本文選題：豬 + LIF基因��； 參考：《安徽農(nóng)業(yè)大學》2015年碩士論文

【摘要】：本研究以安徽省優(yōu)良地方豬種(安慶六白豬、圩豬和皖南黑豬)和外來瘦肉型豬種大白豬為試驗材料,研究動物胚胎附植相關候選基因白血病抑制因子基因(leukemia inhibitory factor,LIF)的單鏈核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymerphisms,SNPs)檢測及其與繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的相關性。根據(jù)NCBI中公布的豬LIF(登錄號:AJ296176)基因外顯子序列設計引物,采用PCR-SSCP、PCR-RFLP和PCR產(chǎn)物雙向測序技術檢測LIF基因第2、3外顯子部分片段的遺傳變異,篩查SNPs并分析其多態(tài)性,運用SPSS程序22.0 GLM模型分析遺傳變異與繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的相關性,以探討利用該基因作為分子標記改良母豬產(chǎn)仔性狀的可行性,為安徽地方豬種繁殖性狀的遺傳改良提供科學根據(jù)。試驗結(jié)果如下:(1)LIF基因外顯子2擴增片段在安慶六白豬群體發(fā)現(xiàn)1個SNP,為LIFg.C5709T;外顯子3擴增片段在安慶六白豬、圩豬和大白豬群體發(fā)現(xiàn)1個SNP,為LIFg.C6646T、在圩豬和大白豬群體發(fā)現(xiàn)1個SNP,為LIFg.C6988T。(2)群體遺傳學分析結(jié)果表明:LIFg.C5709T在安慶六白豬群體中只檢測到2種基因型(CC、CT),其中CC和CT基因型頻率分別為70.71%、29.29%,該位點在安慶六白豬群體的多態(tài)信息含量(PIC)為0.2188,處于低度多態(tài),卡方適合性檢驗p值大于0.05,處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài);LIFg.C6646T在安慶六白豬、圩豬和大白豬群體中均檢測到3種基因型(AA、AB和BB),其中AA基因型頻率在3個群體中分別為47.47%、57.14%和50.62%,AB基因型頻率分別為42.42%、35.16%、35.80%,BB基因型頻率分別為10.11%、7.70%、13.58%,該位點在3個群體的多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.3377、0.3064、0.3383,在該位點均處于中度多態(tài),卡方適合性檢驗p值均大于0.05,處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài);LIFg.C6988T在圩豬和大白豬群體中均檢測到3種基因型(DD、DE和EE),其中DD基因型頻率在這2個群體中分別為45.05%、45.91%,DE基因型頻率分別為32.97%、39.51%,EE基因型頻率分別為21.98%、13.58%,該位點在圩豬和大白豬群體的多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.3613、0.3457,均處于中度多態(tài),卡方適合性檢驗p值均大于0.05,處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。(3)LIF基因突變位點與繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的相關性分析:LIFg.C5709T位點:基因型對安慶六白豬初產(chǎn)母豬和經(jīng)產(chǎn)母豬總產(chǎn)仔數(shù)(TNB)和產(chǎn)活仔數(shù)(NBA)均無顯著影響,但均存在CC型高于CT型的趨勢。LIFg.C6646T位點:安慶六白豬初、經(jīng)產(chǎn)母豬群體BB基因型的TBA和NBA均極顯著高于AB和AA基因型(P0.01),初產(chǎn)母豬群體AB基因型極顯著高于AA基因型(P0.01)。大白豬群體初產(chǎn)母豬AA基因型的TNB和NBA均極顯著高于AB和BB基因型(P0.01);經(jīng)產(chǎn)母豬AA基因型TNB顯著高于AB基因型(P0.05),AA基因型NBA極顯著高于AB基因型(P0.01)。LIFg.C6988T位點:圩豬初、經(jīng)產(chǎn)母豬群體DD基因型TNB和NBA極顯著高于DE和EE基因型(P0.01)。大白豬初產(chǎn)母豬群體DD基因型TNB和NBA極顯著高于DE和EE基因型(P0.01);經(jīng)產(chǎn)母豬DD基因型TNB極顯著高于DE和EE基因(P0.01),DD基因型NBA極顯著高于DE和EE基因型(P0.01),DE基因型NBA顯著高于EE基因型。研究結(jié)果提示,LIFg.C6646T位點可以作為安慶六白豬、大白豬繁殖母豬產(chǎn)仔性狀候選遺傳標記,LIFg.C6988T位點可以作為圩豬、大白豬繁殖母豬產(chǎn)仔性狀候選遺傳標記,以應用于繁殖母豬產(chǎn)仔性狀的改良。
[Abstract]:In this study , we studied the genetic variation of exon 2 , 3 exon of LIF gene by using PCR - SSCP , PCR - RFLP and PCR product two - way sequencing technique to detect the genetic variation of exon 2 , 3 exon of LIF gene by PCR - SSCP , PCR - RFLP and PCR product two - way sequencing . ( 2 ) The results of population genetics showed that LIFG . C5709T detected only two genotypes ( CC , CT ) in the population of 6 White pigs . The frequencies of genotype and genotype of genotype were 45.05 % , 35.16 % , 35.80 % , respectively . The frequencies of genotype BB were 10.11 % , 35.16 % , 35.80 % , respectively . The frequencies of genotype BB were 10.11 % , 39.51 % and 13.58 % , respectively . The frequencies of genotype BB were 0.3613 and 0.3457 , respectively . The results showed that the genotype of DD genotype TNB and NBA were significantly higher than those of genotype AB and EE ( P0.01 ) . The genotype of DD genotype TNB and NBA were significantly higher than those of genotype AB and EE ( P0.01 ) . The results suggested that the genotype of DD genotype TNB and NBA were significantly higher than those of genotype AB and EE ( P0.01 ) .
【學位授予單位】：安徽農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2015
【分類號】：S828

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本文編號：1999099