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麥洼牦牛基因組三堿基重復(fù)微衛(wèi)星的挖掘及其遺傳多態(tài)性分析

發(fā)布時間:2018-07-01 18:54

  本文選題:麥洼牦牛 + 三堿基; 參考:《中國畜牧獸醫(yī)》2017年05期


【摘要】:為了解麥洼牦,F(xiàn)有群體的遺傳多樣性及種群遺傳分化特征,試驗通過生物信息學方法從已公布的牦;蚪M中篩選到9 466個三堿基重復(fù)微衛(wèi)星位點,以191個麥洼牦牛基因組DNA樣品為模板對各個位點進行PCR擴增和聚丙烯酰胺凝膠電泳基因分型。經(jīng)過哈迪-溫伯格平衡檢驗,在15個三堿基微衛(wèi)星位點中,有5個位點偏離哈迪-溫伯格平衡(P0.05)。15個微衛(wèi)星位點均為高度多態(tài)性(PIC0.5),群體平均觀測雜合度(Ho)、平均期望雜合度(He)和平均多態(tài)信息含量(PIC)分別達到0.5041、0.8152和0.7831。進一步通過Structure 3.0軟件分析發(fā)現(xiàn),麥洼牦牛群體結(jié)構(gòu)單一,無分化特征,表明麥洼牦牛品種雖然具有較高的遺傳多態(tài)性但是無分化跡象。
[Abstract]:In order to understand the genetic diversity and population differentiation characteristics of the existing populations of Maiwa yak, 9,466 repeat microsatellite loci were selected from published yak genome by bioinformatics method. The genomic DNA samples of 191 Maiwa yaks were used as template for PCR amplification and polyacrylamide gel electrophoresis genotyping. After the Hardy-Weinberg equilibrium test, there were 15 tribasic microsatellite loci, Five loci deviated from the Hardiy-Weinberg equilibrium (P0.05). The 15 microsatellite loci were highly polymorphic (PIC0.5). The population average observed heterozygosity (Ho), average expected heterozygosity (he) and mean polymorphic information content (PIC) were 0.5041 and 0.7831, respectively. Further analysis of structure 3.0 software showed that the population structure of Maiwa yak was single and had no differentiation, which indicated that Maiwa yak had high genetic polymorphism but no differentiation.
【作者單位】: 西南科技大學生命科學與工程學院;
【基金】:中國博士后科學基金資助項目(20090461336);中國博士后科學基金特別資助項目(201003703)
【分類號】:S823.85

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本文編號:2088768

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