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雞性成熟啟動(dòng)前后下丘腦microRNA表達(dá)譜分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-01 12:08
【摘要】:本研究旨在探討miRNA在雞性成熟啟動(dòng)調(diào)控中的作用。利用Solexa高通量測序技術(shù)檢測了雞性成熟啟動(dòng)前(Before puberty onset,BPO)和性成熟啟動(dòng)后(After puberty onset,APO)下丘腦中miRNA表達(dá)譜,通過生物信息學(xué)方法進(jìn)行靶基因預(yù)測和功能分析。結(jié)果表明,在雞下丘腦中鑒定出374個(gè)已知miRNAs、46個(gè)新miRNAs,144個(gè)已知miRNAs(reads10)的表達(dá)水平在性成熟啟動(dòng)前后發(fā)生了顯著改變(P0.05)。5個(gè)差異表達(dá)miRNAs被qRT-PCR方法進(jìn)一步驗(yàn)證。15個(gè)差異最顯著miRNA(|log2(fold-change)|2.0,P0.01)預(yù)測到2 013個(gè)靶基因,GO富集和KEGG調(diào)節(jié)通路分析結(jié)果表明,這些差異表達(dá)miRNAs在性成熟啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中發(fā)揮了重要作用。綜上表明,miRNA是參與雞性成熟啟動(dòng)新的調(diào)節(jié)因子。鑒于miRNA功能的保守性,該研究結(jié)果將為深入開展動(dòng)物(包括人類)性成熟的分子調(diào)控機(jī)制研究提供新的理論依據(jù)。
[Abstract]:The purpose of this study was to investigate the role of miRNA in the regulation of sexual maturation initiation in chickens. The expression profiles of miRNA in hypothalamus of chicken before and after sexual maturation were detected by Solexa high-throughput sequencing technique. Target gene prediction and functional analysis were performed by bioinformatics. The results showed that 374 known miRNAs, were identified in chicken hypothalamus and 46 new miRNAs, were identified. The expression level of 144 known miRNAs (reads10) changed significantly before and after the initiation of sexual maturation (P0.05). 5 differentially expressed miRNAs were further verified by qRT-PCR method. The 15 most significant miRNA (log2 (fold-change) 2.0), P0.01) predicted 2013 target genes. The results of GO enrichment and KEGG regulation pathway analysis showed that these differentially expressed miRNAs played an important role in the initiation of transcriptional regulation and signal transduction pathway in sexual maturation. It is concluded that miRNA is a new regulatory factor involved in the initiation of sexual maturation in chickens. In view of the conserved nature of miRNA function, this study will provide a new theoretical basis for the further study of the molecular regulation mechanism of sexual maturity in animals (including humans).
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院家禽研究所國家級(jí)地方雞種基因庫;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31201799) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新項(xiàng)目(CX[15]1009)
【分類號(hào)】:S831

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2303885


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