河南省3株馬立克病病毒Meq基因的序列分析
本文選題:馬立克病病毒 + 聚合酶鏈反應(yīng) ; 參考:《動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展》2017年12期
【摘要】:根據(jù)GenBank收錄的馬立克病病毒(MDV)基因組序列的Meq基因設(shè)計(jì)1對(duì)特異性引物,用PCR方法從河南發(fā)病雞群中檢測(cè)出了3株MDV,將目的片段克隆,并進(jìn)行測(cè)序,獲得Meq基因全長(zhǎng)序列,將3株MDV的Meq基因與GenBank上收錄的不同類(lèi)型毒株進(jìn)行比較分析。3株MDV的Meq基因段長(zhǎng)度均為1 020bp,核苷酸序列分析表明,河南株Meq基因與其他MDV核苷酸同源性為98.6%,氨基酸同源性為96.5%;Meq基因的氨基酸序列共有9個(gè)位點(diǎn)的氨基酸存在突變;遺傳進(jìn)化分析表明這些毒株有3個(gè)分支,其中Henan 1~3株、ZC2014株(KP144356.1)、YLO40920株(DQ174459.1)、HNXZ106株(HF546099.1)和vv+MDV毒株648A(AY362725.1)位于同一個(gè)分支,vMDV GA(AF147806.1)、vvMDV RBIB(AY243332.1)位于同一個(gè)分支,mMDV CVI988(AF493555.1)和中國(guó)疫苗株814(AF493551)位于同一個(gè)分支。
[Abstract]:According to the Meq gene of Marek's disease virus (MDV) contained in GenBank, a pair of specific primers were designed. Three strains of MDV were detected by PCR method. The target fragments were cloned and sequenced, and the full-length Meq gene sequence was obtained. The length of Meq gene in MDV of 3 strains of MDV was 1 020bp. the nucleotide sequence analysis showed that the length of Meq gene was 1 020bp. The nucleotide homology and amino acid homology of Meq gene and other MDV genes of Henan strain were 98.6 and 96.5, respectively. There were 9 amino acid mutations in the amino acid sequence of the Meq gene, and the genetic evolution analysis showed that these strains had three branches. The three strains of Henan 1, ZC2014, KP144356.1HNXZ106 (HNXZ106) and VV MDV (648 AY362725.1) were located in the same branch of VMDV, GAAF147806.1vvvMDV, AY2433332.1) and the Chinese vaccine strain 8144453555.1) and the Chinese vaccine strain 81444535551, respectively.
【作者單位】: 宛西中等專(zhuān)業(yè)學(xué)校;社旗縣教師進(jìn)修學(xué)校;中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所;
【分類(lèi)號(hào)】:S852.65
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,本文編號(hào):1960535
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