發(fā)布時(shí)間：2018-11-08 17:08

【摘要】：羽色性狀是禽類重要的經(jīng)濟(jì)性狀,在育種上也是品種(系)選育的遺傳標(biāo)記,在確定品種純度和親緣關(guān)系方面有一定用途。研究表明刺鼠信號(hào)蛋白基因(agouti signaling protein gene, ASIP)和酪氨酸酶相關(guān)蛋白-1(Tyrosinase related protein-1, TYRP1)的變異與畜禽的毛(羽)色性狀相關(guān),是毛(羽)色遺傳的重要候選基因。本研究以浙東白鵝、皖西白鵝白羽、皖西白鵝花羽、獅頭鵝白羽和獅頭鵝灰羽群體為試驗(yàn)材料,選取ASIP和TYRP1基因?yàn)轾Z羽色性狀相關(guān)的候選基因,開展了鵝ASIP和TYRP1基因的核酸序列克隆、基因結(jié)構(gòu)組成、組織表達(dá)譜分析及基因組序列單核苷酸多態(tài)性(SNP)檢測(cè)等相關(guān)研究。獲得的主要研究結(jié)果如下：1.采用比較基因組技術(shù)克隆獲得了鵝ASIP基因完整的cDNA和基因組DNA序列。擴(kuò)增獲得的cDNA序列長(zhǎng)461bp(登錄號(hào)：KP404626),包含38 bp的5’-端非編碼區(qū)序列,390 bp的編碼區(qū)(ORF)序列和20 bp的3’-端非編碼區(qū)序列。其中ORF可編碼130個(gè)氨基酸的蛋白,預(yù)測(cè)蛋白分子量(MW)為14.88 kDa,等電點(diǎn)(pI)為9.73�；蚪M序列(登錄號(hào)：KP404625)長(zhǎng)為6176 bp,由3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子組成。多序列對(duì)位比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,鵝ASIP基因在脊椎動(dòng)物,尤其在鳥類中高度保守；半定量RT-PCR分析結(jié)果顯示：鵝ASIP基因在眼球、背皮、腹皮、毛囊和腳蹼中特異表達(dá),而在心臟、肝臟、脾臟、腎臟、大腦、腺胃和肌肉組織中未檢測(cè)到表達(dá),且背皮表達(dá)量顯著低于腹皮的表達(dá)量；通過直接測(cè)序方法在鵝ASIP基因的基因組序列上共檢測(cè)到45個(gè)SNP位點(diǎn)和3個(gè)插入／缺失突變,c.3758GA和c.4599CT位點(diǎn)分別可以被限制性內(nèi)切酶Hha1和HindⅢ識(shí)別,均可產(chǎn)生3種基因型。群體分型結(jié)果顯示：對(duì)于c.3758GA位點(diǎn)而言,在皖西白鵝白羽、皖西白鵝花羽和獅頭鵝白羽群體中G等位基因占優(yōu)勢(shì),獅頭鵝灰羽群體中等位基因A略占優(yōu)勢(shì)；對(duì)于c.4599CT位點(diǎn)而言,在所有群體中C等位基因占優(yōu)勢(shì)。2.通過比較基因組技術(shù)克隆測(cè)序獲得了鵝TYRP1基因完整的cDNA序列和基因組DNA全長(zhǎng)序列。擴(kuò)增獲得的cDNA序列長(zhǎng)1866bp(登錄號(hào)：KR080365),包含141 bp的5’-端非編碼區(qū)序列,1611 bp的編碼區(qū)(ORF)序列和114 bp的3’-端非編碼區(qū)序列。其中ORF可編碼536個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)MW為60.66 kDa, pI為5.68�；蚪MDNA序列長(zhǎng)為10331bp(登錄號(hào)：KR080366),由7個(gè)外顯子和6個(gè)內(nèi)含子組成。多序列對(duì)位比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,鵝TYRP1基因與同屬于鳥類的雞、鴨、日本鵪鶉、斑鳥草雀和火雞有較近的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系；半定量RT-PCR分析結(jié)果顯示：鵝TYRP1基因在眼球、背皮、腹皮和毛囊黑色素沉積組織中有較高的表達(dá)量,在腳蹼、大腦、肌肉和腺胃組織中表達(dá)量較低,而在心臟、肝臟、脾臟、腎臟組織中未檢測(cè)到基因的表達(dá)。同樣,鵝TYRP1基因在背皮中的表達(dá)量顯著低于腹皮的表達(dá)量；通過直接測(cè)序在鵝TYRP1基因組序列上共檢測(cè)到20個(gè)SNP位點(diǎn)和3個(gè)插入\缺失突變,其中c.6290AG位點(diǎn)可以被限制性內(nèi)切酶HinfI識(shí)別可產(chǎn)生3種基因型。PCR-RFLP基因分型表明,A等位基因均在皖西白鵝白羽、皖西白鵝花羽、獅頭鵝灰羽和獅頭鵝白羽四個(gè)群體中占優(yōu)勢(shì)。以上研究結(jié)果的獲得將為鵝ASIP和TYRP1兩基因在鵝羽毛發(fā)育過程中的作用研究提供基礎(chǔ)。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：西南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：S835;Q78

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2319140