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從江香豬LPL基因克

發(fā)布時間:2018-05-08 23:11

  本文選題:從江香豬 + 脂蛋白脂酶(LPL) ; 參考:《農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學報》2017年04期


【摘要】:脂蛋白脂酶(lipoprotein lipase,LPL)具有調(diào)控動物機體脂肪沉積的功能,但在小型地方豬種中LPL基因分子遺傳機制研究鮮有報道。為探究LPL基因調(diào)控功能,揭示其對從江香豬(Sus scrofa)肉質(zhì)性狀的影響,本研究以從江香豬為實驗動物,利用RT-PCR技術(shù)克隆從江香豬LPL基因CDS區(qū)(Gen Bank No.1994531),生物信息學軟件預測蛋白理化性質(zhì)及結(jié)構(gòu)特征,通過限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈反應(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技術(shù)對從江香豬LPL基因第5內(nèi)含子AfaⅠ位點進行遺傳效應分析,運用q RT-PCR技術(shù)分析不同月齡階段從江香豬背最長肌組織中LPL mRNA表達發(fā)育規(guī)律,并研究其與肌內(nèi)脂肪(intramuscular fat,IMF)含量相關(guān)性。結(jié)果表明,從江香豬LPL基因CDS區(qū)全序列長1 437 bp,共編碼478個氨基酸,構(gòu)成具有PLAT/LH2結(jié)構(gòu)域的穩(wěn)定親水性蛋白。不同品種豬間氨基酸序列的同源性很高,其中從江香豬與挪威長白豬和陸川豬氨基酸序列的同源性高達99.8%,與貴州白香豬同源性最低,為99.2%。PCR-RFLP分析結(jié)果顯示,AfaⅠ位點共檢測到CC、CG和GG 3種基因型,其中CG為優(yōu)勢基因型,等位基因C和G的頻率分別為35.05%和64.95%,從江香豬群體在此位點處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài);CC基因型的皮厚顯著高于CG型(P0.05),但背膘厚、眼肌面積和肌內(nèi)脂肪含量與其他基因型個體間差異不顯著(P0.05)。時序表達譜顯示,不同月齡階段從江香豬背最長肌組織中LPL mRNA表達水平呈現(xiàn)出先降低后升高的趨勢,LPL mRNA表達量與IMF呈顯著正相關(guān)(P0.05)。結(jié)果表明,LPL基因可作為影響從江香豬脂肪沉積的關(guān)鍵候選基因之一,實驗結(jié)果可為從江香豬LPL基因結(jié)構(gòu)功能的后續(xù)研究提供理論依據(jù)。
[Abstract]:Lipoprotein lipase lipase has the function of regulating fat deposition in animal body, but there are few reports on the molecular genetic mechanism of LPL gene in small local pig breeds. In order to investigate the regulatory function of LPL gene and reveal its effect on meat quality traits of Congjiang Xiang Sus scrofa, Congjiang Xiang pig was used as experimental animal in this study. Gen No. 1994531 was cloned from the CDS region of Congjiang Xiang pig LPL gene by RT-PCR technique. The bioinformatics software was used to predict the physicochemical properties and structural characteristics of the protein. Restriction fragment length polymorphism polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism RFLP was used to analyze the genetic effect of Afa I locus in intron 5 of LPL gene in Congjiang Xiang pig. Q RT-PCR technique was used to analyze the expression and development of LPL mRNA in the longissimus dorsi muscle tissues of Congjiang Xiang pigs at different ages, and the correlation between LPL mRNA expression and intramuscular fat content was studied. The results showed that the complete CDS region of Congjiang Xiang pig LPL gene was 1 437 BP long, encoding 478 amino acids, and a stable hydrophilic protein with PLAT/LH2 domain was constructed. The homology of amino acid sequence among different breeds of pigs was very high. The amino acid sequence of Congjiang Xiang pig was 99.8 with Norway Landrace pig and Luchuan pig, and the lowest homology with Guizhou white Xiang pig. The results of 99.2%.PCR-RFLP analysis showed that there were three genotypes of CCG and GG, among which CG was the dominant genotype. The frequencies of alleles C and G were 35.05% and 64.95%, respectively. The skin thickness of CC genotype was significantly higher than that of CG-type P0.05, but the backfat thickness was significantly higher than that of CG-type P0.05G. There was no significant difference in eye muscle area and intramuscular fat content among individuals with other genotypes (P 0.05). The expression of LPL mRNA in the longissimus dorsi muscle of Conjiangxiang pig showed a tendency of decreasing at first and then increasing. The expression of LPL mRNA was positively correlated with IMF (P 0.05). The results showed that the LPL gene could be used as one of the key candidate genes affecting fat deposition in Congjiang Xiang pig, and the results could provide theoretical basis for further study on the structure and function of LPL gene in Congjiang Xiang pig.
【作者單位】: 貴州大學高原山地動物遺傳育種與繁殖省部共建教育部重點實驗室/貴州省動物遺傳育種與繁殖重點實驗室;貴州省畜牧獸醫(yī)研究所;
【基金】:貴州大學引進人才科研項目(貴大人基合字[2013]21號) 貴州省科研機構(gòu)服務(wù)企業(yè)行動計劃項目(黔科合服企[2015]4003號) 貴州省工程中心建設(shè)項目(黔科合農(nóng)C字[2011]4022號)
【分類號】:S828

【參考文獻】

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【二級參考文獻】

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本文編號:1863494

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