烏珠穆沁羊Myostatin基因序列分析及多態(tài)性研究
本文選題:烏珠穆沁羊 + Myostatin。 參考:《內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)》2015年碩士論文
【摘要】:本研究采用自然放牧條件下(多胸椎個體)烏珠穆沁羊,從擴增烏珠穆沁羊Myostatin (MSTN)基因全序列入手,對該品種MSTN基因的序列結(jié)構(gòu)、核苷酸組成進(jìn)行了分析,并對其編碼蛋白質(zhì)進(jìn)行了預(yù)測分析,構(gòu)建該基因分子進(jìn)化樹;同時分析了烏珠穆沁羊MSTN基因部分序列的多態(tài)性。結(jié)果顯示:MSTN基因由3個外顯子和2個內(nèi)含子組成,其外顯子大小分別為373bp、374bp、381bp,內(nèi)含子大小分別為1833bp、2030bp。CDS序列全長為1128bp,由375個氨基酸組成。利用生物信息學(xué)軟件分析發(fā)現(xiàn):烏珠穆沁羊MSTN基因編碼蛋白的理論分子量約為42.8kDa, PI值為7.01,Leu的含量最高(9.9%),其次是Lys(8.3%)。烏珠穆沁羊基因編碼蛋白二級結(jié)構(gòu)以隨機卷曲結(jié)構(gòu)為主,其蛋白屬于跨膜蛋白,AA6-AA23之間為跨膜區(qū),具有一個分泌信號肽結(jié)構(gòu)。其氨基酸序列MQKLQICVYIYLFMLIVA具有TGF-β家族的特征。P6引物擴增的366bp的區(qū)域,在位于CDS序列第126bp處發(fā)生C→T的沉默突變,表現(xiàn)EE和EF兩種基因型。引物P7擴增的353bp的區(qū)域,在所檢測的范圍內(nèi)沒有發(fā)現(xiàn)多態(tài)性。P8引物擴增的349bp的區(qū)域,在位于CDS序列第909bp處有一個A→G的沉默突變,表現(xiàn)AA和AB兩種基因型。本研究為改善地方優(yōu)良品種以及利用該基因開展烏珠穆沁羊分子育種技術(shù)研究等提供理論基礎(chǔ),并為建立烏珠穆沁羊基因文庫提供可靠信息。
[Abstract]:In this study, the sequence structure and nucleotide composition of Myostatin MSTN gene were analyzed by amplifying the whole sequence of Myostatin MSTN gene under natural grazing condition (individual multiple thoracic vertebrae). The coding protein was predicted and analyzed to construct the molecular evolutionary tree of the gene, and the polymorphism of some MSTN gene sequences of Wudhumuqin sheep was also analyzed. The results showed that: MSTN gene consists of three exons and two introns, the exon size is 373bpn374bpP3381bprespectively, and the intron size is 1833bp 2030bp.CDS sequence is 1128bp, which consists of 375 amino acids. The analysis of bioinformatics software showed that the theoretical molecular weight of the protein encoded by MSTN gene was about 42.8 kDa, and the Pi value of 7.01% Leu was the highest (9.9%), followed by Lys-8.3kDa. The secondary structure of the protein encoded by Uzhimuqin sheep gene is mainly random curl structure. The protein belongs to the transmembrane region between AA6-AA23 and has a secretory signal peptide structure. The amino acid sequence MQKLQICVYIYLFMLIVA had the characteristic of TGF- 尾 family. P6 primer amplified the region of 366bp. The silencing mutation of C T occurred at the 126bp of CDS sequence, showing two genotypes EE and EF. In the region of 353bp amplified by primer P7, there was no polymorphic region of 349bp amplified by P8 primer. There was a silencing mutation of A G at the 909bp of CDS sequence, showing two genotypes AA and AB. This study provides a theoretical basis for the improvement of local fine varieties and the study of molecular breeding techniques using the gene, and provides reliable information for the establishment of a gene library of Wuzhimuqin sheep.
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:S826;Q78
【參考文獻(xiàn)】
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,本文編號:1938946
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