2016年~2017年我國華北地區(qū)某規(guī)模化豬場經典美洲型豬繁殖與呼吸綜合征病毒的分離鑒定及全基因組序列分析
本文選題:經典豬繁殖與呼吸綜合征病毒 + 病毒分離鑒定。 參考:《中國預防獸醫(yī)學報》2017年09期
【摘要】:為了解近期我國華北地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)的流行及變異情況,本研究對該地區(qū)某豬場采集33份2016年~2017年疑似患PRRS豬病料樣品進行PCR檢測,對陽性樣品進行病毒分離,并從分離株中選擇兩株病毒(SD158和SD192)進行全基因的序列擴增及分析。結果顯示,檢測到13份PRRSV陽性病料樣品,病原為經典美洲型PRRSV,但僅分離到11株病毒(4株感染MARC-145細胞,另外7株感染PAM細胞)。SD158和SD192株與Resp PRRS MLV株(疫苗株)的核苷酸同源性最高,分別為99.7%和99.4%。對這兩株PRRSV與VR-2332、Resp PRRS MLV的各基因的推導氨基酸序列進行分析,結果顯示在VR-2332與Resp PRRS MLV株22處差異氨基酸中,SD158株有15處、SD192株有14處氨基酸和Resp PRRS MLV株相同,但二者僅各有6處及7處氨基酸與VR-2332株一致,在鑒別PRRSV VR-2332株與Resp PRRS MLV株的7處可能與毒力相關的氨基酸位點時發(fā)現(xiàn),SD158與SD192株各有5處基酸與VR-2332株相同。根據(jù)以上結果推測SD158與SD192株可能來源于PRRSV Resp PRRS MLV株,具有上述分子變化特征的PRRSV在我國的流行狀況值得關注。
[Abstract]:In order to understand the recent prevalence and variation of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSv) in North China, 33 samples of suspected PRRS from 2016 to 2017 were collected from a pig farm in this area, and the positive samples were isolated by PCR. Two viruses (SD158 and SD192) were selected from the isolates to amplify and analyze the whole gene. The results showed that 13 samples of PRRSv positive venereal diseases were detected, the pathogen was classic American PRRSV.However, only 11 strains of virus (4 strains infected with MARC-145 cells and 7 strains infected with PAM cells), SD158 and SD192 had the highest nucleotide homology with Resp PRRS MLV strain (vaccine strain), but only 11 strains (4 strains infected with MARC-145 cells and 7 strains infected with PAM cells) had the highest nucleotide homology with Resp PRRS MLV strain (vaccine strain). 99.7% and 99.4%, respectively. The deduced amino acid sequences of the two strains of PRRSV and VR-2332Resp PRRS MLV were analyzed. The results showed that 15 of the 22 different amino acids in the VR-2332 and Resp PRRS MLV strains were found to have the same amino acids in 15 of the SD192 strains and 14 of the Resp PRRS MLV strains. However, there were only 6 amino acids and 7 amino acids in each of them, which were identical with VR-2332 strains. In identifying 7 amino acid sites of PRRSV VR-2332 strain and Resp PRRS MLV strain, it was found that there were 5 amino acid sites in SD158 and SD192 strains, respectively, which were the same as VR-2332 strains. According to the above results, it is inferred that SD158 and SD192 strains may originate from PRRSv Resp PRRS MLV strain. The epidemic situation of PRRSv with the above molecular variation characteristics in China should be paid attention to.
【作者單位】: 中國農業(yè)科學院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術國家重點實驗室;南陽師范學院;山東信得生物科技有限公司;中國農業(yè)科學院上海獸醫(yī)研究所;
【基金】:國家自然科學基金(31270045、31502097)
【分類號】:S852.651
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,本文編號:2057282
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