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歐洲型PRRSV遼寧株LNEU12的分離及其ORF5的序列分析

發(fā)布時(shí)間:2018-08-14 14:56
【摘要】:從遼寧某豬場(chǎng)疑似豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)病豬全血中分離到1株病毒,經(jīng)Marc-145細(xì)胞5次傳代后出現(xiàn)穩(wěn)定的細(xì)胞病變(CPE),電鏡觀察病毒粒子直徑約55 nm,并命名為L(zhǎng)NEU12。采用RT-PCR方法擴(kuò)增分離毒的ORF5全序列,再將目的基因克隆入p MD18-T載體進(jìn)行測(cè)序,并與國(guó)內(nèi)外已發(fā)表的毒株序列進(jìn)行比較。結(jié)果表明:分離毒的ORF5基因與LV、Amervac株的核酸同源性分別為87.1%和87.6%,與國(guó)內(nèi)分離的歐洲型毒株同源性為83.5%~94.2%。與LV株比較,分離毒GP5有22個(gè)氨基酸發(fā)生了變異,并存在3個(gè)潛在N-糖基化位點(diǎn)。基因系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)分析表明:分離毒LNEU12與BJEU06-1、NVDC-NM1-2011株的親緣關(guān)系很近,而與VR2332美洲株處于不同的分支,由此推斷分離毒LNEU12為歐洲型PRRSV。
[Abstract]:A strain of virus was isolated from the whole blood of a suspected porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) disease pig in a pig farm in Liaoning province. After five passages of Marc-145 cells, stable cytopathic effect was observed by (CPE), electron microscope, and the diameter of the virus particles was about 55 nm and named LNEU12. The whole ORF5 sequence of the isolated virus was amplified by RT-PCR method. The target gene was cloned into p MD18-T vector and sequenced, and compared with the published strains at home and abroad. The results showed that the nucleic acid homology of the isolated ORF5 gene was 87.1% and 87.6%, respectively, and the homology with the European strain was 83.5% and 94.2%, respectively. Compared with LV strain, the isolated GP5 had 22 amino acids and 3 potential N-glycosylation sites. Phylogenetic tree analysis showed that the isolated virus LNEU12 was closely related to BJEU06-1 NVDC-NM1-2011 strain, but was in a different branch with VR2332 strain in America, so it was deduced that the isolated virus LNEU12 was a European type of PRRSVV.The genetic phylogenetic tree analysis showed that the isolated virus LNEU12 was closely related to BJEU06-1 NVDC-NM1-2011 strain.
【作者單位】: 錦州醫(yī)科大學(xué)畜牧獸醫(yī)學(xué)院;
【基金】:遼寧省教育廳科研項(xiàng)目(L2014327)
【分類號(hào)】:S852.651

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本文編號(hào):2183219

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