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不同雞種DMA基因序列比較分析

發(fā)布時間:2018-06-25 13:28

  本文選題: + DMA基因; 參考:《浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》2017年04期


【摘要】:DMA(major histocompatibility complex,classⅡ,DM alpha)基因是雞MHCⅡ類典型基因座,與免疫反應(yīng)和抗病性密切相關(guān)。試驗(yàn)對25個不同雞種的DMA基因序列進(jìn)行目標(biāo)捕獲測序,以NCBI上Gallus gallus的DMA基因序列作為參考序列,通過MEGA6軟件進(jìn)行序列比對分析,篩選出不同雞種DMA基因序列上的SNPs和Indels(insertion-deletion)位點(diǎn)以及氨基酸的變化,并根據(jù)基因序列的差異構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,探究不同雞種間的同源性。結(jié)果表明,DMA基因呈現(xiàn)出豐富的多態(tài)性,突變和缺失位點(diǎn)集中于外顯子上,且多個雞種在第2外顯子發(fā)生多位堿基缺失,導(dǎo)致其氨基酸序列發(fā)生極大改變,可能是不同雞種產(chǎn)生抗性差異的主要因素;同時進(jìn)化樹也顯示,斗雞、藏雞等抗性較好的雞種間有相近的親緣關(guān)系,同源性較高。以上結(jié)果表明,DMA基因有豐富的遺傳多樣性,且與不同雞種的先天免疫與抗病特性差異相關(guān),第2外顯子中94 496~94552的Indels可以作為雞免疫特性的候選標(biāo)記。
[Abstract]:DMA(major histocompatibility complex,class鈪,

本文編號:2066112

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