本文選題：B細(xì)胞表位 + 抗原表位預(yù)測(cè)��； 參考：《中國(guó)畜牧獸醫(yī)》2017年05期

【摘要】：試驗(yàn)旨在應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)綜合分析馬皰疹病毒1型(equine herpesvirus 1,EHV-1)gB糖蛋白,預(yù)測(cè)B細(xì)胞表位,篩選出具有潛在診斷價(jià)值的線性B細(xì)胞表位。將EHV-1gB糖蛋白的基因序列輸入DNAStar軟件中的Protean工作區(qū)中,經(jīng)參數(shù)綜合比較分析篩選潛在的B細(xì)胞表位,克隆、表達(dá)預(yù)測(cè)表位的基因片段,利用表達(dá)的融合蛋白作為抗原與馬皰疹病毒陽(yáng)性血清反應(yīng)。經(jīng)預(yù)測(cè)分析,gB糖蛋白的B細(xì)胞表位可能位于第6—10、23—32、53—65、72—98、111—120、152—166和173—180位氨基酸區(qū)域。本試驗(yàn)成功構(gòu)建并原核表達(dá)含7個(gè)潛在B細(xì)胞表位的融合蛋白。Western blotting試驗(yàn)結(jié)果顯示,其中5個(gè)融合蛋白能被馬皰疹病毒陽(yáng)性血清識(shí)別。本試驗(yàn)利用生物信息學(xué)技術(shù)結(jié)合分子生物學(xué)技術(shù)成功篩選到5個(gè)潛在的B細(xì)胞表位,為EHV-1表位診斷、表位疫苗抗原的設(shè)計(jì)奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。
[Abstract]:The purpose of the experiment was to comprehensively analyze the EHV-1gB glycoprotein of equine herpesvirus 1 by using bioinformatics technique, to predict the B cell epitopes and to screen the linear B cell epitopes with potential diagnostic value. The gene sequence of EHV-1gB glycoprotein was input into the Protean workspace of DNAStar software. The potential B cell epitopes were screened, cloned, and the predicted epitope gene fragments were expressed by comprehensive analysis of parameters. The expressed fusion protein was used as antigen to react with equine herpesvirus positive serum. It is predicted that the B cell epitopes of G B glycoprotein may be located in the amino acid regions of the 6-10m23 ~ 32N _ 53-65N _ 72-98111-120152-166 and 173-180 amino acids. The results of Western blotting assay showed that five of the fusion proteins could be recognized by equine herpesvirus positive serum. In this study, five potential B cell epitopes were successfully screened by bioinformatics and molecular biology, which laid a technical foundation for the diagnosis of EHV-1 epitopes and the design of epitope vaccine antigens.
【作者單位】： 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2012BAD46B04-03)
【分類號(hào)】：S852.652

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本文編號(hào)：1877775