)平行試驗(yàn)組重疊的蛋白為265個(gè),經(jīng)過篩選共得到14種具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的表達(dá)蛋白。結(jié)合生物信息學(xué)分析中的基因功能分析,結(jié)果得到74個(gè)注釋結(jié)果,細(xì)胞組成、分子功能和生物過程分別為6,12,55個(gè)。根據(jù)結(jié)果分析可知,奶牛亞臨床低血鈣癥生理和病理現(xiàn)象能夠從3個(gè)方面解釋其生理和病理現(xiàn)象,分別是血鈣調(diào)節(jié)、免疫與炎癥反應(yīng)和血液凝固與補(bǔ)體途徑。本試驗(yàn)首次應(yīng)用iTRAQ結(jié)合LC-MS/MS技術(shù)對(duì)亞臨床低血鈣癥奶牛進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析,填補(bǔ)該技術(shù)對(duì)亞臨床低血鈣癥的空白,并提供科學(xué)依據(jù)。
[Abstract]:Cows were divided into experimental group and control group according to plasma calcium concentration and two parallel test groups were set up. ITRAQ/LC-MS/MS technique was used to screen and identify the differentially expressed proteins in two groups of dairy cattle samples, and the results were analyzed with bioinformatics software. A total of 398 differentially expressed proteins were obtained, of which 265 were overlapped in 2 parallel test groups. A total of 14 differentially expressed proteins were obtained by screening. Combined with the analysis of gene function in bioinformatics analysis, 74 annotated results were obtained. The cell composition, molecular function and biological process were 612,55, respectively. According to the analysis of the results, the physiological and pathological phenomena of subclinical hypocalcemia in dairy cattle can be explained from three aspects: regulation of blood calcium, immune and inflammatory reaction, blood coagulation and complement pathway. In this study, iTRAQ and LC-MS/MS were used for proteomics analysis of subclinical hypocalcemia cows for the first time, which filled the blank of subclinical hypocalcemia and provided scientific basis.
【作者單位】: 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目主任基金資助項(xiàng)目(30840060);國(guó)家自然科學(xué)基金面上資助項(xiàng)目(30972235) 黑龍江省自然科學(xué)基金面上資助項(xiàng)目(C200916) 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)研究生創(chuàng)新基金資助項(xiàng)目(YJSCX2015-Z03)
【分類號(hào)】:S858.23

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2327700

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