本文選題：山羊副流感病毒型 + miRNA��； 參考：《畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年05期

【摘要】：本研究旨在分析山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK細(xì)胞和正常MDBK細(xì)胞差異表達(dá)的miRNA,以探索miRNA在CPIV3感染過(guò)程中的作用及其調(diào)控機(jī)制。將CPIV3感染MDBK細(xì)胞,利用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)分析MDBK細(xì)胞中miRNA表達(dá)譜,并篩選差異表達(dá)的miRNA。對(duì)靶基因進(jìn)行GO注釋和KEGG富集。結(jié)果顯示,有37個(gè)miRNA顯著差異表達(dá)(P0.001),其中18個(gè)miRNA在病毒感染中上調(diào),19個(gè)miRNA在病毒感染中下調(diào)。經(jīng)RT-qPCR方法驗(yàn)證5個(gè)差異表達(dá)的候選miRNA,結(jié)果與高通量測(cè)序分析有很好的一致性。進(jìn)一步GO功能注釋表明:差異表達(dá)的miRNA靶基因生物學(xué)功能相對(duì)集中在免疫調(diào)節(jié)、細(xì)胞生物調(diào)控及細(xì)胞新陳代謝等生物過(guò)程。這些靶基因參與多種細(xì)胞的信號(hào)通路,包括細(xì)胞黏附分子、B細(xì)胞受體信號(hào)通路、MAPK信號(hào)通路、代謝通路、黏合斑、鈣離子信號(hào)通路和趨化因子信號(hào)通路等。本研究為進(jìn)一步探討CPIV3致病機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:The purpose of this study was to analyze the differential expression of miRNAs in MDBK cells and normal MDBK cells infected by goat parainfluenza virus type 3 (CPIV3) in order to explore the role of miRNA in the process of CPIV3 infection and its regulatory mechanism. High throughput sequencing technique was used to detect and analyze the miRNA expression profile of MDBK cells infected with CPIV3 and to screen differentially expressed miRNAs. The target gene was annotated by go and enriched with KEGG. The results showed that there were 37 miRNA differentially expressed p0.001, of which 18 miRNA were up-regulated and 19 miRNA down-regulated in viral infection. Five differentially expressed candidate miRNAs were verified by RT-qPCR method, and the results were in good agreement with high throughput sequencing analysis. Further go functional annotations showed that the biological functions of differentially expressed miRNA target genes were relatively concentrated in biological processes such as immunomodulation, cellular biological regulation and cell metabolism. These target genes are involved in many cell signaling pathways, including cell adhesion molecule B cell receptor signaling pathway, MAPK signal pathway, metabolic pathway, adhesion plaque, calcium signal pathway and chemokine signaling pathway. This study laid a foundation for further study of the pathogenesis of CPIV3.
【作者單位】： 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院獸醫(yī)研究所農(nóng)業(yè)部獸用生物制品工程技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新資金項(xiàng)目[CX(15)1061] 國(guó)家自然科學(xué)基金(31402180) 十三五國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0500908)
【分類(lèi)號(hào)】：S852.654

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本文編號(hào)：1804171