【摘要】：【目的】對1株疑似肺炎克雷伯氏菌進(jìn)行分離鑒定及全基因測序分析,并對發(fā)現(xiàn)的新基因kp05372編碼產(chǎn)物進(jìn)行生物信息學(xué)分析�！痉椒ā坎捎脗鹘y(tǒng)的細(xì)菌鑒定方法和分子生物學(xué)方法,分別對采自麝糞便的1株病原菌的生理生化特征及16SrRNA序列進(jìn)行測定;以小鼠感染試驗和半數(shù)致死量(LD50)測試該病原菌的致病性;用全基因組測序方法對病原菌基因組進(jìn)行測序分析,并對發(fā)現(xiàn)的新基因編碼產(chǎn)物進(jìn)行生物信息學(xué)分析�！窘Y(jié)果】經(jīng)生理生化試驗和16SrRNA序列分析發(fā)現(xiàn),分離菌株為肺炎克雷伯氏菌,命名為GPKP,其對小鼠致死的LD50為6.3×107CFU/mL。該菌基因組大小為4 879 707bp,包含5 490個開放閱讀框,共注釋到22組COG功能。kp05372基因編碼產(chǎn)物由302個氨基酸組成,無信號肽,是一種不穩(wěn)定的、在細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮生理作用的親水性蛋白�！窘Y(jié)論】分離的細(xì)菌為肺炎克雷伯氏菌,kp05372基因編碼產(chǎn)物屬于典型的LysR家族轉(zhuǎn)錄因子(LTTR)。
[Abstract]:[objective] to isolate and identify a suspected Klebsiella pneumoniae strain and complete gene sequencing. The bioinformatics analysis of the novel gene kp05372 coding product was carried out. [methods] the physiological and biochemical characteristics and 16SrRNA sequence of a pathogen collected from faeces of musk deer were determined by traditional methods of bacterial identification and molecular biology. The pathogenicity of the pathogen was tested by mouse infection test and half lethal dose (LD50). The new gene encoding product was analyzed by bioinformatics. [results] the isolated strain was Klebsiella pneumoniae by physiological and biochemical tests and 16SrRNA sequence analysis. The isolated strain was named Klebsiella pneumoniae and its lethal LD50 to mice was 6.3 脳 10 ~ (7) CFU / mL 路mL ~ (-1). The genome size of the strain is 4 879 707bpand contains 5 490 open reading frames. The results show that 22 groups of COG function. Kp05372 gene encoding products are composed of 302 amino acids and have no signal peptide. [conclusion] the isolated bacterium is Klebsiella pneumoniae kp05372 gene encoding product belongs to the typical LysR family transcription factor (LTTR).
【作者單位】： 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)院;四川養(yǎng)麝研究所;
【基金】：四川省學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人培養(yǎng)資助項目 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)雙支項目
【分類號】：S852.61

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本文編號：2255553