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牛乳頭瘤病毒基因1型貴州GZLZ流行株全基因組序列測(cè)定及分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-04 17:00
【摘要】:為了解牛乳頭瘤病毒(BPV)GZLZ流行株全基因組序列、結(jié)構(gòu)特征及遺傳變異情況,本研究首先提取貴州六枝患病牛皮膚腫瘤樣品DNA,以BPV L1基因的簡并引物對(duì)其進(jìn)行PCR擴(kuò)增,測(cè)序并構(gòu)建BPVL1基因進(jìn)化樹確定其為BPV1基因型。根據(jù)GenBank中BPV1參考株設(shè)計(jì)7對(duì)特異性引物,經(jīng)擴(kuò)增、測(cè)序、拼接后獲得BPV流行株全基因組序列。序列分析顯示,貴州六枝GZLZ流行株基因組全長為7 946 bp,具有BPV1基因型的結(jié)構(gòu)特征。本研究為貴州地區(qū)的牛乳頭狀瘤的病原鑒定、流行規(guī)律以及科學(xué)的防控提供依據(jù)。
[Abstract]:In order to understand the whole genome sequence, structural characteristics and genetic variation of bovine papillomavirus (BPV) GZLZ) epidemic strain, the DNA, of six diseased bovine skin tumor samples from Guizhou was amplified by PCR with degenerate primers of BPV L1 gene. BPVL1 gene was sequenced and constructed to identify it as BPV1 genotype. According to the BPV1 reference strain in GenBank, 7 pairs of specific primers were designed. After amplification, sequencing and splicing, the whole genome sequence of BPV epidemic strain was obtained. Sequence analysis showed that the genomic length of 7 946 bp, of six GZLZ strains in Guizhou had the structural characteristics of BPV1 genotype. This study provides evidence for identification, prevalence and scientific prevention and control of bovine papilloma in Guizhou.
【作者單位】: 貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;貴州省六盤水市動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所;貴州省畜禽遺傳資源管理站;
【基金】:貴州省黔南州社會(huì)發(fā)展科技重大計(jì)劃項(xiàng)目《喀斯特石漠化林草牧綜合治理技術(shù)研究與示范》[黔南社發(fā)科(20140325)] 貴州現(xiàn)代肉牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系專項(xiàng)(GZCYTX2015-0302-02) 貴州省農(nóng)業(yè)委員會(huì)科技專項(xiàng)《動(dòng)物疫病防控能力提升專項(xiàng)》(黔農(nóng)財(cái)[2015]149號(hào));貴州省農(nóng)業(yè)委員會(huì)科技計(jì)劃項(xiàng)[2016-01號(hào)] “貴州省動(dòng)物疫病防控與獸醫(yī)公共衛(wèi)生保障科技創(chuàng)新人才團(tuán)隊(duì)”(黔科合人才團(tuán)隊(duì)[2015]4016號(hào))
【分類號(hào)】:S852.653

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本文編號(hào):2310539

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