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新型鴨呼腸孤病毒DRV-XX株全基因組序列測(cè)定及分析

發(fā)布時(shí)間:2018-04-23 04:22

  本文選題:新型呼腸孤病毒廣東新興(DRV-XX)株 + 全基因組序列 ; 參考:《中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào)》2017年01期


【摘要】:本研究自廣東省新興地區(qū)疑似新型鴨呼腸孤病料樣品中分離出一株病毒,命名為DRV-XX株。利用RT-PCR方法對(duì)DRV-XX株進(jìn)行全基因組序列擴(kuò)增,拼接獲得其全基因組(23 419 bp),對(duì)其10個(gè)基因節(jié)段進(jìn)行分析顯示,該分離株與禽呼腸孤病毒(ARV)及番鴨呼腸孤病毒(MDRV)的相似性較低,而與國(guó)內(nèi)新型鴨呼腸孤病毒(New-type duck reovirus,NDRV)相似性較高(99%),表明該分離株為NDRV。對(duì)其10個(gè)RNA節(jié)段分別進(jìn)行測(cè)序及遺傳進(jìn)化分析,其中S3基因序列分析顯示,DRV-XX與MDRV共同構(gòu)成一主干支,與其S1、S2、S4、M1、M3、L1基因的一致;而M2基因進(jìn)化樹(shù)顯示,DRV-XX與ARV處于同一主干支;由L2、L3組基因分析顯示,DRV-XX與ARV在同一主干支,并有MDRV參與其中,而另一主干支為MDRV。因此,推測(cè)DRV-XX株的不同基因組節(jié)段來(lái)源不同,可能是ARV和MDRV發(fā)生同義突變,也可能是基因重組的結(jié)果。該研究豐富了NDRV的基因庫(kù)相關(guān)信息,也為廣東地區(qū)NDRV的防制提供一定參考依據(jù)。
[Abstract]:In this study , a virus was isolated from the samples of suspected new duck reovirus ( MDRV ) in emerging areas of Guangdong Province . The whole genome ( 23 419 bp ) was amplified by RT - PCR .

【作者單位】: 佛山科學(xué)技術(shù)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;湖南博醫(yī)翻譯咨詢有限公司;
【基金】:基金項(xiàng)目:廣東省家禽重大傳染病控制技術(shù)研究(2012A020100001)
【分類號(hào)】:S852.65

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本文編號(hào):1790438

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