本文選題：復合抗菌肽 + 川中黑山羊��； 參考：《農業(yè)生物技術學報》2017年10期

【摘要】：抗菌肽(antimicrobial peptide,AMP)作為新興的飼料添加劑,在反芻動物中的應用鮮有報道,本實驗應用高通量測序技術研究復合抗菌肽對山羊(Capra hircus)瘤胃纖毛蟲(Ciliata)種群結構的影響。選取12只雄性4月齡川中黑山羊,隨機分成4組,每組各3頭。正常精料組(A),正常精料抗菌肽組(C),雙倍精料組(D),雙倍精料抗菌肽組(E)分別飼喂精料300、300、600和600 g/d,C和E組在精料中添加3 g/kg復合抗菌肽,正常飼喂20 d后采集瘤胃液樣品,提取樣品總DNA后,擴增真核生物18S rRNA V4區(qū),擴增產物使用Illumina MiSeq平臺測序。結果表明,1)共獲得高質量序列471 580條,聚類后共得到1 398個運算分類單位(OTU)。2)所得OTU經物種注釋99.17%被歸類為真核生物界,門水平上,A組和C組相對豐度最高的為纖毛門(Ciliophora)(A:46.0%;C:48.2%),其次為分類位置未知(incertae sedis)(A:35.5%;C:42.83%),D組與E組相對豐度最高的為分類位置未知(D:49.93%;E:60.27%),其次為纖毛門(D:45.33%;E:35.23%);組間無顯著差異。3)屬水平分類上,共發(fā)現9個纖毛蟲種屬,A組與D組相對豐度最高的纖毛蟲種屬為多加多泡雙毛屬;另外,C組頭毛屬占總纖毛蟲比例顯著高于A組(P0.05),E組頭毛屬與D組無顯著差異(P0.05),C組內毛屬顯著低于A組(P0.05),而E組內毛屬與D組無顯著差異(P0.05),E組多甲多泡雙毛屬顯著高于C組(P0.05),而頭毛屬顯著低于C組(P0.05)。5)各組在alpha多樣性趙氏Chao、艾斯ACE、香濃Shannon和辛普森Simpson指數上差異不顯著(P0.05)。本實驗結果表明,幼齡川中黑山羊瘤胃纖毛蟲相對豐度最高的種屬為多加多泡雙毛屬;復合抗菌肽可提高頭毛屬含量,降低內毛屬含量,且在正常精料中較為顯著。精料飼喂量從300 g/d改變?yōu)?00 g/d時纖毛蟲種群結構無顯著變化;另外,瘤胃內真核生物多樣性不受本實驗下復合抗菌肽及精料量的影響。本研究結果為復合抗菌肽應用于反芻動物生產中提供理論依據。
[Abstract]:As a new feed additive, antimicrobial peptide (AMP) was rarely reported in ruminants. The effects of antimicrobial peptides on the population structure of Capra hircusi Ciliata were studied by high-throughput sequencing technique. Twelve male 4-month-old Sichuan black goats were randomly divided into 4 groups with 3 goats in each group. The normal concentrate group, the normal concentrate antimicrobial peptide group, the double concentrate group and the double concentration group were fed with 300300600 and 600g / d ~ (-1) C and E respectively. The samples of rumen juice were collected after 20 days of normal feeding, respectively, in which 3 g/kg compound antimicrobial peptides were added to the concentrate. After total DNA was extracted, the 18 s rRNA V4 region of eukaryote was amplified. The amplified products were sequenced using Illumina MiSeq platform. The results showed that a total of 471,580 high quality sequences were obtained, and 1,398 operational taxonomic units (OTU. 2) were classified as eukaryotes in 99.17% of the species notes. At the gate level, the highest relative abundance of group A and group C was Ciliophora ciliophora C46.0and C48.2, followed by the unknown position of Ciliophora ciliophora, followed by the unknown position of Ciliophora certae sediscus, the highest relative abundance of group D and E was the highest relative abundance of group D and group E: 49.933.The highest relative abundance was in the group D: 49.933.The next was D45.33members of Ciliophora, followed by the group D 45.33: e: 35.23. there was no significant difference between the two groups, and the highest relative abundance was in the group D: 49.933.The next was the Ciliophora Ciliophora, followed by Ciliophora Ciliophora, D45.3330. There was no significant difference between the two groups. A total of 9 ciliates were found to have the highest relative abundance in group A and group D, and the species genus of ciliates were polycilium and polyvesicular. In addition, the percentage of cephalocilium in group C was significantly higher than that in group A and group D. There was no significant difference between group A and group D in the genus Cephalocephala, and the genus Cephalocephala in group C was significantly lower than that in group A, but there was no significant difference between group E and group D in the genus Cilium, while in group E there was no significant difference between group E and group D. There was no significant difference in the alpha diversity of Chao, Ace, Shannon and Simpson Simpson index among the three groups (P 0.05), but the genus Cephalocephala was significantly lower than that of group C (P 0.05) (P < 0.05), but there was no significant difference in the indexes of Chao, Ace, Shannon and Simpson (P 0.05). The results showed that the highest relative abundance of rumen ciliates in young Sichuan black goats was in the genus Polygonum, and the compound antimicrobial peptide could increase the content of Cephalocephala and decrease the content of Intratheca, and it was more significant in the normal concentrate. The population structure of ciliates did not change significantly from 300 g / d to 600 g / d, and the diversity of eukaryote in rumen was not affected by the amount of complex antimicrobial peptides and concentrate in this experiment. The results provide theoretical basis for the application of complex antimicrobial peptides in ruminant production.
【作者單位】： 四川農業(yè)大學動物醫(yī)學院/動物疫病與人類健康四川省重點實驗室/環(huán)境公害與動物疾病四川省高校重點實驗室;
【基金】：“長江學者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃”創(chuàng)新團隊項目(No.IRT0848) 四川農業(yè)大學雙支計劃(No.03572070)
【分類號】：S827.5

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