一株金黃色葡萄球菌小菌落突變株全基因組測(cè)序分析
本文選題:金葡菌小菌落突變株 + 基因序列差異 ; 參考:《動(dòng)物醫(yī)學(xué)進(jìn)展》2017年05期
【摘要】:對(duì)金黃色葡萄球菌小菌落突變株(small colony mutant strains Staphylococcus aureus,SASCVs)和CP000253.1基因組差異進(jìn)行了研究,為后續(xù)研究金葡菌分泌抗藥物相關(guān)物質(zhì)能力提供數(shù)據(jù)支持。對(duì)一株金葡菌小菌落突變株進(jìn)行全基因組測(cè)序,并與CP000253.1參考序列進(jìn)行序列比較。結(jié)果顯示,金葡菌SCVs的文庫(kù)插入片段為350bp,測(cè)序讀長(zhǎng)為150bp,SCVs的原始數(shù)據(jù)量為551 Mb,SCVs的堿基含量分布在處理前后有所不同,通過(guò)重測(cè)序,存在單核苷酸多態(tài)性(SNP)的數(shù)量較大。金葡菌SCVs與CP000253.1參考序列之間存在明顯的序列差異,該數(shù)據(jù)為研究金葡菌感染奶牛乳房炎提供了一定的序列依據(jù)。
[Abstract]:The genomic differences between small colony mutant strains Staphylococcus aureus, SASCVs and CP000253.1 were studied in order to provide data support for the subsequent study of the ability of Staphylococcus aureus to secrete anti drug related substances. The results showed that the inserted fragment of Staphylococcus aureus SCVs was 350bp, the sequence reading length was 150bp, the original data of SCVs was 551 Mb, the base content distribution of SCVs was different before and after treatment. By re sequencing, the number of single nucleotide polymorphisms (SNP) was larger. Staphylococcus aureus SCVs and CP000253.1 reference sequence There was obvious sequence difference between the two data, which provided a series of evidence for studying Staphylococcus aureus infection in dairy cow mastitis.
【作者單位】: 云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31260629)
【分類號(hào)】:S852.611
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,本文編號(hào):1874833
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