河北小尾寒羊mtDNA變異及遺傳多樣性分析
本文選題:河北小尾寒羊 + 線粒體基因組; 參考:《畜牧與獸醫(yī)》2017年04期
【摘要】:旨在分析河北小尾寒羊線粒體基因組變異和遺傳多樣性,采用線粒體基因組測序方法獲得線粒體基因組序列,進(jìn)行編碼區(qū)變異分析;利用群體遺傳學(xué)方法對非編碼區(qū)進(jìn)行遺傳多樣性分析。結(jié)果表明:河北小尾寒羊線粒體基因組編碼區(qū)共發(fā)現(xiàn)183個變異位點(diǎn),其中多肽編碼區(qū)156個,r RNA基因19個和t RNA基因8個;多肽編碼區(qū)發(fā)現(xiàn)同義突變128個,錯義突變28個。非編碼區(qū)共發(fā)現(xiàn)81個變異位點(diǎn),核苷酸多樣性為(0.022 22±0.006 93),單倍型多樣性為(0.996±0.015),83只個體構(gòu)成的65種單倍型,聚為3個單倍型群:A單倍型群包括35只個體,其中9只河北小尾寒羊,26只山東小尾寒羊;B單倍型群包括38只個體,其中13只河北小尾寒羊,25只山東小尾寒羊;C單倍型群為10只山東小尾寒羊,該單倍型群為一個獨(dú)立類群。3個單倍型群A、B和C的頻率分別為0.42、0.46和0.12。由此說明河北小尾寒羊遺傳多樣性較為豐富,與山東小尾寒羊存在基因交流。
[Abstract]:In order to analyze the mitochondrial genome variation and genetic diversity of Hebei small tail Han sheep, the mitochondrial genome sequence was obtained by mitochondrial genome sequencing, and the variation of coding region was analyzed. The genetic diversity of non-coding region was analyzed by population genetics method. The results showed that there were 183 mutation sites in the mitochondrial genome coding region of Hebei small tail Han sheep, including 156 polypeptide coding regions, 19 rRNA genes and 8 t-RNA genes, 128 synonymous mutations and 28 missense mutations in the polypeptide coding region. A total of 81 mutation sites were found in the non-coding region. The nucleotide diversity was 0.022 鹵0.006 ~ (3), and the haplotype diversity was 0.996 鹵0.015. 65 haplotypes were found. The haplotypes were divided into 3 haplotypes: a haplotype group consisted of 35 individuals. Among them, 9 Hebei small tail Han sheep, 26 Shandong small tail Han sheep B haplotype group, including 38 individuals, 13 Hebei small tail Han sheep, 25 Shandong small tail Han sheep C haplotype group, 10 Shandong small tail Han sheep. This haplotype group is an independent group, and the frequencies of the three haplotypes are 0.42 0.46 and 0.12, respectively. The genetic diversity of Hebei small tail Han sheep is abundant, and there is gene exchange between Hebei small tail Han sheep and Shandong small tail Han sheep.
【作者單位】: 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科技學(xué)院;河北省畜牧獸醫(yī)研究所;河北省阜平縣畜牧水產(chǎn)局;
【基金】:河北省科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(15226308D)
【分類號】:S826
【參考文獻(xiàn)】
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