【摘要】：對2016年分離自華東地區(qū)某活禽交易市場的一株鴨源H6N6亞型禽流感病毒A/duck/Anhui/D0642/2016(H6N6)進行了全基因組序列擴增和測序,以及序列同源性比對和遺傳進化分析。結(jié)果顯示,該分離株的HA基因與野禽源病毒A/turtledove/Wuhan/HKBJ62/2015(H6N6)的核苷酸一致性最高,推導的裂解位點處氨基酸基序為P-Q-I-E-T-R-G,符合低致病性禽流感病毒的分子特征;NA基因無莖部缺失,與早期分離株A/duck/Fujian/6159/2007(H6N6)具有最高的核苷酸相似性;內(nèi)部基因中,僅NP基因與H6N2亞型禽流感分離株的核苷酸相似性最高,PB2、PB1、PA、M和NS基因均與近幾年的H6N6亞型病毒關(guān)系緊密。進一步的分析表明,D0642株的8個基因片段均屬于歐亞進化譜系,可能由H6N6和H6N2亞型重組產(chǎn)生;并且NA和PB2基因還與當前國內(nèi)優(yōu)勢流行的2.3.4.4分支H5N6亞型禽流感病毒關(guān)系密切,可以為其在自然界的進一步重組提供基因片段的來源。因此,須加強對H6亞型禽流感病毒的流行病學監(jiān)測。
[Abstract]:A duck H6N6 subtype avian influenza virus (H6N6) isolated from a live poultry market in East China in 2016 was amplified and sequenced, sequence alignment and genetic evolution analysis were performed. The results showed that the nucleotide identity of the HA gene was the highest with that of wild fowl virus A/turtledove/Wuhan/HKBJ62/2015 (H6N6), and the deduced amino acid motif at the cleavage site was P-Q-I-E-T-R-G, which was consistent with the molecular characteristics of the low pathogenic avian influenza virus, and the NA gene had no stem deletion. The nucleotide similarity between NP gene and H6N2 subtype avian influenza isolate was the highest among the internal genes, and PB2,PB1,PA,M and NS genes were closely related to H6N6 subtype virus in recent years. Further analysis showed that the 8 gene fragments of D0642 belonged to the Eurasian phylogeny, which might be produced by the recombination of H6N6 and H6N2 subtypes, and the NA and PB2 genes were also closely related to the prevailing 2.3.4.4 H5N6 subtype avian influenza virus in China. It can provide a source of gene fragments for further recombination in nature. Therefore, epidemiological surveillance of H 6 subtype avian influenza virus should be strengthened.
【作者單位】： 揚州大學獸醫(yī)學院;揚州出入境檢驗檢疫局;江蘇高校動物重要疫病與人獸共患病防控協(xié)同創(chuàng)新中心;
【基金】：國家重點研發(fā)計劃項目(2016YFD0500202-1、2016YFD0501601-3) “十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計劃項目(2015BAD12B01-3) 江蘇高校優(yōu)勢學科建設(shè)工程資助項目(PAPD)
【分類號】：S852.65

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本文編號：2282580