本文選題：豬流行性腹瀉病毒 + M基因�。� 參考：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年09期

【摘要】：為更好地了解近年來中國暴發(fā)的豬流行性腹瀉(porcine epidemic diarrhea,PED)疫情,本研究采集榮昌及其周邊地區(qū)疑似患有PED的豬小腸上皮組織進行RNA的提取,擴增豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)M基因序列,進行序列分析及M蛋白分子特性研究。結果顯示,M基因開放閱讀框(ORF)長為681bp,編碼226個氨基酸。通過DNAMAN軟件及系統(tǒng)進化樹分析發(fā)現,本試驗中PEDV與GenBank中參考毒株的M基因氨基酸同源性在96.0%以上,其中與廣東毒株CH/SD-M/2012株親緣關系最為相近,同源性高達96.9%,表明M基因相對比較保守。通過M蛋白同源建模及功能預測發(fā)現,M蛋白晶體模型同SARS冠狀病毒nsp14-nsp10復合體5c8s.1.A及NAD激酶Ⅰ2i1w.1.B模型序列相似性為27.69%、15.07%;其高級結構中在第110—113、118—125、132—136、140—145、147—152、154—157、160—173位氨基酸處存在7個α螺旋,在第98—100、102—107、135—137、139—145、149—154氨基酸存在5個鋅指結構配體,M蛋白為PEDV病毒基因組復制酶的多聚蛋白。
[Abstract]:In order to better understand the epidemic situation of porcine epidemic diarrhea ( PED ) in recent years in China , this study collected the RNA from porcine small intestine epithelial tissues suspected of having PED in Rongchang and its surrounding area , amplified porcine epidemic diarrhea virus ( PEDV ) M gene sequence , sequenced and analyzed the molecular characteristics of M protein .

【作者單位】： 西南大學動物科學學院;
【基金】：西南大學榮昌校區(qū)青年基金項目(RC20700421、RC20700925)
【分類號】：S852.651

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本文編號：1790700