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中國首次檢出的H12N2亞型禽流感病毒的基因組特征和系統(tǒng)進化分析

發(fā)布時間:2018-07-14 20:31
【摘要】:本實驗室自2011年開始在鄱陽湖周邊地區(qū)開展家禽養(yǎng)殖戶和活禽市場環(huán)境中的禽流感病毒監(jiān)測,在2011~2016年的監(jiān)測過程中,通過病毒分離和深度測序,發(fā)現(xiàn)了一株H12N2亞型禽流感病毒,這是在中國首次檢出該亞型病毒。該標本來自一份鴨糞便標本,采集自江西省余干縣的一個家禽養(yǎng)殖場。病毒的8個片段分別與來自鴨或者野禽中的病毒最為接近。對病毒的全基因組系統(tǒng)進化分析表明,該病毒屬于歐亞譜系。HA蛋白裂解位點序列為PQAQDR/GLF,屬于低致病性禽流感病毒,受體結(jié)合位點分析表明病毒對α-2,3唾液酸受體親和力較好。病毒NA的莖部沒有氨基酸的缺失,但是PB1蛋白的L13P和L473V可以增強病毒聚合酶在哺乳動物中復(fù)制的能力和病毒對于哺乳動物的毒性。M1蛋白N30D突變和T215A突變提示會增加流感病毒對于哺乳動物的致病性。本次從家禽養(yǎng)殖場環(huán)境中檢出野鳥相關(guān)的禽流感病毒進一步說明了在該地區(qū)進行禽流感病毒監(jiān)測的重要性,以及在家禽-野鳥界面加強生物安全措施的必要性,需要持續(xù)進行監(jiān)測,為禽流感病毒的暴發(fā)提供預(yù)警,為人感染禽流感病毒提供風險評估的依據(jù)。
[Abstract]:Our laboratory began to monitor avian influenza virus in poultry farmers and live poultry market environment in the area around Poyang Lake in 2011. During the surveillance process from 2011 to 2016, a strain of H12N2 subtype avian influenza virus was found through virus isolation and deep sequencing. This is the first time the subtype of the virus has been detected in China. The specimen was collected from a poultry farm in Yugan County, Jiangxi Province. The eight segments of the virus were most closely related to those from ducks or wild birds. The whole genome phylogenetic analysis showed that the virus belonged to Eurasian lineage. The cleavage site sequence of HA protein was PQAQDR / GLF, and it belonged to low pathogenic avian influenza virus. The receptor binding site analysis showed that the virus had good affinity to 偽 -2H3 sialic acid receptor. There is no amino acid deficiency in the stem of the virus na. However, L13P and L473V of PB1 protein can enhance the ability of viral polymerase replication in mammals and the virulence of virulence. M1 protein N30D mutation and T215A mutation may increase the pathogenicity of influenza virus to mammals. The detection of wild bird related avian influenza viruses from the poultry farm environment further demonstrates the importance of avian influenza virus surveillance in the region and the need to strengthen biosafety measures at the poultry / wild bird interface. Continuous surveillance is needed to provide early warning for outbreaks of avian influenza viruses and to provide a basis for risk assessment for human infection with avian influenza viruses.
【作者單位】: 中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心衛(wèi)生和計劃生育委員會醫(yī)學病毒和病毒病重點實驗室;江西省疾病預(yù)防控制中心;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃(項目號:2016YFD0500208),題目:人感染動物流感病毒(項目號:2016YFC1200200),題目:重要新發(fā)突發(fā)病原體發(fā)生與播散機制研究~~
【分類號】:S852.65

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本文編號:2122865

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