本文選題：豬支原體肺炎(MPS) + 遺傳機制�。� 參考：《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報》2017年03期

【摘要】：豬支原體肺炎(mycoplasmal pneumonia of swine,MPS)是養(yǎng)豬(Sus scrofa)生產(chǎn)實踐中一種常見的慢性呼吸道傳染病。該病由于易感染且難治愈,繼發(fā)感染后容易致死,一直給國內(nèi)外養(yǎng)豬業(yè)造成較大的經(jīng)濟損失。目前,病理診斷、疫苗與抗生素藥物研發(fā)等方面的研究往往難以達到根除疾病的目的,亟待對豬支原體肺炎相關(guān)遺傳基礎(chǔ)進行鑒定,從分子水平上解釋其遺傳機制,進而利用遺傳規(guī)律進行抗病育種。因此,本研究通過基因本體(Gene Ontology,GO)富集分析、KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)通路分析和文本挖掘等生物信息學(xué)的手段對豬QTL數(shù)據(jù)庫進行檢索,從中篩選并注釋候選基因。結(jié)果表明,(1)47個相關(guān)QTL中所含的3 379個基因與豬支原體肺炎存在相關(guān)性,顯著性篩選后余36個基因;(2)GO富集分析中與MPS產(chǎn)生關(guān)聯(lián)的基因53個;(3)KEGG通路分析Asthma通路含基因16個;(4)文本挖掘的候選基因TNFα(tumor necrosis factor)、NRAMP1(natural resistance-associated macrophage protein 1)、TCRs(T-cell receptor genes)、CYP1A1(cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1)、CYP3A29(cytochrome P450 3A29v4)、SERPING1(serpin family G member 1)共6個。不計重復(fù)后最終得到104個優(yōu)化的候選基因。其中,TNF、POU5F1(POU domain,class 5,transcription factor 1)為重要的候選基因,在豬支原體肺炎感染過程中可能起關(guān)鍵作用。本研究從分子水平對豬支原體肺炎的遺傳機制進行了初探,MPS候選基因集的建立將為后續(xù)研究及疾病相關(guān)基因的鑒定工作提供參考。
[Abstract]:Mycoplasmal pneumonia of Mycoplasma suis (MPSs) is a common chronic respiratory infection in the production practice of Sus scrofa. The disease is easy to infect and difficult to cure, and it is easy to die after secondary infection, which has caused a great economic loss to pig industry at home and abroad. At present, the research on pathological diagnosis, vaccine and antibiotic drug development is often difficult to eradicate the disease. It is urgent to identify the genetic basis of mycoplasma suis pneumonia and explain its genetic mechanism at the molecular level. Then the genetic law was used for disease resistance breeding. Therefore, in this study, the porcine QTL database was searched by means of bioinformatics, such as gene ontology (Gene Ontology GOA) enrichment analysis, KEGG + Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) pathway analysis and text mining, and candidate genes were screened and annotated. The results showed that 3 379 genes contained in 47 related QTL were associated with Mycoplasma suis pneumonia. Analysis of 53 genes associated with MPS by KEGG pathway after significant screening, six candidate genes, TNF 偽 necrosis factor-nRAMP1 natural resistance-associated macrophage protein 1, receptor cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1 (CYP329cytocytochrome P450 family 1 subfamily A member 1) were extracted from the Asthma pathway containing 16 genes and 4 genes. There were six candidate genes, TNF 偽 necrosis factor, NRAMP1 natural resistance-associated macrophage protein 1, cytochrome P450 family 1 subfamily A member 1, CYP329 cytochrome P450 3A29v4, serpin family G member 1. After repetition, 104 optimized candidate genes were obtained. Among them, TNFN POU 5 F 1 factor 1 is an important candidate gene, which may play a key role in the infection of Mycoplasma suis pneumonia. In this study, the genetic mechanism of Mycoplasma suis pneumonia was studied at molecular level. The establishment of candidate gene sets of MPs will provide a reference for further research and identification of disease-related genes.
【作者單位】： 上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院;
【基金】：上海市農(nóng)委項目“基于浦東白豬的配套系選育”(滬農(nóng)科推字(2016)第1-1-4號);上海市農(nóng)委項目“上海市生豬產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)”(滬農(nóng)科產(chǎn)字(2016)第6號) “十二五”農(nóng)村領(lǐng)域國家科技計劃課題“優(yōu)異地方豬種資源收集和品種保護策略集成”(No.2015BAD03B01-02) 金華兩頭烏豬科技創(chuàng)新利用項目“金華兩頭烏豬新品系培育關(guān)鍵技術(shù)研究與示范”
【分類號】：S858.28

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4 顧玉芳;趙振華;謝磊;;豬支原體肺炎的臨床病例分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)病理學(xué)分會第十三次學(xué)術(shù)討論會和中國病理生理學(xué)會動物病理生理專業(yè)委員會第十二次學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2005年

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5 任曉敏;加強畜禽疾病防疫 迎接平安“金豬年”[N];中國特產(chǎn)報;2006年

6 馮國民;秋季養(yǎng)豬謹(jǐn)防傳染病[N];安陽日報;2009年

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4 董璐;豬支原體肺炎滅活疫苗及活疫苗佐劑研究[D];山西農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

5 程曉盈;豬支原體肺炎診斷方法及其病原P46基因原核表達的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2007年

6 解海東;豬支原體肺炎滅活疫苗水性及水包油型佐劑研制及初步免疫效果評價[D];山西農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

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本文編號：1911923