本文選題：表達譜芯片 + 轉錄組差異��； 參考：《中國農業(yè)科學》2017年14期

【摘要】：【目的】肌纖維類型的差異是直接影響肌肉生長發(fā)育和肉品質的重要因素,紅肌纖維比例高的肌肉肉品質要顯著優(yōu)于白肌纖維比例高的肌肉,然而,目前對于雞骨骼肌纖維類型形成及轉換的分子調控機制尚不明確。本究以中國優(yōu)良的地方品種清遠麻雞為研究對象,首次對其骨骼肌中不同類型肌肉的轉錄組差異進行了研究,以期挖掘在雞肌纖維生成和類型轉換中發(fā)揮調控作用的關鍵因子。【方法】采用Agilent雞全基因組表達譜芯片對清遠麻雞骨骼肌表型差異較大的比目魚肌和趾長伸肌中與肌纖維類型組成和轉換相關的候選基因進行系統篩查,采用熒光定量PCR對芯片篩選出的差異表達基因進行驗證,采用慢病毒質粒包裝系統構建特異靶向雞PPARGC1A基因的RNA干擾慢病毒載體進行基因功能研究�！窘Y果】芯片結果共發(fā)現差異倍數在2倍及以上的基因1 224個(P0.05,FC≥2),以趾長伸肌作為參照,比目魚肌中上調基因為654個,下調基因為570個,盡管芯片和熒光定量PCR兩種方法得出的差異倍數并不完全一致,但所選基因的表達趨勢是一致的,表明芯片結果是可靠的。對差異表達基因進行GO(GO ontology)功能分類,共發(fā)現了74個顯著性GO,主要分為生物學過程、分子功能和細胞組分等3大類�；贙EGG Pathway分析發(fā)現,一些已知的與肌纖維類型轉換、肌肉發(fā)育以及脂質代謝相關的信號通路在兩種類型的肌肉中被顯著富集。綜合差異基因的GO、KEGG Pathway和共表達網絡分析,推測PRKAG3,ATP2A2以及PPARGC1A可能是與肌纖維類型性狀緊密關聯的關鍵基因。進一步對PPARGC1A基因進行功能研究發(fā)現,PPARGC1A基因的敲低,引起了PPP3CA,MEF2C以及SM等慢肌纖維標志基因以及與肌纖維發(fā)育與轉換相關基因表達水平的顯著降低,而快肌纖維標志基因FWM的表達水平則顯著上升�！窘Y論】揭示了雞紅肌和白肌兩種不同類型肌肉間的轉錄組差異,證明了PPARGC1A基因能夠與鈣離子信號通路相關基因協同從而在雞肌纖維類型組成和轉換中發(fā)揮著重要作用,從而為中國地方雞肉品質性狀的遺傳改良提供一定的理論依據。
[Abstract]:In this paper , we have found that the expression of PPARGC1A gene is more than 2 times and more than that of muscle fiber .
【作者單位】： 江蘇省家禽科學研究所江蘇省家禽遺傳育種重點實驗室;
【基金】：國家自然科學基金(31301967,31572358) 現代農業(yè)產業(yè)技術體系建設專項資金(CARS-42-G03) 江蘇省重點研發(fā)計劃(現代農業(yè))(BE2015344) 江蘇省農業(yè)自主創(chuàng)新資金(CX(15)1009) 江蘇省自然科學基金(BK20161322) 江蘇現代農業(yè)(肉雞)產業(yè)技術體系集成創(chuàng)新中心(首席專家)(SXGC[2017]254)
【分類號】：S831

【參考文獻】

相關期刊論文 前3條

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【共引文獻】

相關期刊論文 前10條

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本文編號：1968470