廣州地區(qū)貓泛白細胞減少癥病毒分離鑒定及全基因組遺傳分析
本文選題:貓泛白細胞減少癥病毒 + 細小病毒; 參考:《華南農業(yè)大學學報》2017年01期
【摘要】:【目的】分析廣州地區(qū)貓泛白細胞減少癥病毒(Feline panleukopenia virus,FPLV)的自然重組、跨宿主傳播以及流行變異情況!痉椒ā坎杉伤聘腥矩埛喊准毎麥p少癥病毒的貓糞便樣品進行細胞分離,并對陽性病料提取基因組DNA,PCR擴增獲得病毒的全基因組序列,并與Gen Bank中相關的參考毒株序列進行遺傳進化分析,同時對VP2基因與NS1基因的主要氨基酸位點進行差異分析。【結果】成功獲得2株貓泛白細胞減少癥病毒及其全基因組序列。遺傳進化分析顯示,廣州地區(qū)分離的貓泛白細胞減少癥病毒FPLV-GZ01、FPLV-GZ02與我國其他分離毒株FPLV-XJ01、FPLV-HRB屬同一分支,提示FPLV-GZ01、FPLV-GZ02由FPLV-XJ1進化而來;NS1基因系統(tǒng)進化樹顯示,FPLV存在與CPV-447重組的可能。主要氨基酸位點分析顯示,FPLV在VP2基因中的主要氨基酸位點上的遺傳變異比CPV保守;在NS1基因上發(fā)現FPLV-GZ01、FPLV-GZ02分別存在不同程度的氨基酸位點突變!窘Y論】廣州地區(qū)分離的貓泛白細胞減少癥病毒仍在不斷地重組進化。
[Abstract]:[objective] to analyze the natural recombination, cross-host transmission and epidemic variation of feline panleukopenia virus (Feline panleukopenia virus) in Guangzhou. [methods] Cat fecal samples suspected to be infected with cat panleukopenia virus were collected for cell isolation. The whole genome sequence of the virus was amplified by PCR from the genomic DNA-DNA extracted from the positive venereal disease material, and the genetic evolution analysis of the reference strain sequence related to Gen Bank was carried out. At the same time, the main amino acid sites of VP2 gene and NS1 gene were analyzed. [results] two strains of cat panleukopenia virus and its whole genome sequence were successfully obtained. Genetic evolution analysis showed that FPLV-GZ01FPLV-GZ02 and other isolates FPLV-XJ01FPLV-HRB belong to the same branch in Guangzhou, suggesting that FPLV-GZ01FPLV-GZ02 evolved from FPLV-XJ1 and the NS1 gene phylogenetic tree showed that FPLV might be recombined with CPV-447. The analysis of main amino acid loci showed that the genetic variation of FPLV in the main amino acid loci of VP2 gene was more conserved than that of CPV. It was found that FPLV-GZ01FPLV-GZ02 had different degree of amino acid mutation on NS1 gene. [conclusion] the panleukopenia virus isolated in Guangzhou area is still recombination and evolution.
【作者單位】: 華南農業(yè)大學獸醫(yī)學院/廣東省獸醫(yī)臨床重大疾病綜合防控重點實驗室/廣東省寵物工程技術研究中心;
【基金】:國家重點研發(fā)計劃(2016YFD0501004) 公益性行業(yè)(農業(yè))科研專項(201303042)
【分類號】:S852.65
【參考文獻】
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,本文編號:1880216
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